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Name : PCNPT3_08420 (PCNPT3_08420) Accession : YP_007640460.1 Strain : Psychromonas sp. CNPT3 Genome accession: NC_020802 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ClpV protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1991281 - 1993992 bp Length : 2712 bp Strand : - Note : COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit DNA sequence : GTGATAAGAATCGAACTGCCAACATTAATTGGTAAATTAAATGCGCAAACGAAGCTTGCTTTAGAGCAAGCTGCATCGGT ATGTATTAGTCGTCAAAATTCAGAAGTAACATTTGAGCATTTGCTTTTTAGTTTACTTGAAAATCCATTATCGGATGTTC GAGTATTAATTAAACAAGCGGGTCTAGATCATGATGTTCTAAAGCAAAAGATTGGTGCAGTGATGGCTCGTAGTAACGAT AGTCACGAGACTTACCCCGCTTTTTCGCCATTATTAGTTGAATTATTACAAGATGCGTGGTTATTAAGCTCAATTGAACT TAATGAGACAGAGCTACGTTCAGGGGCTATTTTTTTAGCCGCGTTATTACGCTCGGATCGTTACTTAGAATTTAGCTTAC ATGATTTATTAAAATCTTTTAATTGTGAGACGTTGCGTAAGAATTTTTCGATCTTAACCTCTGGCTCTACAGAGTCTCCA GCTCCGCTCGATACGTCTAAATCAGTATCGGTATTGAATGATTCAACGACTGCTTTATCACGTTTTTGTTGTAATTTTAC TGAGCAAGCACGAAAAGGTGAGTTAGATCCGGTGATATGCCGGGATGCTGAAATTAACTTAATGATTGATATATTGTGTC GTCGTCGTAAAAATAATCCTATTGTAGTAGGCGATGCAGGTGTAGGTAAAAGTGCTGTTGTCGAAGGCTTAGCATTGCGT ATTGTTGAAAATAAAGTGCCGGAGTCATTGCGTGACGTTGAATTAATGTCATTGGATTTGGGACGTTTGCAAGCGGGAGC GTCGGTAAAAGGTGAATTTGAAAAACGTTTAAAAGGGCTTATTGATGAAGTAAAAGCATCATCAACACCGATAATTTTAT TTATAGATGAGGCGCATACTTTAATAGGAGCGGGTAATCAAGATGGTAATGATGCGGCGAACTTATTGAAACCAGCACTT GCCCGAGGTGAATTATGTACGATAGCGGCCACTACTTGGAAAGAATACAAAAAATATTTTGAAAAAGATCCCGCCTTAAA TCGTCGTTTTCAACTCGTAAAATTAGATGAGCCTAGCGTAGAGCAAGCGGTGGATATTTTACGTGGTTTGCATCAAGTTT ATGAGAAAGCGCATAAGGTACTTATCAGTGATGAGGCGCTTCGAGCTGCCGCTGAGCTATCGGCTCGTTACGTATCGGGT CGTCAACTTCCCGATAAAGCGATTGATGTACTTGATACTGCCTGTGCTCGTATAGCAATTAATTTGAGCTCTCCTCCTCG TCGCATTGGCGAACTTGAAAATATTTGTTATCAACGCCAACTTGAAATTAACATGTTAAATCGTCAAAAAAAGTTAGCTC GAAATATTGATGAAGAGCGTTTAGACGAATTATTAAAATTAGAAGTAGAGACGCGAGCATTGATTAAAAAGTTGCATGAT GCTTGGGAGATACAGCGTGAAGTAGTTGAGAAAGTGATTATTATCCGCCAAAGTATTTTAGATGATAGTGTTGCGATATC GACAGGTATTGATAGCGATACAGATAGCGATACAGATACCGATGTTAGCGTTGAAACAGAATCGACTAACATTGCAGTTG AAAGTGCATCTATTGCGCCACAAAAAAAGACGCCAGAGCAAGAGAATGAGTTACGTGAACAGTTAAAGAGTCTATATGCA GAGCTTGCCGCTATCCCTCATAGCGAAGTGTTAATGCACCCGGAAGTAGATGCAGAGCAAATAGCAGAGGTCATTGCGGA TTGGACGGGTGTACCCGTTGAGCAAATGAATGCAGACGAACTCACTAAAATAACTAATTTACCGCAGTTACTCGGTGCAA