Name : nrdE (SAI8T7_1005680) Accession : YP_007622864.1 Strain : Staphylococcus aureus ST228 Genome accession: NC_020568 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Ribonucleoside-diphosphate reductase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.17.4.1 Position : 760856 - 763012 bp Length : 2157 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAAAAAACAAAGACGTTATTGAATTTAAGAACAAGGTGGGTAATTTTAATGAAAACCATGGAAGAGAAAAAGTACAA TCATATTGAATTAAATAATGAGGTCACTAAACGAAGAGAAGATGGATTCTTTAGTTTAGAAAAAGACCAAGAAGCTTTAG TAGCTTATTTAGAAGAAGTAAAAGACAAAACAATCTTCTTCGATACTGAAATCGAGCGTTTACGTTATTTAGTAGACAAC GATTTTTATTTCAATGTGTTTGATATTTATAGTGAAGCGGATCTAATTGAAATCACTGATTATGCAAAATCAATCTCGTT TAATTTTGCAAGTTATATGTCAGCTAGTAAATTTTTCAAAGATTACGCTTTGAAAACAAATGATAAAAGTCAATACTTAG AAGACTATAATCAACACGTTGCCATTGTTGCTTTATACCTAGCAAATGGTAATAAAGCACAAGCTAAACAATTTATTTCT GCTATGGTTGAACAAAGATATCAACCAGCGACACCAACATTTTTAAACGCAGGCCGTGCGCGTCGTGGTGAGCTAGTGTC ATGTTTCTTATTAGAAGTGGATGACAGCTTAAATTCAATTAACTTTATTGATTCAACTGCAAAACAATTAAGTAAAATTG GGGGCGGCGTTGCAATTAACTTATCTAAATTGCGTGCACGTGGTGAAGCAATTAAAGGAATTAAAGGCGTAGCGAAAGGC GTTTTACCTATTGCTAAGTCACTTGAAGGTGGCTTTAGCTATGCAGATCAACTTGGTCAACGCCCTGGTGCTGGTGCTGT GTACTTAAATATCTTCCATTATGATGTAGAAGAATTTTTAGATACTAAAAAAGTAAATGCGGATGAAGATTTACGTTTAT CTACAATATCAACTGGTTTAATTGTTCCATCTAAATTCTTCGATTTAGCTAAAGAAGGTAAGGACTTTTATATGTTTGCA CCTCATACAGTTAAAGAAGAATATGGTGTGACATTAGACGATATCGATTTAGAAAAATATTATGATGACATGGTTGCAAA CCCAAATGTTGAGAAAAAGAAAAAGAATGCGCGTGAAATGTTGAATTTAATTGCGCAAACACAATTACAATCAGGTTATC CATATTTAATGTTTAAAGATAATGCTAACAGAGTGCATCCGAATTCAAACATTGGACAAATTAAAATGAGTAACTTATGT ACGGAAATTTTCCAACTACAAGAAACTTCAATTATTAATGACTATGGTATTGAAGACGAAATTAAACGTGATATTTCTTG TAACTTGGGCTCATTAAATATTGTTAATGTAATGGAAAGCGGAAAATTCAGAGATTCAGTTCACTCTGGTATGGACGCAT TAACTGTTGTGAGTGATGTAGCAAATATTCAAAATGCACCAGGAGTTAGAAAAGCTAACAGTGAATTACATTCAGTTGGT CTTGGTGTGATGAATTTACACGGTTACCTAGCAAAAAATAAAATTGGTTATGAGTCAGAAGAAGCAAAAGATTTTGCAAA TATCTTCTTTATGATGATGAATTTCTACTCAATCGAACGTTCAATGGAAATCGCTAAAGAGCGTGGTATCAAATATCAAG ACTTTGAAAAGTCTGATTATGCTAATGGCAAATATTTCGAGTTCTATACAACTCAAGAATTTGAACCTCAATTCGAAAAA GTACGTGAATTATTCGATGGTATGGCTATTCCTACTTCTGAGGATTGGAAGAAACTACAACAAGATGTTGAACAATATGG TTTATATCATGCATATAGATTAGCAATTGCTCCAACACAAAGTATTTCTTATGTTCAAAATGCAACAAGTTCTGTAATGC CAATCGTTGACCAAATTGAACGTCGTACTTATGGTAATGCGGAAACATTTTACCCTATGCCATTCTTATCACCACAAACA ATGTGGTACTACAAATCAGCATTCAATACTGATCAGATGAAATTAATCGATTTAATTGCGACAATTCAAACGCATATTGA CCAAGGTATCTCAACGATCCTTTATGTTAATTCTGAAATTTCTACACGTGAGTTAGCAAGATTATATGTATATGCGCACT ATAAAGGATTAAAATCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAA Protein sequence : MEKTKTLLNLRTRWVILMKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDN DFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFIS AMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKG VLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFA PHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLC TEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVG LGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEK VRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQT MWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 2e-134 | 43 |