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Name : HCBAA847_1601 (HCBAA847_1601) Accession : YP_007601462.1 Strain : Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 Genome accession: NC_020555 Putative virulence/resistance : Unknown Product : VC_A0114 family type VI secretion protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1538739 - 1540139 bp Length : 1401 bp Strand : + Note : similiar to HCN_1429 of H. cinaedi PAGU611 DNA sequence : ATGGCAAATCAACTAAAAGTTGCTTGGTTTAATGGTTTAAATATTGATAAAATTCATTTTGAACAGCAAGAGAGATATTT TCAAAGAAATATAGATTTAAAAACCATTGAAGTATCAAATAATCTTTATGGAATTATTGATTTAAAATTTTCTAATGAAC TGCTTATACAAGGTAAGATTGCATTAGAAAAAATTTCTGGGATAGCTAAAGATGGAAGTATTTTTAACGCTCCAGAACAA GATTTATTGCCAGAAGCTTTAGAAATCAATTATGAATCATTAGAAAATTCGGTTATAGTATTAAAAATCCCTCTAAGCAC TGCTAGCATTGCTGATGTAGCCCTACAAAATAATTTTCCTAATTCTAAATACCTAACTTTAAGAAGCATTATTGCCTCAA GAACTTATGATGATAACCATAGTGTAGGTATTTCAAGGGAATTATTAGAAGATGAAAAAGATTTACAAAATACAACTTTT ACTCAGGAAAAAATTAACTTAACGCTTGCGAGTTTGAGACTGAAACTCGGAATTTTAGGCAATGCAACACCTGATGAACT TGAGATTCCTATTGCCAAAATTAAAAATATAGATTCAAATAAAAAAATAGAGCTTGAAGAAAATTTTATTCCTACCTGTA TTAATATCAACAAAGTTTCCATTGTCAAGTCTTTTTTAGAAGAAACATTATATTCTATCAAACAACATAAAGAGATGCTT TGGGAAGTTTTTAAAGGCATTGACCAAACAAAAAATACTTTAGATTTCAGCACTTATTTATCTTTAAATCTTCTTAAAAA ATGGTTTTTAATTTTTTCTTACCTTATTCACAAGAACAAATTACACCCCGAATATTTATATGAAAAGCTTATTGAATTTC AGGGGGAACTTGGGGCATTTGGCGTTGAAAATTCCTTTTTAGAATTTATTGCCTACCAACACGATAATTTAAATGAAACT TTTTTTCCTTTAATCAATAATATAAAGATTTTATTTGCTAAAATTACTTCTCCGAGATATTCAATGGCAAAACTTATAGA TAATGGTAATGGTTTCTATGATTTGTTATTTGATAACGCTGGAATTTTAGAAGAATCTGAACTTTTCTTAGCCATTAATG CTGATGTTAATCACGAATATTTATTAAAAAACTTTAAAACACAAAGTAAAATCCATACGCAGAGTAAAATCAAAAATATA GTAGCTACTCAACTTAGAGGATTGAATATTATCCAAATTCCAAATATTCCTTCAGCTATCCCTTATTTAAATGGCTATGT TTATTATAAGCTAGATAAAAAAGATGAATTGTTTAAACATTTTAAAGGAGAAAACGCAATAAGTATTTACCTTACTCATA ATATTAAGAATCCTGATATAAAAATGTGGGCAGTATTTTAA Protein sequence : MANQLKVAWFNGLNIDKIHFEQQERYFQRNIDLKTIEVSNNLYGIIDLKFSNELLIQGKIALEKISGIAKDGSIFNAPEQ DLLPEALEINYESLENSVIVLKIPLSTASIADVALQNNFPNSKYLTLRSIIASRTYDDNHSVGISRELLEDEKDLQNTTF TQEKINLTLASLRLKLGILGNATPDELEIPIAKIKNIDSNKKIELEENFIPTCININKVSIVKSFLEETLYSIKQHKEML WEVFKGIDQTKNTLDFSTYLSLNLLKKWFLIFSYLIHKNKLHPEYLYEKLIEFQGELGAFGVENSFLEFIAYQHDNLNET FFPLINNIKILFAKITSPRYSMAKLIDNGNGFYDLLFDNAGILEESELFLAINADVNHEYLLKNFKTQSKIHTQSKIKNI VATQLRGLNIIQIPNIPSAIPYLNGYVYYKLDKKDELFKHFKGENAISIYLTHNIKNPDIKMWAVF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| HH0250 | NP_859781.1 | hypothetical protein | Not tested | HHGI1 | Protein | 3e-132 | 57 |
