Gene Information

Name : BN419_2116 (BN419_2116)
Accession : YP_007607313.1
Strain : Listeria monocytogenes N53-1
Genome accession: NC_020558
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Uncharacterized sodium-dependent transporter yocR
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1715214 - 1716623 bp
Length : 1410 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
TTGATTTTATTAAGACTTCTGAGTATTTACATAGAAAAAGGAAATGGGGATATTATGCAAGAAAATAGAGAAGAATGGGG
CTCAAAAGTCGGATTTATATTAGCATCCGCTGGGTCCGCAATAGGAATTGGTGCAATTTGGAAACTGCCTTATGTGGCTG
CAACTGCAGGAGGTGGCGCATTTTTCTTATTGTTTTTAGTTTTAACTTTGCTCGTTGTTATGCCGCTTTTAATTGCAGAA
TTTGTGATTGGACGAGGTTCTGGCGGTGATGCCGTTCAAGCTTATAAAACACTCGCTCCCGGAACAAAATGGAGTTTACT
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TTAAAACGCTCGCTGGTGGGATTGCCGGAGAAAATCAAGCTAGTTTGCTGCATGATTTCCAAGTGACGACAGCTAATCCA
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AAAAATGAGTAAGTTTATGATGCCGGCCTTATTTATTTTATTTATTGTTTTAATCATCCGGTCTTTGACGCTACCTGGTG
CAATGGAAGGTGTCGCATTTTTCTTACGACCCGATTTTAGTCACTTTACAGCACAAACGGTTCTTATTACGCTTGGTCAG
GCCTTCTTTTCACTCAGTGTAGGGATTTCGGTAATGGTGACTTATAGTTCTTATTTAAATCGTTCGACAAGTTTACCGCA
GTCTGCCATTTCGGTTTCGCTTATGAATGTATTTGTGTCGCTTCTTGCGGGATTGGCCATTTTCCCGGCAGCATTTTCGT
TTAATATTACGCCAGATGCGGGGCCTGGGTTGTTATTCGTTATTTTACCTTCAATTTTTAATCAAATGCCCTTTGGGATG
TTATTCTTTATTATTTTCTTGATTTTATTCTTATTTGCGGCATTAACCTCTAGTTTCTCGATGCTTGAAGCGACGGTTGC
GCCACTGATGAATGCGGGTGTTAATCGTAAAAAAGCAAGTCTTTGGATGGGACTCGTGATTGTTTTGATGGCTATTCCAA
GTGCGCTTAGTTTTGGCGTTTGGAGCGATGTCCAGATTTTTGGACTAAGTATTTTTGATGCTGCCGATTATCTTGTGTCG
AATATTATCTTGCCAGTTGGTGCATTATTTATCGCGATTTTCGTTGGGTATCGATTACCTCGTGAACTTCTTTTAAAAGA
ATTTACCACAAGCAGTCATTTTGGTAAAAAAGTGTTTATTGTTTGGCTTTTTCTTATTAAATATATTGCGCCCATCGCGA
TTATTTTGGTCTTTCTTTCAGCAACTGGTTTAATCGATTTTCTGTTTTAA

Protein sequence :
MILLRLLSIYIEKGNGDIMQENREEWGSKVGFILASAGSAIGIGAIWKLPYVAATAGGGAFFLLFLVLTLLVVMPLLIAE
FVIGRGSGGDAVQAYKTLAPGTKWSLLGKLGVVGASILFSFYSVVGGWIITYLIKTLAGGIAGENQASLLHDFQVTTANP
WISVGATILFILLNVIVISRGVVSGIEKMSKFMMPALFILFIVLIIRSLTLPGAMEGVAFFLRPDFSHFTAQTVLITLGQ
AFFSLSVGISVMVTYSSYLNRSTSLPQSAISVSLMNVFVSLLAGLAIFPAAFSFNITPDAGPGLLFVILPSIFNQMPFGM
LFFIIFLILFLFAALTSSFSMLEATVAPLMNAGVNRKKASLWMGLVIVLMAIPSALSFGVWSDVQIFGLSIFDAADYLVS
NIILPVGALFIAIFVGYRLPRELLLKEFTTSSHFGKKVFIVWLFLIKYIAPIAIILVFLSATGLIDFLF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAR0458 YP_039907.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 3e-61 46
SAS0416 YP_042543.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 3e-61 46