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Name : clpB (PalTV_100) Accession : YP_007660602.1 Strain : Candidatus Portiera aleyrodidarum TV Genome accession: NC_020831 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ATP-dependent chaperone protein ClpB Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 103898 - 106306 bp Length : 2409 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGATTAGATAGATTAACTAATAAATTGAAAAATGCATTATATTCAGCTAAATCATTAGCTATTATAAACTATCAAAA AAAATTACATACAGTACATATTTTACTTACTTTAATAAAAGAAGATATATTTAAATCATTAATTATAAAAAATGGAGGAG ATATTATAACAATTAATAAATATTTACAGCTAAAACTTAGTTTATTACCTAAACTTGTGAAAGTTGATGGAAAGGTATTG ATGGGGAAGGATGTTATAAGATTATTTAATTTAGCATATATAGAAGCTAAAATTAAGGATTATAAATTTATTTATAGTGA ATTAGTTTTGTTGGCAGCATTGAAACTAAATAATAAAGTAAGTAAGTTATTAATTAATGCTGGATTAAATAAACAAAAGG TGAAGTTAGAAATTTCTCAAATAATAGGTGGTAATGATATTGTTTTTGAAAAAAAAAAAGAAAAGTATATTAGGGATCTT ACAAAAAGTGCGTCAGAAGGAAAATTGGATTCAGTAATTGGTAGGGAGGAGGAAATTCGTAGAATTATTCAGGTATTACA GAGACGTAAGAAAAATAATCCTCTTTTAATCGGTGAAAAAGGGGTGGGTAAAACAGCTATTTTAGAGGGATTAGCTAACC GTATTCTTAATGGTGAGGTTCCAGAAAGTATAAAAAATAAAAAAGTATTTTCTATTGATATGGGAGCATTAATGGTTGAA GCAAAATATGAAGAGAGGATAAAGGAATTAAGAAAAAAAGAAGGTAGAGATGTATTATTATTTATAGACAATATTGTATC AGGTTTTTTTAATATGTTAAAACCAGTATTATATAGAGGTGATTTACATTGTATTGGTGCTACAACAGTAGAGGCGTATA GAAAATATATAGAAAAAGATTATGCATTAGAAAGAAGGTTTCAAAAAATAAAGGTAGATGAACATTCAGAAGAAGATACA ATCGCTATATTACGTGGTTTAAAAAAAAGATATGAAATTCATCACAGTGTCAAGATAACAGATGGAGCGATTATAGCAGC AGCAAAATTATCAAATCGTTATATTACTGACAGAAAGTTACCTGTTAAGGCAATGGATTTAATAGATGAGGCGGCTTCTA GAATTAGTATAGAGATAGATTATAAACCAGAAATAATGGAGAAAATGGAACGTCATTTGATTAAACTAAAAATAGAAAGG GAAGCTATTAAAAGAGAAAATGATAAATATTATAAGAAAATTTTAAAGATATTGGAAAATAAGATAAAAGAACTTAGTAA GGAATATTCAGAAGTAGAAAAAATTTGGAAAACAGAAAAATATATTTTAAAGGGAACGGCTAAATTAAAAAGGGAAGGAG CTCGTAGGAATAAAGATATTGTAAAATTGTCGGAAAGAATACCCACATTTAAAAAAGCAAATAATATATTAAATTTGTTA AGATCTAAATTAACTGAAGAAGAAATAGCAGAAGTAGTTTCAAGGTTAACAGGTATACCTATGGCTAAGATATTAGAAGG AGAAAGAGAAAAAATTATAAAAATGGAAGAAGTTTTGCAAAAAAGAGTAATTGGTCAAAGTGAAGCAGTACAGGCAGTTT CTAATGCAGTACGTAGGCGTTATATTACTAGGATTATTGAACATAATAAAAATAAAGGGTCTTTTTTATTTCTTGGTCCT AAAGGTGTAGGAAAAACAGAATTATGTAAAGCTTTAGCTGAGATTATTTTTAATACAGAAGAATCAATAGTACGTATTAA TATGTCAGAATTTATGGATAAGTATTCTGTAATAAGATTAAGGGGTGAGTTAACAGAAAAGGTACGTATAAAACCTTATT CAGTCATATTGTTGAATGAAATAGAGAAGGCTCATACTGATATATATAAGATATTGCTACTAATATTAAAAGTTGGTATC TTAACTGATGGTAAGGGACAAAAGATAGATTTTAGAAAGACAATTCTTGTTATGACGTCAAATCTAGGATATGAAGTTAT TAATAGATTTTCTGGAGAAACATATAATGAAAGGAAGTTGGTAGTTATGGAATTAGTTAATGTTCATTTGAAGTCAGAAA TTATAAACATTATTGATGAAATAGTAGTATTTAATTCATTATTTATTAATCAAATTAATAATATTGCTTATATTAAAATT AAGAAATTGATAAAGAGTTTAGCTATAAAAAAACTACAATTAGAAATTTCACAAGATGCTATAGAAAAAATATCACGTAT GGGTTTTAATACAGTATATGGAGCAAAACATTTAAAAAAAGCAATTCAAAATTTGTTAGAAAATCCTTTATCAAAAGCAA TATTATATGGAAAAATTATTACAGGAGATAGAATTAAGGTTATTGTTGAAAAGGATCAAATTGTATTTAGTAAATTAAAA TTTCAATAA Protein sequence : MRLDRLTNKLKNALYSAKSLAIINYQKKLHTVHILLTLIKEDIFKSLIIKNGGDIITINKYLQLKLSLLPKLVKVDGKVL MGKDVIRLFNLAYIEAKIKDYKFIYSELVLLAALKLNNKVSKLLINAGLNKQKVKLEISQIIGGNDIVFEKKKEKYIRDL TKSASEGKLDSVIGREEEIRRIIQVLQRRKKNNPLLIGEKGVGKTAILEGLANRILNGEVPESIKNKKVFSIDMGALMVE AKYEERIKELRKKEGRDVLLFIDNIVSGFFNMLKPVLYRGDLHCIGATTVEAYRKYIEKDYALERRFQKIKVDEHSEEDT IAILRGLKKRYEIHHSVKITDGAIIAAAKLSNRYITDRKLPVKAMDLIDEAASRISIEIDYKPEIMEKMERHLIKLKIER EAIKRENDKYYKKILKILENKIKELSKEYSEVEKIWKTEKYILKGTAKLKREGARRNKDIVKLSERIPTFKKANNILNLL RSKLTEEEIAEVVSRLTGIPMAKILEGEREKIIKMEEVLQKRVIGQSEAVQAVSNAVRRRYITRIIEHNKNKGSFLFLGP KGVGKTELCKALAEIIFNTEESIVRINMSEFMDKYSVIRLRGELTEKVRIKPYSVILLNEIEKAHTDIYKILLLILKVGI LTDGKGQKIDFRKTILVMTSNLGYEVINRFSGETYNERKLVVMELVNVHLKSEIINIIDEIVVFNSLFINQINNIAYIKI KKLIKSLAIKKLQLEISQDAIEKISRMGFNTVYGAKHLKKAIQNLLENPLSKAILYGKIITGDRIKVIVEKDQIVFSKLK FQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpC | YP_005163377.1 | ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit | Not tested | Not named | Protein | 7e-99 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpB | YP_007660602.1 | ATP-dependent chaperone protein ClpB | VFG0079 | Protein | 1e-100 | 41 |
