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Name : serS (MED152_08940) Accession : YP_007671787.1 Strain : Polaribacter sp. MED152 Genome accession: NC_020830 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.11 Position : 2012151 - 2013425 bp Length : 1275 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTACAAGTACAGTTTATTAGAGAAAATAAAACCAAAGTTTTAGAAGGTTTAGCAAAACGTAATTTTGCTAATGCTGA AACACTTATTGAACAAGTTTTAACTGCAGATGAAAACAGAAGAGCTACACAAGTTGAGCTTGATAATACCTTAGCAGAAT CTAATAAACTATCTAAAGAAATTGGTAACTTGTACAAAACAGGAAAAGCGCAAGAGGCTAATGTTTTAAAAGAAAAAACA GGGCAATTAAAAGAGAGTTCTAAAGAATTGTCTGAAAAACTGTCTCAATTTTCTGATGAATTAGACCAACTTTTGTATCA AATACCAAATGTACCTCATGCTTCTGTAAAAGCAGGCTCTTCAGAAGAAGACAATGAGAACATTTTTAGTGAAGGCACTA TCCCTAATTTAGGAGATCATGCACTTCCTCATTGGGAGTTGGCCAAAAAATACGATATTATTGATTTTGAATTGGGTACT AAAATTTCTGGTGCTGGTTTTCCTGTTTATAAAGGAAAAGGAGCAAGGTTACAACGTGCTCTAATCAATTATTTTTTAGA TAAAAATACAGCTGCTGGTTATAAAGAAGTTCAAGTGCCACATTTGGTAAATACAGCTTCTGCAACTGCAACTGGGCAAT TGCCAGATAAAGATGGTCAAATGTATCATTCAACTGTAGATGATTTGTATTTAATACCAACTGCAGAAGTACCAATTACA AATATGTTTCGTGGAGATTTGGTTCAAGAATCAGATTTTCCAATTGCTTTAACTGGTTATACACCTTGTTTTAGACGCGA AGCTGGTAGTTATGGTGCTCACGTTCGTGGTTTAAACAGATTGCATCAATTTGATAAAGTAGAAATTGTAAGAGTAGAGC ACCCAGAAAATTCTTACAAGGCTTTAGATGGAATGGTTGAACACATTAAAAATATTCTAAGAGAGCTTAAATTACCTTAC AGAATTTTACGTTTGTGTGGTGGAGATACAGGTTTTACTTCTGCTTTAACTTTCGATTTTGAATTGTTTTCTACAGCTCA AGATAGATGGTTAGAAATTAGTTCTGCCTCTAATTTTGAAACTTTTCAGGCAAACAGATTAAAACTTCGTTTTAAGAACA AAGAAGGTAAAAGCGAATTAGCACACACGTTAAATGGTAGCTCATTGGCTTTACCACGTGTATTAGCTGGAATTTTAGAG AATTATCAAACAGAAAATGGAATTCAAGTTCCGGAAGTCTTGATTCCTTATACTGGTTTTGATATGATTAATTAG Protein sequence : MLQVQFIRENKTKVLEGLAKRNFANAETLIEQVLTADENRRATQVELDNTLAESNKLSKEIGNLYKTGKAQEANVLKEKT GQLKESSKELSEKLSQFSDELDQLLYQIPNVPHASVKAGSSEEDNENIFSEGTIPNLGDHALPHWELAKKYDIIDFELGT KISGAGFPVYKGKGARLQRALINYFLDKNTAAGYKEVQVPHLVNTASATATGQLPDKDGQMYHSTVDDLYLIPTAEVPIT NMFRGDLVQESDFPIALTGYTPCFRREAGSYGAHVRGLNRLHQFDKVEIVRVEHPENSYKALDGMVEHIKNILRELKLPY RILRLCGGDTGFTSALTFDFELFSTAQDRWLEISSASNFETFQANRLKLRFKNKEGKSELAHTLNGSSLALPRVLAGILE NYQTENGIQVPEVLIPYTGFDMIN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 7e-63 | 41 |
