Gene Information

Name : coxA (wHa_05340)
Accession : YP_007889161.1
Strain : Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wHa
Genome accession: NC_021089
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Cytochrome c oxidase subunit 1
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 649854 - 651404 bp
Length : 1551 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAGTGACGTACCAAAGGGCATAAAGCGTTGGTTGTTTTCCACCAATCATAAAGATATAGGGACACTGTACATTATTTT
TTCCATATTAGCTGGAATTATTGGTGGATTATTATCGGTGATTATTCGCACTCAGCTAATGCACATTAATATACTTAACA
ATAACTATCAATTATATAACGTAATGGTTACAGGGCATGCGTTGATAATGGTGTTTTTTATGATAATGCCAGCCCTCATG
GGAGGATTTGGTAACTGGTTTGTACCTCTCATGATTGGCGCACCAGATATGGCGTTTCCTCGTATGAATAATTTGAGTTT
CTGGTTATTAGTGTCATCTTTTATTTTGCTCATTCTCTCAGTGTTTATTGGTGAAGGTCCAGGTACAGGTTGGACTTTAT
ATCCACCTTTATCACAGGTAATGTCCCATCCAAGTGCAGGAGTTGACATTGCTATACTTGCACTCCACGTTGCTGGTATG
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TTCTTACTGATCGCAATATTGGTACTTCCTTTTTTGATCCTGCCGGTGGCGGCGATCCTGTGTTATTTCAACATCTATTT
TGGTTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTACGTAATTATTTTTCCTGCATTTGGCATCATAAGTCAGGTTGTATCAACTTTTTC
TCACAGACCTGTATTTGGTTACATAGGGATGGTTTATGCAATGATAGGTATAGCAGTATTTGGCTTTATGGTTTGGGCTC
ACCATATGTTCACTGTTGGGCTTAGTGCTGACGCTGCTGCATTTTTTAGCACTACCACAATTTTTATCGGTGTTATAACT
GGTGTAAAAGTCTTTAGCTGGATTGCAACTATGTGGGGTGGAGCAATTGAGTTTAAGACCCCTATGCTATTTGCACTAGG
TTTTATTTTCATGTTTGTTGGCGGTGGCATAACGGGAATAATTCTTTCTCATGGTGGAATAGATAAGCTCTTGCACGACA
CCTATTATGTTGTTGCTCACTTCCATTATGTCATGTCACTTGCTGCATTATTTGGAGCTTTTGCTGGCTTTTATTATTGG
ATTGGTAAAATGTCGGGTAAACAATATAATGAGCGCTTAGGTCAAATCCACTTTTGGCTTACTTTTATTAGCACCAATAT
CACTTTTTTACCTCAACATTTCTTGGGATTAGCTGGTATGCCAAGACGTATACCTGATTATCCTGATGCGTTTATCCCTT
GGAATTATATATCCTCAATTGGCTCATATATGTCCTTTGTTTCAGTTATGTTTTTTGTGTTTATAGTTATACATCTCTTC
AAATGGGGCAAGAAAGCTGGAGATAATCCTTGGAAAGGTGACACCTTGGAATGGACGGTATCTTCACCACCGCCTTTTCA
TACTTTCGAAAAGCCACCAGTGGTAAAATAG

Protein sequence :
MSDVPKGIKRWLFSTNHKDIGTLYIIFSILAGIIGGLLSVIIRTQLMHINILNNNYQLYNVMVTGHALIMVFFMIMPALM
GGFGNWFVPLMIGAPDMAFPRMNNLSFWLLVSSFILLILSVFIGEGPGTGWTLYPPLSQVMSHPSAGVDIAILALHVAGM
SSIVGAINFIVTIFNMRAKGMSLTKMPLFVWSVLLTAFMLIVALPVLAGAITMLLTDRNIGTSFFDPAGGGDPVLFQHLF
WFFGHPEVYVIIFPAFGIISQVVSTFSHRPVFGYIGMVYAMIGIAVFGFMVWAHHMFTVGLSADAAAFFSTTTIFIGVIT
GVKVFSWIATMWGGAIEFKTPMLFALGFIFMFVGGGITGIILSHGGIDKLLHDTYYVVAHFHYVMSLAALFGAFAGFYYW
IGKMSGKQYNERLGQIHFWLTFISTNITFLPQHFLGLAGMPRRIPDYPDAFIPWNYISSIGSYMSFVSVMFFVFIVIHLF
KWGKKAGDNPWKGDTLEWTVSSPPPFHTFEKPPVVK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 1e-72 43