|
Name : SAI5S5_1017480 (SAI5S5_1017480) Accession : YP_007622007.1 Strain : Staphylococcus aureus ST228 Genome accession: NC_020566 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease lctP homolog Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2371812 - 2373410 bp Length : 1599 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAGTAAATACGTTTAACCCATTTGATAATTTATTATTATCGTCTTTAATTGCAGCAATACCGATTGTACTGTTTTT ACTATGTTTAACTGTTTTTAAAATGAAAGGTATTTATGCAGCTATTACAACACTTGTTGTAACATTACTAATTGCAATAC CATTTTTCAAATTGCCAGTTGGTATCGCTTCTGGTGCAGTAGTCGAAGGTTTCTTCCAAGGTATCATTCCGATTGGCTAT ATCGTTATGATGGCAGTATTGTTATACAAAATTACTGTTGAATCTGGACAATTTTTAACAATTCAAGATAGTATTACAAA TATTTCACAAGACCAACGTATTCAAGTTTTACTTATTGGATTTGCATTCAACGCATTTTTAGAAGGTGCAGCAGGATTTG GTGTACCAATTGCAATTTGTGCACTTTTATTAACACAATTAGGATTTAATCCATTAAAAGCTGCGATGTTATGTTTAGTC GCAAATGCAGCGTCTGGTGCTTTTGGTGCGATTGGTATCCCTGTAGGTGTTGTAGAAACGTTGAAATTACCTGGAGATGT TTCAGTATTAGGTGTTTCTCAATCAGCAACTTTAACATTGGCAATCATAAATTTCATTATTCCATTCTTACTTATCTTTA TTATTGATGGTTTTAGAGGTGTTAAAGAAACATTACCAGCAATTTTAGTAGTTTCAATCACTTATACACTTACTCAAGGA TTATTAACTGTATTCAGTGGACCTGAATTAGCAGATATTATTCCACCGTTATTAACAATGTTAGCATTAGCAGTATTTTC TAAAAAATTCCAACCAAAACACATTTATCGTGTTAATAAAGATGAAGAAATTGAACCTGCAAAAGCACATTCTGCAAAAG CAGTATTACATGCATGGAGCCCATTCATTGTATTAACAGTCATTGTAATGATTTGGAGTGCGCCATTCTTTAAAAACTTA TTCTTACCAAATGGTGCTTTATCATCATTAGTATTTAAATTCAACTTACCTGGAACAATCAGCGAAGTTACGCATAAACC ATTAGTATTGACTTTAAATATTATTGGACAAACAGGTACAGCTATTTTATTAACTATTATTATTACAATTTTAATGTCTA AAAAGGTTAACTTTAAAGATGCTGTTAGATTATTCGGCGTTACATTTAAAGAGTTGTGGTTACCAGTTCTTACAATTTGT TTCATCTTAGCAATTTCTAAAATCACAACTTATGGTGGTTTAAGTGCAGCAATGGGTCAAGGTATAGCTAAAGCAGGTAA TGTCTTCCCAGTTCTATCACCAATCTTAGGTTGGATAGGTGTGTTTATGACAGGATCAGTTGTAAATAACAATTCATTAT TTGCACCAATTCAAGCTTCTGTTGCACAACAAATTGGAACAAGTGGTTCACTTCTTGTATCTGCTAATACAGTTGGTGGT GTAGCGGCAAAATTGATTTCACCACAATCAATTGCAATTGCAACTGCAGCAGTAAAACAAGTTGGTAAGGAATCAGAATT ATTAAAAATGACATTGAAATACAGTGTATGTTTACTAATATTCATCTGTATTTGGACTTTCATCTTGTCATTATTATAA Protein sequence : MLVNTFNPFDNLLLSSLIAAIPIVLFLLCLTVFKMKGIYAAITTLVVTLLIAIPFFKLPVGIASGAVVEGFFQGIIPIGY IVMMAVLLYKITVESGQFLTIQDSITNISQDQRIQVLLIGFAFNAFLEGAAGFGVPIAICALLLTQLGFNPLKAAMLCLV ANAASGAFGAIGIPVGVVETLKLPGDVSVLGVSQSATLTLAIINFIIPFLLIFIIDGFRGVKETLPAILVVSITYTLTQG LLTVFSGPELADIIPPLLTMLALAVFSKKFQPKHIYRVNKDEEIEPAKAHSAKAVLHAWSPFIVLTVIVMIWSAPFFKNL FLPNGALSSLVFKFNLPGTISEVTHKPLVLTLNIIGQTGTAILLTIIITILMSKKVNFKDAVRLFGVTFKELWLPVLTIC FILAISKITTYGGLSAAMGQGIAKAGNVFPVLSPILGWIGVFMTGSVVNNNSLFAPIQASVAQQIGTSGSLLVSANTVGG VAAKLISPQSIAIATAAVKQVGKESELLKMTLKYSVCLLIFICIWTFILSLL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 9e-76 | 42 |
