Name : Clopa_2997 (Clopa_2997) Accession : YP_007941504.1 Strain : Clostridium pasteurianum BC1 Genome accession: NC_021182 Putative virulence/resistance : Unknown Product : PTS system, glucose-specific IIBC component Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2976633 - 2978660 bp Length : 2028 bp Strand : - Note : PFAM: Phosphotransferase system, EIIC; phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1; phosphotransferase system, EIIB; TIGRFAM: PTS system, glucose-like IIB component; PTS system, glucose subfamily, IIA component; PTS system, gluco DNA sequence : ATGTTTAAAAAAGCTTTCGGTGTTTTACAACAAATTGGTAAAGCGTTAATGCTTCCAGTTGCAATCTTGCCAGCAGCAGG ATTATTACTTGCTTTTGGTACTATGTTTCAGGAAGAACAGTTTTTAAGTGCTGTACCAGCATTAAAAGTAGCTTGGTTTC AAAGTCTTGCAATTATAATGAGTCAAGCTGGAGGAATAATTTTTGATAATCTTGCAATATTATTTGCTGTTGGTGTTGCC GTAGGACTTGCTGATGGAGAAGGTGTTGCAGGACTTGCAGCAATAGTTGGTTTCTTAATAATGAACAAAACTGTTGGAGC AGTAGTGGGAATTACTCCAAATATGATTGATGCTGCCCACCCTCAATATACATCGGCTTTAGGTGTCCCAACATTACAAA TGGGTGTTTTTGGCGGTATCATAATTGGTATTATAGCTGCACAATTATATAAAAGATTCTTTAAAATTGAATTACCTTCA TATTTAGGTTTCTTTGCTGGAAAAAGATTTGTGCCAATAGTTACAGCCTTAGCTGCCATTGTTGCAGGTCTTGCACTTAC TATAATTTGGCCACCAATAGGAAGAGGATTAAATGCATTTTCACATAATATGATAGATGCTAATCCTACTATAGCGGCAT TTATATTTGGTGTCATTGAAAGAGCTTTAATACCTTTTGGATTGCATCACATATGGTATAATCCATTCTGGTATCAATTT GGGGAATATGTAAATAAATCAGGTCAACTGGTTAATGGAGATCAGAAAATATTCTTTGCACAGTTAAAGGATGGTGTACC ATTTACAGCAGGTACTTTCACAACTGGTAAGTTCCCATTTATGATGTTTGGATTGCCAGCAGCAGCACTAGCTATTTATC AGGAAGCAAAACCAGAAAAGAAGGCAATAGTTGGTGGTATTATGGCTTCAGCAGCTTTAACATCATTTTTAACTGGTATT ACAGAGCCTCTTGAATTTTCTTTCTTGTTTGTTGCTCCAGCGTTATTTGGTATTCATTGTATATTTGCTGGGCTTTCCTT TATGACAATGCAGCTTCTGCATGTTAAAATTGGTATGACTTTCTCAGGCGGTGTTATTGACTTTTTACTATTTGGAGTAA TACCTAATAGAACTGCTTGGTGGCTAGTAATACCGGTAGGATTGGTATTTGCAGTAATTTACTATTTTGGATTTAGATTT GCAATAAGAATTTGGAACCTCAAAACTCCAGGTCGTGAAGATGACACAGAAGATTCTGTTGGAGGAACTGTTGAAGGTAC CGATCTTGCCTATGGAATATTAAATGCACTTGGTGGAAAAGAAAATCTGGATAATTTAGATGCTTGTATAACTCGTTTAC GTGTAATTGTCAAAGACGTTAATAATGTTGACAAGGCTCAGCTCAAAAAATTAGGGGCAGCTGGTGTTATGGAAATTGGT AACAATATTCAAGCAATATTTGGGCCTAAATCGGACAATCTTAAAGGGCAAATAAAAGATATAATTAATGGAAAGACGCC AATTCCTACTGCAAAGGAAGAAACTTCAAAGTCAGTTGATGTAGATTTAAGTGATGTTTCTGAAATAGTTTCTCCTTTAG ATGGAAAAATAATCAGTATTACAGAAGTTCCTGATGATGTATTCTCACAGAAGATGATGGGTGATGGTTTTGCTATTGAA CCAGCTAATGGAGAAGTGGTTTCACCGGTTAATGGAACTATAACAACTCTATTTCCAACTAAACATGCTGTAGGTATAAC TGCAGAAGATGGATTAGAACTTTTAGTGCATTTTGGTATGGATACTGTTAAACTTAAAGGTGAAGGTTTTACAGCTCTTG TTAAGCAAGATGATAAAGTAAAGGCAGGGCAGACAATTTTAAAAATTGATATTGATCAGGTTAAAGACAAGGTTCCATCT ATAATTACGCCAGTAGTATTTACGAATTTACCGGAGGGTAAAAGTGTAGTAATTAGCGAAGGAACGCAAGTTAAGCGTGG ACAAAAAAATATAATAACAATTAAGTAA Protein sequence : MFKKAFGVLQQIGKALMLPVAILPAAGLLLAFGTMFQEEQFLSAVPALKVAWFQSLAIIMSQAGGIIFDNLAILFAVGVA VGLADGEGVAGLAAIVGFLIMNKTVGAVVGITPNMIDAAHPQYTSALGVPTLQMGVFGGIIIGIIAAQLYKRFFKIELPS YLGFFAGKRFVPIVTALAAIVAGLALTIIWPPIGRGLNAFSHNMIDANPTIAAFIFGVIERALIPFGLHHIWYNPFWYQF GEYVNKSGQLVNGDQKIFFAQLKDGVPFTAGTFTTGKFPFMMFGLPAAALAIYQEAKPEKKAIVGGIMASAALTSFLTGI TEPLEFSFLFVAPALFGIHCIFAGLSFMTMQLLHVKIGMTFSGGVIDFLLFGVIPNRTAWWLVIPVGLVFAVIYYFGFRF AIRIWNLKTPGREDDTEDSVGGTVEGTDLAYGILNALGGKENLDNLDACITRLRVIVKDVNNVDKAQLKKLGAAGVMEIG NNIQAIFGPKSDNLKGQIKDIINGKTPIPTAKEETSKSVDVDLSDVSEIVSPLDGKIISITEVPDDVFSQKMMGDGFAIE PANGEVVSPVNGTITTLFPTKHAVGITAEDGLELLVHFGMDTVKLKGEGFTALVKQDDKVKAGQTILKIDIDQVKDKVPS IITPVVFTNLPEGKSVVISEGTQVKRGQKNIITIK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
APECO1_2642 | YP_859416.1 | PTS system, glucose-specific IIBC component | Not tested | Not named | Protein | 4e-120 | 52 |
ef0067 | AAM75272.1 | EF0067 | Not tested | Not named | Protein | 2e-77 | 43 |