Gene Information

Name : BN419_0511 (BN419_0511)
Accession : YP_007605816.1
Strain : Listeria monocytogenes N53-1
Genome accession: NC_020558
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : Internalin B
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 421665 - 423557 bp
Length : 1893 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGAAAGAAAAGCACAACCCAAGAAGGAAGTATTGTTTAATCTCAGGTTTAGCTATTATTTTTAGTTTATGGATAATTAT
TGGAAACGGGGCGAAAGTACAAGCGGAGACTATCACCGTGCCAACGCCAATCAAGCAAATTTTTTCAGATGATGCTTTTG
CAGAAACAATCAAAGACAATTTAAAGAAAAAAAGTGTGACAGATGCAGTGACACAAAATGAATTAAATAGTATAGATCAA
ATCATTGCGAATAATAGTGATATTAAATCCGTTCAAGGAATTCAGTATTTACCCAATGTGACAAAGTTATTTTTAAACGG
GAATAAACTAACAGATATAAAACCCTTAACAAACTTGAAAAATTTAGGATGGCTTTTTTTAGACGAAAATAAAATTAAAG
ACCTAAGTTCGCTCAAGGATCTAAAAAAATTAAAATCACTTTCTTTGGAGCATAATGGTATAAGTGATATAAACGGACTT
GTTCATTTACCACAGCTGGAAAGTTTGTATTTGGGAAATAATAAAATAACGGATATAACGGTTCTTTCACGTTTAACTAA
ACTGGATACTTTGTCTCTCGAAGATAACCAAATTAGTGATATTGTGCCACTTGCAGGTTTAACTAAATTGCAGAACCTAT
ATTTAAGTAAAAATCACATAAGCGATTTAAGAGCATTAGCAGGACTTAAAAATCTAGATGTTTTAGAATTATTTAGCCAA
GAATGTCTTAATAAGCCTATTAATCATCAATCTGATTTGGTCGTTCCGAATACAGTGAAAAACACTGATGGGTCGTTAGT
GACTCCAGAAATAATAAGTGATGATGGCGATTATGAAAAACCTAATGTTAAATGGCATTTACCAGAATTTACAAATGAAG
TGAGTTTTATTTTCTATCAGCCAGTCACTATTGGAAAAGCAAAAGCAAGATTTCATGGGAGAGTAACCCAACCACTGAAA
GAGGTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTGCACC
TAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTGGAATTTTAATA
CGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGTGGAAACGACCGAAAAAGCAGTCAACTTAACC
CGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAGATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCT
AGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAAAGAAGCCCGAAATGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATA
TTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACCGATACGATAAAATGGAATATGACAAAGGGGTTACTGCTTATGCA
AGAGTGAGAAATGCGTCTGGAAATTCGGTTTGGACAAAACCCTACAATACAGCCGGCGCTAAACACGTGAATAAGCTATC
GGTCTACCAAGGTAAAAATATGCGTATCTTGCGCGAAGCCAAAACACCAATTACTACATGGTATCAATTTAGCATTGGTG
GTAAAGTAATTGGTTGGGTCGATACCCGAGCACTTAACACATTCTACAAACAAAGTATGGAAAAACCAACCCGTTTAACT
CGTTATGTCAGCGCCAATAAAGCTGGCGAATCGTACTATAAAGTCCCGGTAGCAGATAATCCAGTCAAAAGGGGTACTTT
AGCCAAGTATAAAAATCAAAAGTTAATTGTTGATTGTCAAGCAACCATCGAAGGTCAACTTTGGTACCGAATAAGGACTA
GTTCCACTTTCATTGGTTGGACGAAAGCAGCTAATTTAAGGGCACAGAAATAA

Protein sequence :
MKEKHNPRRKYCLISGLAIIFSLWIIIGNGAKVQAETITVPTPIKQIFSDDAFAETIKDNLKKKSVTDAVTQNELNSIDQ
IIANNSDIKSVQGIQYLPNVTKLFLNGNKLTDIKPLTNLKNLGWLFLDENKIKDLSSLKDLKKLKSLSLEHNGISDINGL
VHLPQLESLYLGNNKITDITVLSRLTKLDTLSLEDNQISDIVPLAGLTKLQNLYLSKNHISDLRALAGLKNLDVLELFSQ
ECLNKPINHQSDLVVPNTVKNTDGSLVTPEIISDDGDYEKPNVKWHLPEFTNEVSFIFYQPVTIGKAKARFHGRVTQPLK
EVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKVETTEKAVNLT
RYVKYIRGNAGIYKLPREDNSLKQGTLASHRCKALTVDKEARNGGKLWYRLKNIGWTKAENLSLDRYDKMEYDKGVTAYA
RVRNASGNSVWTKPYNTAGAKHVNKLSVYQGKNMRILREAKTPITTWYQFSIGGKVIGWVDTRALNTFYKQSMEKPTRLT
RYVSANKAGESYYKVPVADNPVKRGTLAKYKNQKLIVDCQATIEGQLWYRIRTSSTFIGWTKAANLRAQK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlB CAC20629.1 internalin B Virulence Internalin Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
BN419_0511 YP_007605816.1 Internalin B VFG0076 Protein 0.0 99