CAATAAAAGGTCAAGATACTGCACTCGCTACAATTCATCGACATATGTTAACTTCACGTGCAGATTTGCGTCGACCAGGT AGACCCAAAGGTGCTTTTTTATTAGTGGGTCCAAGTGGAGTAGGAAAAACAGAAACTGTTTTGCAATTAGCTGAAAAGTT ATATGGCGGACGGCAATTTCTGACCACAATAAACATGTCAGAATATCAAGAAAAGCATACTGTATCTCGTTTAATCGGTT CGCCTCCTGGTTATGTTGGTTTTGGTGAAGGTGGCGTATTAACCGAAGCTATTCGTAAAATGCCATATTCAATTGTTTTA CTTGATGAAGTCGAAAAGGCACACCCTGATGTATTAAATTTATTTTACCAAGCATTTGATAAAGGTGAGATGGCTGATGG TGAAGGTCGCTTGATTGATTGTCAAAATATTGTTTTCTTTTTAACTTCAAATTTGGCTTATCAAAGCATTGTTGACCATC GCATTGAAACAGGAATAATTGAAGATAAAATTTATCCTGAGTTGGCGGCTTTCTTTAAACCTGCGTTACTCGCACGCATG GAAGTTGTTGTCTATCGACCACTTGGAGAGTCTATTTTAAAACAAATAATTTGTGGAAAATTATCTCGTTTAGAAACGTT ATTTATGAGTCGTTATAAGGCTGAAGTAAAAATAGATGACTCCTTAATAGATGAAATTTTGCGTCGTTCAACACGTTCTG AAAATGGTGCTCGAATGTTAGAAGCCATTATTGAAGGTCAAATGTTACCTGCAATATCACTTGCATTATTAAATAAATTA GCGGCTCGTGAAGATGTACATCGTATTTATTTGACAGTGAAAGACGGCGAGTTTTTTGGTGAAGTGGAGTAA Protein sequence : MIRIELPTLIGKLNAQTKLALEQAASVCISRQNSEVTFEHLLFSLLENPLSDVRVLIKQAGLDHDVLKQKIGAVMARSND SHETYPAFSPLLVELLQDAWLLSSIELNETELRSGAIFLAALLRSDRYLEFSLHDLLKSFNCETLRKNFSILTSGSTESP APLDTSKSVSVLNDSTTALSRFCCNFTEQARKGELDPVICRDAEINLMIDILCRRRKNNPIVVGDAGVGKSAVVEGLALR IVENKVPESLRDVELMSLDLGRLQAGASVKGEFEKRLKGLIDEVKASSTPIILFIDEAHTLIGAGNQDGNDAANLLKPAL ARGELCTIAATTWKEYKKYFEKDPALNRRFQLVKLDEPSVEQAVDILRGLHQVYEKAHKVLISDEALRAAAELSARYVSG RQLPDKAIDVLDTACARIAINLSSPPRRIGELENICYQRQLEINMLNRQKKLARNIDEERLDELLKLEVETRALIKKLHD AWEIQREVVEKVIIIRQSILDDSVAISTGIDSDTDSDTDTDVSVETESTNIAVESASIAPQKKTPEQENELREQLKSLYA ELAAIPHSEVLMHPEVDAEQIAEVIADWTGVPVEQMNADELTKITNLPQLLGATIKGQDTALATIHRHMLTSRADLRRPG RPKGAFLLVGPSGVGKTETVLQLAEKLYGGRQFLTTINMSEYQEKHTVSRLIGSPPGYVGFGEGGVLTEAIRKMPYSIVL LDEVEKAHPDVLNLFYQAFDKGEMADGEGRLIDCQNIVFFLTSNLAYQSIVDHRIETGIIEDKIYPELAAFFKPALLARM EVVVYRPLGESILKQIICGKLSRLETLFMSRYKAEVKIDDSLIDEILRRSTRSENGARMLEAIIEGQMLPAISLALLNKL AAREDVHRIYLTVKDGEFFGEVE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| aec27 | AAQ96721.1 | Aec27 | Not tested | AGI-1 | Protein | 0.0 | 57 |
| aec27 | YP_851418.1 | ATPase | Not tested | PAI II APEC-O1 | Protein | 0.0 | 57 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| PCNPT3_08420 | YP_007640460.1 | ClpV protein | VFG2084 | Protein | 0.0 | 68 |
| PCNPT3_08420 | YP_007640460.1 | ClpV protein | VFG2076 | Protein | 3e-142 | 41 |
