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Name : lysS (PalTV_089) Accession : YP_007660591.1 Strain : Candidatus Portiera aleyrodidarum TV Genome accession: NC_020831 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase (class II) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 93373 - 94863 bp Length : 1491 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTATAAAAAATTATTTAATAAAAGAACGTGTTGATAAGCTAAAGGTATTACGTGAAAAAGCAAAAAAAAATGGAAA AAGTGCATTTCCTAATGATTTTCGTCGTGATAGCATATCAAGTAATTTGAAAAACAAGTTTGGAGAAAAGAAAAAAGAAG AATTAGTAAAATTAAAATATACAACATCAGTAGCAGGACGTATTATGCGTAAAAGGGGGCCTTTTATAGTTATACAAGAT GTAAGTAGTAATATTCAGCTTTATATAGATAAAAAAATAATTTCTAAGGAATTGCATAAAAATATTAAAGATTGGGATAT TGGTGATATTATTGGAGCAATAGGGGTAATTAATAAATCTAATAAAGGTGAACTTTATTTATTAGTAAAAGAAGCTTATA TATTAACTAAAAGTATAAGGCCTTTACCAGATAAATTTCATGGTATAAAAGATCAAGAAATTAGATATCGTTATAGATAT TTAGATTTAATTATGAATAAAGAAGTACGTGAAATATTTAGTATTCGTACACGTGTTATATCGTCTATTAGAAAATTTTT AAATGAACTTGATTTTATGGAAGTAGAGACACCTATATTACATTCAATTCCAGGGGGAGCATTAGCAAAACCATTTGTAA CTTATAATAATTCATTAAATATAAAAATGTATTTACGTATTGCTCCTGAACTTTATTTAAAGCGTTTGGTAGTTGGTGGT TTGGAACGTGTATTTGAAATTAATAAAAATTTTCGTAATGAAGGTATATCAACTTGGCATAATCCGGAATTTACTATGTT AGAGTTTTATTGGGCTTTTGCAGATTATAAGGATTTGATGGGAATTACAGAAAATATGATTAGATTTGTAGCTAATGAAA CGTTAGGTACAACTAAAATTAATATAGGAAAAAAAATAAATATTGATTTATCAGAACCTTTTGATTGTTTAAGTATGCGA GAATCTATAATAAAGTATGGTAAAAATTTTTCAATTATTAACTCGGATTTAGATAATTTAGAAAAATTGCTTGATTTATC TAAACGGATTGGAATTATTGTAGATAATTATAAGAATTATGGTTTATTGCTTAATAAAATATTTGAAGTAATTGTAGAAC GAAAATTAATAAAACCAACGTTTATTACTTCATATCCTGTTGAAGTTAGTCCTTTAGCGAGAAGTAAAGATAAAAATCAA AATATAACAGAAAGATTTGAATTATTTATAGGGGGTAGAGAAATAGCTAATGGGTTTTCTGAATTAAATGATTATATAGA ACAATCTAAAAGATTTAAATTACAAATGAAAAAAAAAGATATTAAAGATATGATTTATTATGATAATGATTATATACGTG CATTAGAATATGGAATGCCTCCAACAGCTGGTGAAGGAGTAGGTATTGATCGTCTTATTATGATACTTACAAATAAAGAA TCAATTCGAGATGTATTGTTTTTTCCTTTGATGCGTAGTCTGAAAATTTGA Protein sequence : MIIKNYLIKERVDKLKVLREKAKKNGKSAFPNDFRRDSISSNLKNKFGEKKKEELVKLKYTTSVAGRIMRKRGPFIVIQD VSSNIQLYIDKKIISKELHKNIKDWDIGDIIGAIGVINKSNKGELYLLVKEAYILTKSIRPLPDKFHGIKDQEIRYRYRY LDLIMNKEVREIFSIRTRVISSIRKFLNELDFMEVETPILHSIPGGALAKPFVTYNNSLNIKMYLRIAPELYLKRLVVGG LERVFEINKNFRNEGISTWHNPEFTMLEFYWAFADYKDLMGITENMIRFVANETLGTTKINIGKKINIDLSEPFDCLSMR ESIIKYGKNFSIINSDLDNLEKLLDLSKRIGIIVDNYKNYGLLLNKIFEVIVERKLIKPTFITSYPVEVSPLARSKDKNQ NITERFELFIGGREIANGFSELNDYIEQSKRFKLQMKKKDIKDMIYYDNDYIRALEYGMPPTAGEGVGIDRLIMILTNKE SIRDVLFFPLMRSLKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 1e-96 | 51 |
| lysS | YP_005163386.1 | lysyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 2e-59 | 41 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_007660591.1 | lysyl-tRNA synthetase (class II) | VFG1668 | Protein | 6e-97 | 51 |
