|
Name : MMS_A0937 (MMS_A0937) Accession : YP_007811678.1 Strain : Mycoplasma mycoides Gladysdale Genome accession: NC_021025 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.17.4.1 Position : 974995 - 977157 bp Length : 2163 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00317; match to protein family HMM PF02867; match to protein family HMM PF08343; match to protein family HMM TIGR02506 DNA sequence : ATGAACGAAAATAAAAACACAATCGTTTTAGATGATGTTGATGATGAATATATTAAATTAAATGCTAGATCTAAGATTTT TTTAAAAGATCAAGACAATTTCCAATTAGATGTTAAAGCAGCTGAATTATATTTAAAAAATTATATTGAACCTAGAATGA AAAAGTTTTCTAGTTTAAAAGAAAGACTAGATTACTTATTAGAAAATCAGTATTATGATTCAGAAATCTTAAATAAATAT AGTTTTGATCAAATTAGTCAATTAAATCATTATGCTTATTCATTTAACCATCATTTTCCAAGTTTTATGGGAGCTTTAAA ATTCTTTAATGCTTATGGATTAAAAACTTTTGATACTACAATGTATTTAGAAACTTATACAGATAGAGTATTGATGAATG CTCTATTTTTAGGTAATGGTAATTTTAATAAAGCAAAAGACTTATTAAAAGATATGATGTTAGGTAGATTTCAACCAGCA ACTCCTACTTTTTTAAATGCAGCTAAAAAGCATAGAGGAGAGTATGTTTCTTGTTATTTATTAAGAACTGAAGATAACAT GGAATCAATTTGTAGAACAATTTCAACTTCACTACAACTTTCAAAAAGAGGTGGAGGAGTTGCAATTTGTTTAACTAATT TACGTGAAACAGGTTCTCCTATTAAAAATATTTCAGGTCTAAGTTCAGGTCCAATTCCAGTTATGAAGATTTTAGAAGAT TCATTTACTTATGCTGATCAATTAGGCCAACGTCAAGGAGCTGGAGCTGTTTATATTTCAGCACATCATCCAGATATTAT TTCAGTTTTAGATACTAAAAGAGAAAATGCTGATGAAAAGATTAGGATTAAATCTTTATCATTAGGATTAGTAATTCCAG ATATTACTTTTGAATTAGCTAGAGATAATAAAGATATGGCTTTATTTAGCCCTTATGATGTTCAAAAGACATATGGTAAG CCATTATCAGATATTTCAATTACTGAAAAATATTATGAAATGTTAGAAAATCCTAATATTAAAAAAACATATATTAGTGC TAGAAAATTCTTTTTAACTGTTGCTGAACTACATTTTGAAAGTGGATATCCATATATTTTATTTGAAGACACTGTTAATA GAAGAAATGCTCATGATAAAAAGGGAAGAATTATTATGAGTAATTTATGTAGTGAAATTGTTCAAGTAAGTACAGCAAGT GAATATAATTCTGATTTATCATTTATAAAAACTGGAGAAGATATTTGTTGTAATTTAGGTAGTTTAAATATTGATAAAAT GATGAAATCAGGAAAAGAATTTTCAGATTCTATTTATAATGCAATTTCTGCTTTAGATATAGTTTCAAGAAATTCAGATT TAAGTGCATCTCCTTCAATTCAAAAAGGAAATGCTTTAAATCATGCCGTTGGATTGGGAGCTATGAATCTACATGGATTT TTAGCAATTAATAAAATTATGTATGATTCACCTGAAGCTGTTGATTTTACTAATATGTTCTTTTATACAGTTGCTTATAA TGCTTTTAAAGCTTCAAATAAATTAGCTCAAGAATTTGAAAAATTTGCTTCATTTGATCAATCAAGATTTGCTGATGGTT CTTGATTTGATAAATATACTAAGTGTGAATTTGATAAATGAACACCACAAACAAATAGAGTAAAAGAATTATTTAAAGAT TATGATGTTCAAATTCCAAGTCAAGCTGATTGAATTCAATTAGTTGAAGAAATTAAAAAAACAGGTTTAGCAAATTCACA TTTAATGGCAGTTGCTCCAACTGGATCAATTAGTTATTTATCATCATGTACTCCTTCACTACAACCAGTAGTTTCAACTG TTGAAGTTAGAAAAGAAGGAAAATTAGGAAGAGTTTATGTTCCAGCATATCAAATTAATTTTGATAATATGGGATATTAT GCAATGGGTGCTTATGAATTAGGACCAGATCCAATTATTAATATTGTTGCAGCAGCTCAGCAACATGTTGATCAAGCAAT TTCACTAACTTTATTTATGACTGATAAAGCAACAACTAGAGATTTAAACAAAGCATATGTTAATGCCTTTAAACAAGGTT GTTCTTCAATTTATTATGTAAGAATTCGTCAAGATGTTTTAGAAGATAGTGAAAACTACGAATGTGATGCATGTAAAATT TAA Protein sequence : MNENKNTIVLDDVDDEYIKLNARSKIFLKDQDNFQLDVKAAELYLKNYIEPRMKKFSSLKERLDYLLENQYYDSEILNKY SFDQISQLNHYAYSFNHHFPSFMGALKFFNAYGLKTFDTTMYLETYTDRVLMNALFLGNGNFNKAKDLLKDMMLGRFQPA TPTFLNAAKKHRGEYVSCYLLRTEDNMESICRTISTSLQLSKRGGGVAICLTNLRETGSPIKNISGLSSGPIPVMKILED SFTYADQLGQRQGAGAVYISAHHPDIISVLDTKRENADEKIRIKSLSLGLVIPDITFELARDNKDMALFSPYDVQKTYGK PLSDISITEKYYEMLENPNIKKTYISARKFFLTVAELHFESGYPYILFEDTVNRRNAHDKKGRIIMSNLCSEIVQVSTAS EYNSDLSFIKTGEDICCNLGSLNIDKMMKSGKEFSDSIYNAISALDIVSRNSDLSASPSIQKGNALNHAVGLGAMNLHGF LAINKIMYDSPEAVDFTNMFFYTVAYNAFKASNKLAQEFEKFASFDQSRFADGSWFDKYTKCEFDKWTPQTNRVKELFKD YDVQIPSQADWIQLVEEIKKTGLANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVSTVEVRKEGKLGRVYVPAYQINFDNMGYY AMGAYELGPDPIINIVAAAQQHVDQAISLTLFMTDKATTRDLNKAYVNAFKQGCSSIYYVRIRQDVLEDSENYECDACKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 3e-177 | 54 |
