|
Name : Clst_1699 (Clst_1699) Accession : YP_007679771.1 Strain : Clostridium stercorarium DSM 8532 Genome accession: NC_020887 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transposase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1918835 - 1920106 bp Length : 1272 bp Strand : + Note : or inactivated derivative; COG:3464 Transposase and inactivated derivatives; KO:K07485 transposase DNA sequence : TTGTCTCTTAATGATTGTATAATAAATTTATTAAATTTAAAAGATGAAAATATAAAATTTGATGATAACTTTTATTCTGA AGAAACCATTGATCATGTTGAATCGAAGATGTTTCACGGTATCTTAAGCTATACCCCTGATGCTTGCTATAATTGTGGAC ATGTTATGGATAATAATATTATTAAACATGGCTTTAAAACATCTACTATCAAGATTCCTAAGGTATCTGGTTTTAATGCT TATTTAAAATTAAAGAAACAACGTTATTACTGTAAACATTGTAATTCTACCTTTACCCTTAAGACCAATATTGTTAATAA AAATTGCTATATCTCTAATAATACTAAAGTTTCTATAGCTCTTAGCGCTAAGGATAAACTATCTGAAAAGGATATTGCCA AGAATCATAATGTTTCTCACTCAACTGTAAATAGGGTGATTGATAGCTTCTATCAGCACTATAAACCTAAGTTTAACTAT CTACCTAAACATTTATGCTTTGATGAATTTAAATCAGTTAAATCAGCTGATGGGGCAATGTCCTTCATATTTTGTGATGC AGACACTGGTCAAATTGTTGATATCGTTGAAGATAGAAGATTACATGTACTTAATAATTATTTTATGAAGTACTCTAAGG CAGCTAGAAATGCTGTAAGAACTGTAGTTATTGATATGTACAGTCCCTATATCTCATTAATTAAGTCTATATTCCCAAAA GCTAAAATTATTATTGATAAGTTTCATATAATTCAATTATTTAGCAGAGCTTTAAATAAAACAAGAATAAAAATTATGAA CAAGGATAAGAAGAACTACAATAAATTTAAAAAGTATTGGAAGCTTCTCTTAAAAGATACATCATCAATTAACTATACTA CGTACAATTATCATAGATCCTTTAAGAAGCCAATGAGAGAAATAGATATCATTAACTATTTAATTGACCTAGATCCAGAG CTTAAAGCAACTTATGAGTTATATCACGATATTAGATATTGTATTAAACACAAGGATTTCTCATTATTAAATAGAACTTT ATCTAATGTAAATAACCTAATTTCCGACTATATGAAGACATCAGTTAAGACCCTACAGAAGTACATAGGTTACATAGAAA ATTCATTTATATATGACTATACAAATGGTATCTTAGAAGGCATAAACAACAAAATTAAAGTTATTAAGCGAATAGCATTT GGTTATAGAAGCTTTTATCATTTTAGAAATAGGATACTCATTACACAAAACTTAGCAACATTAAAGGCTTAG Protein sequence : MSLNDCIINLLNLKDENIKFDDNFYSEETIDHVESKMFHGILSYTPDACYNCGHVMDNNIIKHGFKTSTIKIPKVSGFNA YLKLKKQRYYCKHCNSTFTLKTNIVNKNCYISNNTKVSIALSAKDKLSEKDIAKNHNVSHSTVNRVIDSFYQHYKPKFNY LPKHLCFDEFKSVKSADGAMSFIFCDADTGQIVDIVEDRRLHVLNNYFMKYSKAARNAVRTVVIDMYSPYISLIKSIFPK AKIIIDKFHIIQLFSRALNKTRIKIMNKDKKNYNKFKKYWKLLLKDTSSINYTTYNYHRSFKKPMREIDIINYLIDLDPE LKATYELYHDIRYCIKHKDFSLLNRTLSNVNNLISDYMKTSVKTLQKYIGYIENSFIYDYTNGILEGINNKIKVIKRIAF GYRSFYHFRNRILITQNLATLKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tnp | YP_251945.1 | transposase for ISSha1 | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-66 | 44 |
| tnp | YP_251995.1 | transposase for ISSha1 | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-65 | 43 |
