|
Name : MMS_A0436 (MMS_A0436) Accession : YP_007811209.1 Strain : Mycoplasma mycoides Gladysdale Genome accession: NC_021025 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 458259 - 460067 bp Length : 1809 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF02302; match to protein family HMM PF04215 DNA sequence : ATGGAGTTTGGAAAATATGTTTTAAATTTTTTTACAGAATTTATTGGAACCCCAGCAATATTAGTAGCACTATTTGCTTT TATTGGTTCTTTATTACAAAAAAAGAAATTTACAGAAAGTTTGACTTCAACAATTAAAACAGCTATTGGGTTTTTAATTA TTGGTGGTGGAGCTGGTATTATTGCTGGGTCTATTCAAAAACTAGGTTTTGCTTTTAATTTGTTATTTCAAAGATCTGGA GCTATTGCAAATAATGATGTTTTACCAGGTCTATTTTTAAATACTTCAAAAATAGTTCTAACTGGATCACTAATTATGAT TTGTGCTATGTTTTTAAATATAGTTTTAGCCAGAATTAGTAAATTTAAATATATTTATTTAACAGGTCATGTTTTATTTT ATTTTTCAACAATGTTTGCAAGTGTAATGCATGTTGCTGGTCTAAATTTAGATGAAGTAAAAAATTTAACAACCGTAGTA ATTTCTGGAGCTTTATTAGTTTCTATTTATATGGTGTTAACCCCAGCCTTATTAAATAATCATGTTATTAGAATTACTAA AAATGATAATTTAGCACTAGGACATACTGGTTCACTTGGTTATTGATTATCAGCAATTATTGGATTAGGAATAACAAAAA TTAGTAAAAAACCATCACGTTCTACTGAAGATGTTAATTTTCCAAAAGGACTAGCATTTTTAAGAAATACTAACGTAGCT ATTGGTATAACTATGTTATTGCTTTATTTGATAATTTACTTTACTACTTTTATAGTTCATGGATATGAGCAAATGGTAGC TCATAAAATTATTGATAATGGAAAAGATGTTTTTGTACAAGGGTTATTACAATCTTTAACATTTGCAGCAGGAGTTGAAA TTGTTTTAATTGGAGTAAGAATGTTTATTGCTGAAATTATTCCATCATTTCAAGGGATTTCACAAAAAGTAGTTCCAGAT GCAAAACCAGCTTTAGATTGTCCAATTGTATTTCCTTATGCACCAAATGCAGTTCTAATTGGGTTTATTTCATCATTTAT TGGTGGAATTATAGCAATGGGGATAACAATTTTAATTGTTAATTTAAAAGGAATTAATGTAGATATTTGAATTATTATTA TTCCAAGTATTGTTCCACACTTTTTTGTTGGTGCTACTTGTGGGGTTTTTGGAAATTCAACAGGTGGTATTAAAGGAGCT GTTATTGGTTCTTTTGTTAATGGATTAATTATTTCATTTGTTCCGTTCTTATTTATTGGTTTACAATTAATTCCAAACAT TTCTAATAACAATCAACATATTGCTTGAGGAGATGGAGACTTTTTATTAGGGTTACCAATTGGAGCTTTATTAAGATTAA TTGGAGTTAAAAGTGCTATTTGAGTTTTACTAATAATTAGTATAATAAGTTGATTAATCTTACCAATTTATAGTTTTTTA ACTAAAAAAATTAATTTAGTTAAAAAACTAGATAATAATAATAAAGATGAAATTATTAATAAAGATCAAAAGCTTATATC AAAATATGATCTTAAAAAACAATATAAAATAGTTGCTGTTTGTGGTCAAGGTTTAGGTTCATCATTGCTAATTGAAATGA ATTTAAAAAATGTTATTAAAGAATTAGATTTACCAATACAAATAACACATACTAATTTAAATTCATTTGATCCAACTGAT GAAACTATATTAGCTGTAGTTTGTGGAATAGATTTGCAAAATAGTATTAACTTTGAACGTAAAATTGTTTTAGAAAATCT TTTAGATCAAGATCAAGCTAAACAAAAGATTAAGGAATTTTTAAGTTAA Protein sequence : MEFGKYVLNFFTEFIGTPAILVALFAFIGSLLQKKKFTESLTSTIKTAIGFLIIGGGAGIIAGSIQKLGFAFNLLFQRSG AIANNDVLPGLFLNTSKIVLTGSLIMICAMFLNIVLARISKFKYIYLTGHVLFYFSTMFASVMHVAGLNLDEVKNLTTVV ISGALLVSIYMVLTPALLNNHVIRITKNDNLALGHTGSLGYWLSAIIGLGITKISKKPSRSTEDVNFPKGLAFLRNTNVA IGITMLLLYLIIYFTTFIVHGYEQMVAHKIIDNGKDVFVQGLLQSLTFAAGVEIVLIGVRMFIAEIIPSFQGISQKVVPD AKPALDCPIVFPYAPNAVLIGFISSFIGGIIAMGITILIVNLKGINVDIWIIIIPSIVPHFFVGATCGVFGNSTGGIKGA VIGSFVNGLIISFVPFLFIGLQLIPNISNNNQHIAWGDGDFLLGLPIGALLRLIGVKSAIWVLLIISIISWLILPIYSFL TKKINLVKKLDNNNKDEIINKDQKLISKYDLKKQYKIVAVCGQGLGSSLLIEMNLKNVIKELDLPIQITHTNLNSFDPTD ETILAVVCGIDLQNSINFERKIVLENLLDQDQAKQKIKEFLS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 2e-51 | 42 |
| unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 2e-51 | 42 |
| vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 2e-51 | 42 |
