Gene Information

Name : LVISKB_2307 (LVISKB_2307)
Accession : YP_007655147.1
Strain : Lactobacillus brevis KB290
Genome accession: NC_020819
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative purine-cytosine permease yxlA
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2302251 - 2303624 bp
Length : 1374 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAATAATGAGCTCGTCAAAATTTCGGATGCAGATAAAACATTAACGCCAGGGAAAATTTTCTACAACTGGTTTGCCGC
GAATATTGGGATTATGGGATTCGTCTTTGGTGCGATGATTGTTGCTTATCATCTGTCGTTTGCCCAAGCAATTCTCGCTG
CTTTTTGTGGCGCGTTGTCCTTTTTAGTGCCAGGATGGGTGGCGATGATTGGTCAACGAGAAGGTGTGACAACCTTTAAG
CTGAGCCGGGCGGCCTATGGTACTCGGGGGAATAAAATTCCCAATGCCATCGCTTGGATTAATATGGTGGGGTGGCTTTC
GGTTAACGTGATTACGGGGACCATGCTATTAATTTCCATGTACGGTGTTTTAAATATCCCAAAGAACACCGTCACACGGG
CCGTTGCTCTGGCTATCTTTGGTGGGTTAGTGCTGCTGTCTGGTTTGTTAAAAGAAGCCACTTTAGCCAAGATTCAAACA
TGGTTAAGCTATGTCTTTGGCGCGTTAACGGTTGTTATTTTGGTTCTCTTCTTGCTAAAGGCGGATTGGCAGGCCGCTTT
TAATCTTCCAGGTGGTCATTGGATTAGCGGTTTCTTACCAGCTGTCAGCATCGTTGCCGCCGGTTCAGGCATTTCTTGGT
CGATGGCAGCCGCCGATTGGGGTGCCTATGTCAAGCCAGAAACTAAACCGCAAGCGACCTTTTGGGGAACAGCCTTGGGT
GGCGCAGTACCCTTGTTTGTCCTCATGGCCGGTGGTGTTTTGTTAAGTACGATTGAACCGGCTTTGGCGACAACGGGTGA
TCCGTTTGGCATAATGTACTCAGCCTTACCAAGCTGGATCGGCGTCATCTATTTTCTGGTGGCTGCTGGGGGTCTAATCC
CGCAATGTATTGTATCTTTGCGGTCGGCCCGAATTAACTTGGGGACGATTGGGATTCGTGTTTCACAACGGACTTCCTTA
GTTATTCATGGTTTAATTGTGATTTTGATTCCAGTTTACGTTCTCTTTATCTCAGGAAATTTTCTAGCCAACTTCGAATT
GTTCTTAAACTTTTTGGGGATTTGTTTGGCTAGTTGGGTTGCCATCTTCCTATGCGATAGTGCGATGTTCAGAAAAAACG
GCTATGAGCTGGCGTTATTAGTGCCAGATTCTAAAAAGCACTATAACTGGGGTGGCATTATCTCTTGGGTCATTGCGACG
ATTACGGGTTTTCTATTTACCAATAATGCGATTTGGAATGGTCCATTTTCCCATGGAATTTTTAGAAATAATAGTCTCGG
CGTTTTTATCTCGGCAATTGTTGCGATCATCTGTATGTTTATCGTTAAAATGGTAGCGCATCCAAATGGTGAGGGGGTTA
TGCATCATGAGTAA

Protein sequence :
MNNELVKISDADKTLTPGKIFYNWFAANIGIMGFVFGAMIVAYHLSFAQAILAAFCGALSFLVPGWVAMIGQREGVTTFK
LSRAAYGTRGNKIPNAIAWINMVGWLSVNVITGTMLLISMYGVLNIPKNTVTRAVALAIFGGLVLLSGLLKEATLAKIQT
WLSYVFGALTVVILVLFLLKADWQAAFNLPGGHWISGFLPAVSIVAAGSGISWSMAAADWGAYVKPETKPQATFWGTALG
GAVPLFVLMAGGVLLSTIEPALATTGDPFGIMYSALPSWIGVIYFLVAAGGLIPQCIVSLRSARINLGTIGIRVSQRTSL
VIHGLIVILIPVYVLFISGNFLANFELFLNFLGICLASWVAIFLCDSAMFRKNGYELALLVPDSKKHYNWGGIISWVIAT
ITGFLFTNNAIWNGPFSHGIFRNNSLGVFISAIVAIICMFIVKMVAHPNGEGVMHHE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SERP2217 YP_189773.1 cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin permease family protein Not tested vSe1 Protein 4e-69 44