|
Name : ABD1_02530 (ABD1_02530) Accession : YP_007594805.1 Strain : Acinetobacter baumannii D1279779 Genome accession: NC_020547 Putative virulence/resistance : Unknown Product : general secretion pathway protein D Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 287709 - 289985 bp Length : 2277 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCTTTATTGAATCATCAACGTCCACTTTGGGCATTACTTGCAGCAGCCCCATTGATTGCGACAGTAAGTAGCAGTGC CTATGCCCAAACATGGAAGATCAATTTACGTGATGCTGACTTAACTGCCTTTATTAATGAAGTTGCAGACATTACAGGAA AGAACTTCGCTGTAGATCCGAGAGTACGTGGTAATGTCACGGTTATTTCTAATAAGCCATTAAATAAAGATGAAGTTTAT GACCTATTTCTTGGGGTCTTAAATGTAAACGGGGTGGTTGCAATTCCTTCTGGTAATACCATTAAGCTTGTACCGGATAG CAATGTTAAAAACTCGGGAATTCCTTATGATTCTAGAAATAGGGTTCGTGGTGATCAAATCGTTACACGTGTGATTTGGC TGGAAAATACTAATCCAAATGACTTAATTCCAGCACTCCGTCCCTTAATGCCACAATTTGCACATATGGCGGCAATTGCA GGAACCAATGCACTTATTGTTTCTGATAGAGCTGCGAATATTTATCAACTTGAAAATATTATTCGTAACTTGGATGGAAC TGGGCAAAATGATATTGAAGCGATCACGCTTCAGTCGAGCCAAGCAGAAGAAATTATTACCCAGCTTGAAGCGATGAGCG CAACAGGCGCATCTAAAGATTTTAGTGGTGCCCGTATTCGTATTATTGCTGATAATCGGACAAACCGTATTTTAATAAAA GGTGATCCGCAAACACGTAAACGTATTCGTCATATGATTGAGATGCTGGATGTACCTTCGGCAGATCGTTTAGGTGGCTT AAAAGTTTTCCGTTTGAAGTATGCCAGTGCTAAAAACTTGTCTGAAATTTTGCAAGGCTTAGTCACAGGACAGGCAGTAT CTTCATCGAATAATAGTAATAATTCATCTAACTCATCGAATCCGATTAATAGTTTAATTGGTAATAACCAGAATTCTGGT TCAAATACATCGGGTTCAAGTGGTACCTCAATTTCAACTCCTGCAATTAACCTAAACGGTAATTCGAACAGTAGTAATCA GAATAATATCACCAGCTTTAATCAAAACGGTGTGAGTATTATTGCAGATAATGCTCAGAACTCATTAGTAGTTAAAGCTG ATCCCCAATTAATGCGTGAAATTGAATCAGCGATTCAACAACTAGACGTTCGTCGTCAACAAGTGCTTATTGAGGCCGCA ATTATTGAAGTCTCTGGAGATGATGCAGATCAACTTGGAATTCAGTGGGCACTCGGTGATTTATCTAGTGGGATTGGTTT ACTTAGCTTTAGTAATGTAGGGGCGAGTTTATCTTCTATTGCTGCTGGTTATTTATCGGGAGGTTCGGCTGGAGCTGCAT CTGCTATCGCTAATGGAGCTAATAAAGGTAATGGTGCAACTTTAGGATTGGGTAATTTTGATAACTCTCGTAAGGCATAT GGTGCATTAATTCAGGCTCTCAAAACCAATACAAAATCAAACTTACTTTCGACACCGTCCATTGTGACGATGGATAATGA AGAAGCTTATATTGTTGTAGGTCAGAACGTTCCATTTGTCACAGGGTCGGTCACTACCAATAGTACAGGTATCAATCCCT ATACAACTGTTGAGCGTAAAGATGTCGGTGTGACCTTGAAAGTTGTTCCACATATCGGTGAAGGTGGTACAGTTCGTTTA GAAGTAGAGCAAGAAGTTTCTGCTGTTCAAGATAGCCGTGGGCAAGCAGCTGACTTGGTGACAAGTAAGCGCGCTATTAA AACAGCTGTTTTAGCCGAGCATGGGCAGACTGTGGTGCTAGGTGGATTGGTGTCGGATGACACTTCGCTTTCAAGACAAG GTATACCTGGTTTAAGTAGTATTCCTTATGTTGGGCGATTGTTCCGATCAGATAACAGAAGCAATGTAAAACGTAACCTT CTCGTTTTTATTCACCCAACAATTGTGGGTGATGCAAATGATGTACGCCGTTTATCTCAGCAGCGCTATAATCAACTTTA TAGCTTGCAATTGGCTATGGATAAAAATGGCAACTTTGCAAAATTACCTGAGCAAGTTGATGATATTTATAACCAAAAAA TGACCCCGCCGAGTATTGCCTCTAAGCCAAAAAATTACCAACAGGTTCCATCAGGTGGTAAAAGTTCGACCATAACTACG CCGGTAGCTGTAGAACCTACCGTCCAAAAGCAAACACTACAGTTGCCTGATCCTGAAATTAATCGTACTAAAAATACAGT AACAACAACGACACTGCGTCCAAGCACAGCGCCGTAG Protein sequence : MALLNHQRPLWALLAAAPLIATVSSSAYAQTWKINLRDADLTAFINEVADITGKNFAVDPRVRGNVTVISNKPLNKDEVY DLFLGVLNVNGVVAIPSGNTIKLVPDSNVKNSGIPYDSRNRVRGDQIVTRVIWLENTNPNDLIPALRPLMPQFAHMAAIA GTNALIVSDRAANIYQLENIIRNLDGTGQNDIEAITLQSSQAEEIITQLEAMSATGASKDFSGARIRIIADNRTNRILIK GDPQTRKRIRHMIEMLDVPSADRLGGLKVFRLKYASAKNLSEILQGLVTGQAVSSSNNSNNSSNSSNPINSLIGNNQNSG SNTSGSSGTSISTPAINLNGNSNSSNQNNITSFNQNGVSIIADNAQNSLVVKADPQLMREIESAIQQLDVRRQQVLIEAA IIEVSGDDADQLGIQWALGDLSSGIGLLSFSNVGASLSSIAAGYLSGGSAGAASAIANGANKGNGATLGLGNFDNSRKAY GALIQALKTNTKSNLLSTPSIVTMDNEEAYIVVGQNVPFVTGSVTTNSTGINPYTTVERKDVGVTLKVVPHIGEGGTVRL EVEQEVSAVQDSRGQAADLVTSKRAIKTAVLAEHGQTVVLGGLVSDDTSLSRQGIPGLSSIPYVGRLFRSDNRSNVKRNL LVFIHPTIVGDANDVRRLSQQRYNQLYSLQLAMDKNGNFAKLPEQVDDIYNQKMTPPSIASKPKNYQQVPSGGKSSTITT PVAVEPTVQKQTLQLPDPEINRTKNTVTTTTLRPSTAP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00335 | YP_008207800.1 | Type II secretory pathway, component PulD | Not tested | AbaR25 | Protein | 0.0 | 99 |
| BJAB0868_00339 | YP_008211665.1 | Type II secretory pathway, component PulD | Not tested | AbaR26 | Protein | 0.0 | 99 |
