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Name : serS (PalTV_050) Accession : YP_007660557.1 Strain : Candidatus Portiera aleyrodidarum TV Genome accession: NC_020831 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 52709 - 53965 bp Length : 1257 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAGATCTTAAATTAATTTGTAATAATTTTAATAATGTTGTAAAAAGATTATCAACCCGTGGTTTTGAATTAGATAT TAAAAAATTTAAAATTTTGCTAGAATTAAGCAATAAACTTAAAAATAAGACTGAAAAATTACAAAATAAACGTAATATTA TATCTAAAACTATAGGTCATATAAAAAAAACAGGTGCAAATATAAAACATCTCATTTTAGAAGTTAATAAACTAAATAAT AAACTTCATAAAAATCTTTTACGTTTAGAAGCAACCAAAAATAAATTTTTTAATATTTTATTTAAAATACCAAATTTACC ACATAATAGTGTACCAATAAAAAAAAATATAGAAATAATACGTTGGGGAATTCCTAAGTTTTTTAATTTTTCAATACGTG ATCATATTAAAATAGGATTACTAAATGATGATCTTGATTTGGAATTAGCAACTAAAATAACTGGATCTAGATTTACTGTC ATACGTGGTAAATTAGCTAAATTACATCGCGCTTTAATACAATTTATGTTAGATAAGCAAGTTAATGATCATGGTTATGA AGAAATGTATGTACCATATATAATAAATAGAAATTCTTTAGTAGGTACAGGTCAATTACCTCAATTTTATAAAAATATTT TTTCAATTGAAGGAGAAACTGAATATTTTCTTATTCCTACAGCTGAAGTTCCTTTAGTTAATAGTGTAAGTGGTAAAATA TTAAATATAAATGATTTACCAATTAAATTAACAGCACATTCTCCTTGTTTTAGAAATGAACCAGTATCTTATGGAAGTGA TTCTCGTGGGATGATGAGACAACATCAATTTGATAAAATTGAATTAGTACAAATAGTACATCCTGATACATCGTATGTTG TATTAGAAGATATGACTAAACATGCTGAAGAAATTTTAAAAGCATTAAAATTACCTTATAGAGTTATAATTTTATGTACT GAAGATATAAGTTTTTGTGCATCTAAAACTTATGATATAGAAGTATGGATACCTAGTCTAAATAGCTATAGAGAAATTTC CTCTATATCTAATTGTGAAGATTTTCAAGCAAGAAGAATAAAAACTAGAGTTCGTAAAAATAAAGAAAAACATACTTTTG TACATACACTTAATGGGTCTGGAATAGCTGTAGGTCGTTGTTTGTTAGCTATAATGGAAAATTATCAAAACGAAGATGGA TCTATTACAGTACCTGAAATTTTACGTTCTTATATGTGCGGAATTAAACGTATTTAG Protein sequence : MLDLKLICNNFNNVVKRLSTRGFELDIKKFKILLELSNKLKNKTEKLQNKRNIISKTIGHIKKTGANIKHLILEVNKLNN KLHKNLLRLEATKNKFFNILFKIPNLPHNSVPIKKNIEIIRWGIPKFFNFSIRDHIKIGLLNDDLDLELATKITGSRFTV IRGKLAKLHRALIQFMLDKQVNDHGYEEMYVPYIINRNSLVGTGQLPQFYKNIFSIEGETEYFLIPTAEVPLVNSVSGKI LNINDLPIKLTAHSPCFRNEPVSYGSDSRGMMRQHQFDKIELVQIVHPDTSYVVLEDMTKHAEEILKALKLPYRVIILCT EDISFCASKTYDIEVWIPSLNSYREISSISNCEDFQARRIKTRVRKNKEKHTFVHTLNGSGIAVGRCLLAIMENYQNEDG SITVPEILRSYMCGIKRI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 6e-82 | 45 |
