|
Name : tkt (MMS_A0410) Accession : YP_007811183.1 Strain : Mycoplasma mycoides Gladysdale Genome accession: NC_021025 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.2.1.1 Position : 434523 - 436493 bp Length : 1971 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00456; match to protein family HMM PF02779; match to protein family HMM PF02780; match to protein family HMM TIGR00232 DNA sequence : ATGAAAACTAGTAAAAATGATAATTTAAATGCATTACGTATATTAGGTGTAAGTGCAATTAATAAAGCAAAATCTGGTCA TCCTGGAATTGTTTTAGGAGCAGCTGGAATAGTTTATGTTTTATTTAATAAAATTATGAATTTTAATCCTAAAAATCCAG AATGATTTAATAGAGATAGATTTATTTTATCTGCTGGGCATGGTAGTGCATTACTATATTCAGCTTTACATTTATCTGGA TATGATTTATCTATTGATGATTTAAAACAATTTAGACAATGAGATAGTAAAACTCCAGGACATCCTGAAAAAACTTTAAC GTGTGGAGTTGAAGTGACAACAGGTCCACTTGGTCAAGGTGTTGGAATGGGAGTTGGAATGGCTGTTGCTGAAGCTCATC TAGCAAGTGTTTATAATAAACATGATTTTAATTTGATTCATCATTATACTTATGTTTTATGTGGTGATGGTGATTTACAA GAAGGAATTAGTCAAGAAGCTATTTCTTTTGCTGGTAAACATAGGTTAAATAAATTAATTTTAATTCATGATTCAAATGA TGTGCAATTAGATTCAAATGTAGTTGATGTACAAATTGAAGATATGCACAAACGTTTTAAAGCATGTAATTGAAATACAA TAAAAGTTAGTGATGGAGAAGATTTAAATTCAATTTATAAAGCTATTAGAAAAGCTCAACTTTCAGATAAACCAACATAT ATTGAAGTTAAAACTGTTATTGGATTAGGTTCAACAAAACAAGGAACTAAAGATGTTCACGGTGCTCCTTTAAATGATGA TATAACTAAAGTAAAAAAATATTTTGATTGAGATTATGATGATTTTATTATTCCAGATTCAGTTTATAAACACTGATCAA TTAATGCTAAAAAAGGTGAAATTAAAGAAGAATATTGAAATCAATTAAAAGCTAAATATAGTTTAAAATATCCTGAATTA AGTTCTTATTTAGATAATGCTATTAATAAAAATATTACTTTTGATTTTTCTAGTTTATTAAAAGATATACCAAATAATGA TGAAGCAACAAGATTAAGTTCAGGAAAAATCTTTGAAAAAATTGCAGATAATGAAAAAATGCTAATTGGAGGAAGTGCTG ATTTATCTAGTTCAACTAGAATTAAAGGTGCTGATAATCAATTTACTAATTTAAATAAAACTGGTAGAAATATAATGTAT GGAGTAAGAGAATTTGGAATGGGTGCAATTAATAATGGAATTGCAGCTCATAAAGGATTAATTCCAGTAGCTAGTGGGTT TTTTGTATTTGCAGATTATTTAAAACCAGCAATGAGATTAGCTTCAATTATGCAATTACAACAATTATATGTCTTTACTC ATGATTCAATTGCAGTTGGTGAAGATGGGCCAACTCACCAACCAATTGAACAACTAGCAATGTTAAGAACTATTCCAAAT CATGTTGTTTTAAGACCAGCTGATTTTAGTGAAACTATTGCTTGTTATAAAGTTGCTTTAACAAAACTAACTAAAACTCC TGCTTCAATTATTTTAACTAGACAAAATGTAAAACAACTACAACACAATGATGTTTTAAATCAAGTTGAACGTGGTGCTT ATATAATTAGTGATCAAACTGATGCAACTATTAGTTTAATTGCTAGTGGTAGTGAAGTTGGATTAGCAATTGATGTGCAA AAAGAATTATTAAATCACAATATTAAATCAAAAGTGATTTCAATGGTATCAACTAATTTATTTGATAAACAAGATAAAGA ATATCAAGATCTAATTATTAATAAAAATACTAAAAGAATTGCTATTGAAATGGGATCAAACGCAATTTGATATAAATATG TTGGTGATGATGGTTTAGTATTTGGAATTGATCGTTTTGGTGAATCAGCTCCTGCTAATAGTGTCATTAAAGAATTTGGA TTTACAAAAGAAAATCTAACAAAAAAAATATTAGAATATTTAAATAAATAG Protein sequence : MKTSKNDNLNALRILGVSAINKAKSGHPGIVLGAAGIVYVLFNKIMNFNPKNPEWFNRDRFILSAGHGSALLYSALHLSG YDLSIDDLKQFRQWDSKTPGHPEKTLTCGVEVTTGPLGQGVGMGVGMAVAEAHLASVYNKHDFNLIHHYTYVLCGDGDLQ EGISQEAISFAGKHRLNKLILIHDSNDVQLDSNVVDVQIEDMHKRFKACNWNTIKVSDGEDLNSIYKAIRKAQLSDKPTY IEVKTVIGLGSTKQGTKDVHGAPLNDDITKVKKYFDWDYDDFIIPDSVYKHWSINAKKGEIKEEYWNQLKAKYSLKYPEL SSYLDNAINKNITFDFSSLLKDIPNNDEATRLSSGKIFEKIADNEKMLIGGSADLSSSTRIKGADNQFTNLNKTGRNIMY GVREFGMGAINNGIAAHKGLIPVASGFFVFADYLKPAMRLASIMQLQQLYVFTHDSIAVGEDGPTHQPIEQLAMLRTIPN HVVLRPADFSETIACYKVALTKLTKTPASIILTRQNVKQLQHNDVLNQVERGAYIISDQTDATISLIASGSEVGLAIDVQ KELLNHNIKSKVISMVSTNLFDKQDKEYQDLIINKNTKRIAIEMGSNAIWYKYVGDDGLVFGIDRFGESAPANSVIKEFG FTKENLTKKILEYLNK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 2e-116 | 44 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 3e-117 | 43 |
