Gene Information

Name : PCNPT3_02645 (PCNPT3_02645)
Accession : YP_007639309.1
Strain : Psychromonas sp. CNPT3
Genome accession: NC_020802
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 624166 - 626154 bp
Length : 1989 bp
Strand : +
Note : COG0021 Transketolase

DNA sequence :
ATGCCTTCTCGTCAAGAGTTAGCTAACGCCATTCGCGCCTTAAGCATGGATGCCATTCAGAAATCTAATTCAGGTCACCC
CGGCGCCCCAATGGGGATGGCTGATATCGCACAAGTATTATGGACTGACTTTTTAAAACATAACCCAACCAACCCACAAT
GGGTCGATAGAGATCGTTTTATTCTATCTAATGGTCACGGTTCAATGTTGCTCTACTCTCTACTACATTTAAGTGGTTAT
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TGTTAGGAGGATCAGCTGATCTAGCGCCTTCTAATCTGACCATGTGGTCAGGTACCAAAGCAATTACGGCTGAAGATGCA
TCGGGTAACTATTTACATTATGGCGTACGAGAGTTTGCTATGTCAGCCATTATTAATGGTATAGCGCTACATAAGGGTTT
TGTCCCTTATGGTGCTACCTTCTTAATGTTTATGGAATATGCTCGCAATGGTTTACGTATGTCGGCGCTTATGAAAAAAC
GCGCGATCCAAGTGTTTACACATGACTCTATTGGCTTAGGTGAAGATGGCCCGACGCATCAACCTGTGGAGCAAATGGCG
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TGAGCGTCTTGATGGCCCTACATGTCTTATTTTTAGCCGTCAAAACTTACAACAACAGCCTCGTGATGCAGCGCAACTCG
CTAATGTCGCGAAAGGTGGTTATGTATTACTAGACAGTGATAAACCAGCACAGATAATTTTAATTGCGACTGGCTCAGAA
GTGCAATTGGCAGTTGATGCCTATGCAGAGTTAACGGCGCAAGGTAAAGCAGTGCGAGTTGTTTCTATTCCTTCAACGGA
TGTTTTTGAGCAACAAAGTGACGAATACAAAGAGTCTGTTTTACCATCAAATATCAGTAAACGCGTTGCAATTGAAGCGG
GTATTGCTGATTACTGGTACAAATATGTGGGCTTAAACGGTAAAGTTATTGGGATGACTACTTTTGGTGAATCAGCACCA
GCGGATCAACTCTTTAAAATGTTTGGCTTCACTGTTGAAAATGTCGTCAACACGGCGAATTCACTATAA

Protein sequence :
MPSRQELANAIRALSMDAIQKSNSGHPGAPMGMADIAQVLWTDFLKHNPTNPQWVDRDRFILSNGHGSMLLYSLLHLSGY
DLSIEDIKSFRQLHSKTPGHPELGYTPGVETTTGPLGQGVTNAVGMAIAEKSLAAQFNQAGHNIVDHHTYTFLGDGCLME
GISHEACSLAGTLGLGKLIAFWDDNGISIDGNVEGWFTDDTPARFRAYGWHVISVDGHDAKALTDAIIAAKAETQKPTMI
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SLRLTPNMDLWRPCDPVESAVAWKSAIERLDGPTCLIFSRQNLQQQPRDAAQLANVAKGGYVLLDSDKPAQIILIATGSE
VQLAVDAYAELTAQGKAVRVVSIPSTDVFEQQSDEYKESVLPSNISKRVAIEAGIADYWYKYVGLNGKVIGMTTFGESAP
ADQLFKMFGFTVENVVNTANSL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 71
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 0.0 67