Name : MED152_03355 (MED152_03355) Accession : YP_007670707.1 Strain : Polaribacter sp. MED152 Genome accession: NC_020830 Putative virulence/resistance : Resistance Product : DEAD/DEAH box helicase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 718823 - 720919 bp Length : 2097 bp Strand : - Note : RecG-like helicase DNA sequence : TTGAACTTAGAATACCCAATTACATATATTTCAGGAATAAGTGTGCAAAGAGCTACACTCTTATATTCAGAATTAGGTAT TAAAACATGTAATGACCTTTTAAATTTCTTTCCTTTTAGATATATAGATAAAACTAAGTTTCATGCTATAAAAGAACTGC AACCAAACTCCTCAGAAGTACAAGTTGTGGGTAAAATTATCAATGTTAAGTCTGTAGCACAAAAAAGAGGAAGTAGGTTA GTGGCTACCTTTCAAGATGCGACTGGATCTATGGAGTTGGTTTGGTTTAAAGGTCAAAAATGGATTAAAGATTCTTTAAA AACGGATGTACCCTATGTAGTTTATGGTAAACTGAATCATTATAATGGTAGTTTTAGTATTCCACATCCAGAAATGGAGT TGGTTTCTGAATACAAGAAAAAGTTGCAAACTAAAATGCAGCCCATTTATCATTCTACAGAAAAACTCACCAATTCTGGT GTTTCAAATAAAATGATTCGTTCTTACATTCAAAAGTTGTTACAGCAATTTTATGATGGTATCCAAGAAAGTTTATCAAC AGAAATTATTAATGATTTTAAGTTGATGAAAAAGCGAGATGCTCTATTGAATGTACACTTTCCTAAAAGTCAAGAAAATT TAGCCAAGGCACAAAATCGCTTAAAGTTTGAAGAACTCTTTTTTATCCAATTACAATTGGTTCGAAAAAAATTAATCAAC AAAGCAAAGATTAAGGGATTTGTTTTTGAAAATGTAGGTGCTATTTTTAATCAATTTTATTCAGAAAAATTACCTTTTAA TTTAACCAATGCTCAGAAAAGGGTATTGAAAGAAATTCGAAAAGATGTAGCTTCTGGTGCACATATGAATCGATTGTTAC AAGGAGATGTTGGTTCAGGAAAAACAATTGTAGCTTTATTAACTACACTTTTAGCCATAGACAATGGTTATCAAGCAACA ATTATGGCTCCAACAGAAATATTAGCAAATCAGCATTTTATTGCAGTTTCAGAATTGGTAGAAGGCATGAATATTAAAGT TGATATTCTTACAGGGTCTGTTAGAACTAAAAAACGTAGAGAAATTCATGAAGGATTAGAAGATGGTAAATTACATATTT TAATTGGCACACATGCATTACTAGAAGATAAAGTAAAATTTAAAAATTTAGGAATTGCAATTATAGATGAACAGCATAGA TTTGGTGTAAAACAAAGAGCTAAACTCTGGGCTAAAAACTCGTTGCCTCCTCATATTTTGGTAATGACAGCAACACCAAT CCCTAGAACTTTAGCCATGTCTGTTTATGGAGATTTAGACATTTCTGTTATTGATGAATTACCTCCAGGAAGAAAAGAAA TAAAAACTGTTCATAGATTTGATAGTAATCGTTTGTCTGTATTCAAATTTATGAAAGATGAAATAGCAAAAGGTAAACAA GTATATATTGTATACCCTTTAATTCAAGAATCTGAAGCTATGGATTATAAGGATTTAATGGATGGTTATGAAAGTGTTGC AAGAGAGTTTCCATCACCTAAATATCAAATAAGTATTGTTCATGGTAAAATGAAACCTGCAGATAAAGATTATGAAATGC AGCGTTTTGTAAAAGGAGAAACGCAGATTATGGTAGCTACAACTGTAATTGAAGTTGGTGTAAATGTACCCAATGCAAGT GTAATGATTATTGAAAGTTCAGAACGATTTGGATTGTCTCAACTACATCAATTAAGAGGAAGAGTAGGTAGAGGTGCAGA CCAAAGTTATTGTATTTTGCTTTCTAGTTATAAATTGTCTGAAGAAGGTAAAACACGTTTAAAAACAATGGTAGATACTA CAGATGGATTTAAAATTGCTGAGGTAGATTTAAAACTGCGTGGACCTGGAAATTTAATGGGTACTCAACAAAGTGGAGTG TTAAATTTAAAAATTGCTGATGTAGCTAAAGATTCCAAAATTTTGGTTGCAGCTAGAAACACAGCTATAGATTTATTGCA AGAAGATCCAAATTTAGAAAAACAACACAATTTACCGATAAAAAATACGTTTGCTAAAATTAGTAAAACCTCTAAAATAT GGAGTAACATTAGTTAA Protein sequence : MNLEYPITYISGISVQRATLLYSELGIKTCNDLLNFFPFRYIDKTKFHAIKELQPNSSEVQVVGKIINVKSVAQKRGSRL VATFQDATGSMELVWFKGQKWIKDSLKTDVPYVVYGKLNHYNGSFSIPHPEMELVSEYKKKLQTKMQPIYHSTEKLTNSG VSNKMIRSYIQKLLQQFYDGIQESLSTEIINDFKLMKKRDALLNVHFPKSQENLAKAQNRLKFEELFFIQLQLVRKKLIN KAKIKGFVFENVGAIFNQFYSEKLPFNLTNAQKRVLKEIRKDVASGAHMNRLLQGDVGSGKTIVALLTTLLAIDNGYQAT IMAPTEILANQHFIAVSELVEGMNIKVDILTGSVRTKKRREIHEGLEDGKLHILIGTHALLEDKVKFKNLGIAIIDEQHR FGVKQRAKLWAKNSLPPHILVMTATPIPRTLAMSVYGDLDISVIDELPPGRKEIKTVHRFDSNRLSVFKFMKDEIAKGKQ VYIVYPLIQESEAMDYKDLMDGYESVAREFPSPKYQISIVHGKMKPADKDYEMQRFVKGETQIMVATTVIEVGVNVPNAS VMIIESSERFGLSQLHQLRGRVGRGADQSYCILLSSYKLSEEGKTRLKTMVDTTDGFKIAEVDLKLRGPGNLMGTQQSGV LNLKIADVAKDSKILVAARNTAIDLLQEDPNLEKQHNLPIKNTFAKISKTSKIWSNIS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 5e-95 | 41 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
MED152_03355 | YP_007670707.1 | DEAD/DEAH box helicase | BAC0356 | Protein | 9e-106 | 42 |