Gene Information

Name : MED152_03355 (MED152_03355)
Accession : YP_007670707.1
Strain : Polaribacter sp. MED152
Genome accession: NC_020830
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : DEAD/DEAH box helicase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 718823 - 720919 bp
Length : 2097 bp
Strand : -
Note : RecG-like helicase

DNA sequence :
TTGAACTTAGAATACCCAATTACATATATTTCAGGAATAAGTGTGCAAAGAGCTACACTCTTATATTCAGAATTAGGTAT
TAAAACATGTAATGACCTTTTAAATTTCTTTCCTTTTAGATATATAGATAAAACTAAGTTTCATGCTATAAAAGAACTGC
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TAAAAACTGTTCATAGATTTGATAGTAATCGTTTGTCTGTATTCAAATTTATGAAAGATGAAATAGCAAAAGGTAAACAA
GTATATATTGTATACCCTTTAATTCAAGAATCTGAAGCTATGGATTATAAGGATTTAATGGATGGTTATGAAAGTGTTGC
AAGAGAGTTTCCATCACCTAAATATCAAATAAGTATTGTTCATGGTAAAATGAAACCTGCAGATAAAGATTATGAAATGC
AGCGTTTTGTAAAAGGAGAAACGCAGATTATGGTAGCTACAACTGTAATTGAAGTTGGTGTAAATGTACCCAATGCAAGT
GTAATGATTATTGAAAGTTCAGAACGATTTGGATTGTCTCAACTACATCAATTAAGAGGAAGAGTAGGTAGAGGTGCAGA
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TTAAATTTAAAAATTGCTGATGTAGCTAAAGATTCCAAAATTTTGGTTGCAGCTAGAAACACAGCTATAGATTTATTGCA
AGAAGATCCAAATTTAGAAAAACAACACAATTTACCGATAAAAAATACGTTTGCTAAAATTAGTAAAACCTCTAAAATAT
GGAGTAACATTAGTTAA

Protein sequence :
MNLEYPITYISGISVQRATLLYSELGIKTCNDLLNFFPFRYIDKTKFHAIKELQPNSSEVQVVGKIINVKSVAQKRGSRL
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LNLKIADVAKDSKILVAARNTAIDLLQEDPNLEKQHNLPIKNTFAKISKTSKIWSNIS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
recG CAJ77039.1 ATP-dependent DNA helicase Not tested AbaR1 Protein 5e-95 41

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
MED152_03355 YP_007670707.1 DEAD/DEAH box helicase BAC0356 Protein 9e-106 42