Gene Information

Name : nrdE (SAI5S5_1005640)
Accession : YP_007620875.1
Strain : Staphylococcus aureus ST228
Genome accession: NC_020566
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Ribonucleoside-diphosphate reductase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.17.4.1
Position : 760894 - 763050 bp
Length : 2157 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGAAAAAACAAAGACGTTATTGAATTTAAGAACAAGGTGGGTAATTTTAATGAAAACCATGGAAGAGAAAAAGTACAA
TCATATTGAATTAAATAATGAGGTCACTAAACGAAGAGAAGATGGATTCTTTAGTTTAGAAAAAGACCAAGAAGCTTTAG
TAGCTTATTTAGAAGAAGTAAAAGACAAAACAATCTTCTTCGATACTGAAATCGAGCGTTTACGTTATTTAGTAGACAAC
GATTTTTATTTCAATGTGTTTGATATTTATAGTGAAGCGGATCTAATTGAAATCACTGATTATGCAAAATCAATCTCGTT
TAATTTTGCAAGTTATATGTCAGCTAGTAAATTTTTCAAAGATTACGCTTTGAAAACAAATGATAAAAGTCAATACTTAG
AAGACTATAATCAACACGTTGCCATTGTTGCTTTATACCTAGCAAATGGTAATAAAGCACAAGCTAAACAATTTATTTCT
GCTATGGTTGAACAAAGATATCAACCAGCGACACCAACATTTTTAAACGCAGGCCGTGCGCGTCGTGGTGAGCTAGTGTC
ATGTTTCTTATTAGAAGTGGATGACAGCTTAAATTCAATTAACTTTATTGATTCAACTGCAAAACAATTAAGTAAAATTG
GGGGCGGCGTTGCAATTAACTTATCTAAATTGCGTGCACGTGGTGAAGCAATTAAAGGAATTAAAGGCGTAGCGAAAGGC
GTTTTACCTATTGCTAAGTCACTTGAAGGTGGCTTTAGCTATGCAGATCAACTTGGTCAACGCCCTGGTGCTGGTGCTGT
GTACTTAAATATCTTCCATTATGATGTAGAAGAATTTTTAGATACTAAAAAAGTAAATGCGGATGAAGATTTACGTTTAT
CTACAATATCAACTGGTTTAATTGTTCCATCTAAATTCTTCGATTTAGCTAAAGAAGGTAAGGACTTTTATATGTTTGCA
CCTCATACAGTTAAAGAAGAATATGGTGTGACATTAGACGATATCGATTTAGAAAAATATTATGATGACATGGTTGCAAA
CCCAAATGTTGAGAAAAAGAAAAAGAATGCGCGTGAAATGTTGAATTTAATTGCGCAAACACAATTACAATCAGGTTATC
CATATTTAATGTTTAAAGATAATGCTAACAGAGTGCATCCGAATTCAAACATTGGACAAATTAAAATGAGTAACTTATGT
ACGGAAATTTTCCAACTACAAGAAACTTCAATTATTAATGACTATGGTATTGAAGACGAAATTAAACGTGATATTTCTTG
TAACTTGGGCTCATTAAATATTGTTAATGTAATGGAAAGCGGAAAATTCAGAGATTCAGTTCACTCTGGTATGGACGCAT
TAACTGTTGTGAGTGATGTAGCAAATATTCAAAATGCACCAGGAGTTAGAAAAGCTAACAGTGAATTACATTCAGTTGGT
CTTGGTGTGATGAATTTACACGGTTACCTAGCAAAAAATAAAATTGGTTATGAGTCAGAAGAAGCAAAAGATTTTGCAAA
TATCTTCTTTATGATGATGAATTTCTACTCAATCGAACGTTCAATGGAAATCGCTAAAGAGCGTGGTATCAAATATCAAG
ACTTTGAAAAGTCTGATTATGCTAATGGCAAATATTTCGAGTTCTATACAACTCAAGAATTTGAACCTCAATTCGAAAAA
GTACGTGAATTATTCGATGGTATGGCTATTCCTACTTCTGAGGATTGGAAGAAACTACAACAAGATGTTGAACAATATGG
TTTATATCATGCATATAGATTAGCAATTGCTCCAACACAAAGTATTTCTTATGTTCAAAATGCAACAAGTTCTGTAATGC
CAATCGTTGACCAAATTGAACGTCGTACTTATGGTAATGCGGAAACATTTTACCCTATGCCATTCTTATCACCACAAACA
ATGTGGTACTACAAATCAGCATTCAATACTGATCAGATGAAATTAATCGATTTAATTGCGACAATTCAAACGCATATTGA
CCAAGGTATCTCAACGATCCTTTATGTTAATTCTGAAATTTCTACACGTGAGTTAGCAAGATTATATGTATATGCGCACT
ATAAAGGATTAAAATCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAA

Protein sequence :
MEKTKTLLNLRTRWVILMKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDN
DFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFIS
AMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKG
VLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFA
PHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLC
TEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVG
LGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEK
VRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQT
MWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1481 YP_001800875.1 ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Not tested Not named Protein 2e-134 43