Gene Information

Name : LVISKB_0555 (LVISKB_0555)
Accession : YP_007653395.1
Strain : Lactobacillus brevis KB290
Genome accession: NC_020819
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : uncharacterized protein ydcI
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 589887 - 592082 bp
Length : 2196 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGCAACGAAACAAGAAACAGCTTTAAGTGAATTAGCTCAGCCAATTCATCAAACGTTGAGTCAATATCGTGTGCGGCA
GATTCAAGCCGTCTTGACCCTATTGGATGAAGGTAATACGGTGCCCTTTATCGCTCGGTACCGAAAAGAGCGGACGGGAT
CACTAGATGAAGTCGCCATTCGCGATATTGAAGACGAAGCCCATCGGCTGACCAAATTGAATCAACGGCGCGACGATGTA
TTAAAGCTGATTGCAGAGCAAGGTAAATTAACGCCGGCACTCAAAGAAAACTTGATGCACGCAACTGTGCTACAACAGGT
GGAAGATCTTTATTTGCCATACAAGCAAAAGCGGCGCACCAAAGCAACGATTGCTCGGGAAGCCGGGTTGGCACCGCTAG
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GATGTGGCGAGTGTCTGGGCTGGTGTCCACGAAATCTTGGCAGAAACATTTAGTGAACAGGCCGCCTTTCGTGAATGGAT
TCGACGTTATACGTGGCAGCATGGAGAGTTAACCAGTAAGCTTAAGCGCGGGGCCGCTACGGAGGATGAACAACAAGTTT
ACGCGACGTACTATGAATTTACGCAGAGCTTAAAGCAGGTGCCGCCGTATCGGGTGTTAGCGATTAATCGGGGTGAACGA
GAAAAGATCCTATCTGTGGGAATTAATGTTGATGCGACGTCCATTCTGCAATATGGTCACTTTCGGTTAGTGGGTCAGCA
CCGCGGACCAGCTGTGGAAAAAGTCACAGCGGCATTTGCGGATGCTTATAAGCGCTTTTTAGGCCCGGCAATTGAACGGG
AATTACGCCGACAATTAACGGATCAGGCCGATGAACATGCCATTCAAGTGTTTGGTAATAACCTGTATCACTTGTTGATG
CAGGCACCCCTCAAAGGGAAAATTGTGATGGGGTTTGATCCGGCGTATCGAACCGGTTGTAAGCTAGCAATTATGGATGC
TAATGGTCGCTTTTTAGCTAAACAAGTCATTTATCCACATAAGCCGGCCGATGCTAAGAAACGGGCGGCGGCAACACCAG
CATTTAAAAAATTGCTTGAGGACTATCACGTTGAAATGATTGCCATTGGTAATGGGACCGCTAGTCGTGAATCCGAAGAA
TTTGTGAGTCAAATACTGAAGACATTGAACCGGCCAGTGTACTATGTGTTGGTCAATGAAGCCGGTGCCTCAGTGTACTC
GGCTAGTGCCAATGCGCGGGCTGAATTTGCTGATTTTCACGTTGAAGAGCGGTCAGCGGTCAGTATTGGTCGACGGTTGC
AAGATCCTTTAGCTGAATTAATTAAGATTGATCCGAAAGCTGTCGGGGTCGGGCAGTACCAACACGACGTTCCCGAAAAA
GCGTTGGATGAACAACTTGATCGAGTCGTTGAAACGGCGGTTAACCAAGTTGGGGTTAATGTTAATACGGCAAGTCCCGA
ATTGCTCACCCATATTTCGGGCCTAACAACGACGACTGCTAAGAACATTGTCTCTTACCGTAACGATCATGGCGCCTTTA
ACAGTCGGCAGGCCCTGCAACAGGTGCCTCGTTTGGGGCCGAAAGCCTACCAACAAGCGGTGGGCTTCTTACGAATTATT
GAGGGCAGTGACCTGCTGGATAACACGGATATCCATCCGGAAAGTTATTCAGCCGCCCGTCAGCTATTAACCGGGTTGAA
CCTCACAACCACGAGCGTTGGCACCCCGCAATTGCAACAGCAATTAGCCAAACTCAATCAGCAACAGTGGGCGAACCAGT
TGGGGATTGGACCAGCAACCTTGGCGGATATTGTGACCGGGTTAAGCAAACCCGGTCGTGACTTACGGGATAGTATGCCA
GCCCCGCTGTTACGGCAGGATGTGTTGACGATGGCCGACTTGCAACCGGGAATGGAATTGCAAGGCACCGTCCGGAACGT
CGTTGATTTTGGTGCGTTTGTGGATATTGGGGTTAAGCAGGATGGCTTGGTCCACATTTCCCAGTTAGCTGATCACTACG
TCAGTGATCCTAGCACGGTAGTCACAATTGGTGATGTGGTGACAGTTTGGGTGTTGAGTGTTGATGAGAATCGCCAACGC
ATTCAGTTGACGATGAAGCAGGCTGCTCGTGACTGA

Protein sequence :
MATKQETALSELAQPIHQTLSQYRVRQIQAVLTLLDEGNTVPFIARYRKERTGSLDEVAIRDIEDEAHRLTKLNQRRDDV
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IQLTMKQAARD

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
NMB0075 NP_273139.1 transcriptional accessory protein Tex Not tested IHT-A Protein 1e-119 43