|
Name : clpB (MPUT9231_4460) Accession : YP_007885066.1 Strain : Mycoplasma putrefaciens Mput9231 Genome accession: NC_021083 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Chaperone protein ClpB Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 523558 - 525699 bp Length : 2142 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGAGTTTCAACAAAAAGGTACTGTTACTGATGCATTACAAAAATACACAAGAGATTTAACTAAAAATGCTAAAGACGG AAAACTTGATCCAGTTATTGGACGAGAAGAAGAAATATCAAGACTTATTCAAATATTGTCACGTAAAACCAAAAATAATC CAGTTTTAATTGGTGAACCTGGAGTTGGTAAAACAGCAGTGGTTGAAGGCTTAGCTCAACGTATTGTTAAACAAGATGTT CCGGCATTATTAAAAAATAAACGTATTTTAGAATTAGATATGGGTAGTTTAATGGCTGGAGCAATGTATATGGGTGATTA TGAATCACGTGTTAAAGCAATAGTTAATGAAATCCAAAAATCTAATGGAGAAATTATTTTATTTATTGATGAATTACACT TAATTATTGGAGCTGGCAAAACTGGAGCTGGAAGCGGAATGGATGTTTCAAATTTGTTAAAACCAGCACTTGCTAGGGGT GAACTAAGAGCAATTGGAGCAACAACTTTAAATGAATATCGTGAATATATTGAAAAAGATGCTGCTTTAGAAAGAAGGTT TCAAAAAGTTTTAGTTTCTGAACCAACTATTGATCAAACAATTTCAATTTTGCGTGGATTAAAAGAGCGTTTTGAAACTT ATCATGGAGTAAGAATTCATGATAACGCTTTAGTAGCTGCTGCAAAATTATCAAGCAGATATATTACTGACCGTTTCTTA CCAGATAAAGCAATTGATTTAGTTGATGAAGCTTCTGCATCAATTAAAACTGCTTTAGCAAGCGTTCCTGCTGAACTAGA TCAAGTTAATAGAAAAGTTATGCAATTAGAAATTGAAAAATTAGCACTAGAAAAAGAAAAAGATGACAAATCAAAAGAAA GACTACAAGAAGCTATTAAAGAACTTGAAAGTTTAAAAGTTCATCAAACTAAATTAAATGATCAATGATTAAAAGAAAAA GAATTTCTAAATAAATTAACTTCATTAAAAGCAACAATTGAAAGCTTAAAACAAGAACTAGAAATTACTCAAAATGATGG AAACTATAAAAGAGCTGGTGAAATTCAATATTCATTGCTTCCATCACTTGAAAAACAACTTGCAAGTTATGAAAGTCAAA CTCAAGAACGTATGATTTCTGAAGAAGTAACTGAAACAGATATTGCTAAAGTAGTTGCTAAAGCAACTCATATTCCAGTT GATAAATTAATATCTTCTGAAAAAGAAAAGTTATTAAATTTAGAACAGCTTTTAAAAACTCATATAAAAGGTCAAGACGA AGCTGTTAAAGCAGTTAGTGATGCAATCATGAGAAGTCGTAGTGGTATTAAAGATCCAGACAAACCAATTGGAAGTTTTC TATTTTTAGGACCAACTGGAGTTGGTAAAACTGAAGTTGCTAGAAGTCTAGCTGATATCTTATTTAATTCACCTAAAAAA ATGATCAGAATTGATATGAGTGAATATATGGAAAAACACTCAGTTGCTAAACTGATTGGTGCTCCGCCAGGTTATGTTGG TTATCAAGAAGGTGGACGTTTAACTGAAGCTGTCAGACGTAATCCTTATTCAATTATTTTGTTTGATGAAATTGAAAAAG CTCATAATGATGTGTTTAACATCTTATTACAAATTTTAGATGAAGGACGTTTAACTGATTCGCTAGGAAAAACCATTGAT TTTAAAAATACGATTATTGTTATGACTTCAAATATCGGAAGTGAACATATCCTAGCTAGCACAGATTTAGAATCAGCTAG TCAAAAAATCATCGATCAAGAACTACCAAAACAATTTAAACCAGAATTTTTAAACAGAATTGATAATATTATCTTTTTTA ATGCTTTATCAGAACATACTATCGGTGAAATTGTTGATAAAGTCTTAGATGAATTAACTAACAGATTAATCAAAGAACAA AACTATTATGTCACTATTTCTGATTTAGCTAAAGACAAGATTATTAAAGAAGGTTATGATCGACAATTTGGTGCAAGACC AATTAAAAGATATATTGAAAAAAATATTGAAACTTTACTAGCTCATGCCATTATCAGTGGGTTGATAACTGAAAATCAAA GATATATCGTTGATGTTAAAGATGATAAATTTGTATTAGACAAGCTAACAAATCTAAATTAG Protein sequence : MEFQQKGTVTDALQKYTRDLTKNAKDGKLDPVIGREEEISRLIQILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAVVEGLAQRIVKQDV PALLKNKRILELDMGSLMAGAMYMGDYESRVKAIVNEIQKSNGEIILFIDELHLIIGAGKTGAGSGMDVSNLLKPALARG ELRAIGATTLNEYREYIEKDAALERRFQKVLVSEPTIDQTISILRGLKERFETYHGVRIHDNALVAAAKLSSRYITDRFL PDKAIDLVDEASASIKTALASVPAELDQVNRKVMQLEIEKLALEKEKDDKSKERLQEAIKELESLKVHQTKLNDQWLKEK EFLNKLTSLKATIESLKQELEITQNDGNYKRAGEIQYSLLPSLEKQLASYESQTQERMISEEVTETDIAKVVAKATHIPV DKLISSEKEKLLNLEQLLKTHIKGQDEAVKAVSDAIMRSRSGIKDPDKPIGSFLFLGPTGVGKTEVARSLADILFNSPKK MIRIDMSEYMEKHSVAKLIGAPPGYVGYQEGGRLTEAVRRNPYSIILFDEIEKAHNDVFNILLQILDEGRLTDSLGKTID FKNTIIVMTSNIGSEHILASTDLESASQKIIDQELPKQFKPEFLNRIDNIIFFNALSEHTIGEIVDKVLDELTNRLIKEQ NYYVTISDLAKDKIIKEGYDRQFGARPIKRYIEKNIETLLAHAIISGLITENQRYIVDVKDDKFVLDKLTNLN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpC | YP_005163377.1 | ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit | Not tested | Not named | Protein | 7e-120 | 41 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpB | YP_007885066.1 | Chaperone protein ClpB | VFG2076 | Protein | 1e-103 | 43 |
