Gene Information

Name : Clopa_2997 (Clopa_2997)
Accession : YP_007941504.1
Strain : Clostridium pasteurianum BC1
Genome accession: NC_021182
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : PTS system, glucose-specific IIBC component
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2976633 - 2978660 bp
Length : 2028 bp
Strand : -
Note : PFAM: Phosphotransferase system, EIIC; phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1; phosphotransferase system, EIIB; TIGRFAM: PTS system, glucose-like IIB component; PTS system, glucose subfamily, IIA component; PTS system, gluco

DNA sequence :
ATGTTTAAAAAAGCTTTCGGTGTTTTACAACAAATTGGTAAAGCGTTAATGCTTCCAGTTGCAATCTTGCCAGCAGCAGG
ATTATTACTTGCTTTTGGTACTATGTTTCAGGAAGAACAGTTTTTAAGTGCTGTACCAGCATTAAAAGTAGCTTGGTTTC
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ATAATTACGCCAGTAGTATTTACGAATTTACCGGAGGGTAAAAGTGTAGTAATTAGCGAAGGAACGCAAGTTAAGCGTGG
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Protein sequence :
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PANGEVVSPVNGTITTLFPTKHAVGITAEDGLELLVHFGMDTVKLKGEGFTALVKQDDKVKAGQTILKIDIDQVKDKVPS
IITPVVFTNLPEGKSVVISEGTQVKRGQKNIITIK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
APECO1_2642 YP_859416.1 PTS system, glucose-specific IIBC component Not tested Not named Protein 4e-120 52
ef0067 AAM75272.1 EF0067 Not tested Not named Protein 2e-77 43