|
Name : polA (M1GAS476_0198) Accession : YP_007586735.1 Strain : Streptococcus pyogenes M1 476 Genome accession: NC_020540 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 166164 - 168806 bp Length : 2643 bp Strand : + Note : similiar to M5005_Spy_0159 of S. pyogenes MGAS5005 DNA sequence : ATGGAAAACAAGAATAAATTACTATTAATTGATGGCTCCTCTGTTGCCTTTCGTGCCTTTTTTGCCCTTTACAATCAAAT TGACCGCTTTAAAAATCATAGCGGTCTCCATACCAATGCCATTTATGGCTTTCATTTGATGCTAGACCACATGATGAAAA GAGTCCGGCCTACTCACGTGCTGGTGGCTTTTGATGCGGGCAAAACCACCTTCCGAACAGAAATGTATGCCGATTATAAG GCGGGTCGCGCTAAAACCCCAGATGAATTTCGTGAGCAGTTTTCTTATATTCGTGAGATGTTGACAGCCCTTGGGATTGC TTATTATGAGTTGGAACACTACGAAGCAGACGATATTATCGGGACGCTTGATAAAATGGCGGAGCGCACAGAAGTGCCTT TTGATGTGACCATTGTCAGTGGTGATAAAGATTTGATCCAGTTAACTGACGAAAATACCGTGGTTGAAATTTCTAAAAAA GGGGTTGCCGAATTTGAAGAATTCACACCGGCTTACCTCATGGAAAAAATGGGCTTGACGCCAAACCAGTTTATTGACCT CAAAGCCTTGATGGGAGATAAATCGGATAACATTCCTGGAGTGACAAAAATTGGAGAAAAAACAGGCCTTAAGCTCCTTC ATGAATTTGGTAGTTTGGAAGGCATTTACGAGCATATTGATGGATTCAAGACCTCAAAAATGAAAGAAAACTTGATCAAT GACCGTGACCAAGCTTTCCTATCTAAAACGCTCGCCACTATCAATACAGCATCTCCTATCACAATTGGCTTAGATGATAT TGTCTACAATGGTCCAGATGTTGCTAGCCTCTCTCAATTTTACGATGAGATGGATTTTGTGCAACTCAAGAAAGGTCTTG CTAGCCAGATGCCTCAAGAGCCAGTAGCTGTCATTTCCTATCAAGAAGTGACCAATGTGTCTGCTGATTTGTTTAGCGCA GAAGACATCTTCTACTTTGAAACGCTTCGGGATAATTACCATCGTGAGGCCATCATTGGTTTTGCTTGGGGACATGGTGA GCAGATTTACGCATCCACAGACCTTAGCCTATTAGCGACGGATAGTTTTAAGCAGGTCTTCCAAAAACCCATTGCCACTT ATGATTTTAAACGTAGCAAGGTCTTGTTGAGCCACTTAGGAATTGAGTTGGTAGCACCTAGCTATGATGCTAGACTAGCT AATTACCTTCTGTCAACTGTAGAAGACAATGAGCTTAGCACCATTGCCCGCATTTTTACTGACATCTCTTTGGAAGAAGA CGATACGGTCTATGGTAAAGGTGCTAAACGGGCTGTTCCTGATAAAGACGTCTTACTAGAACACTTAGCTCGTAAGGTCA AAGTATTATTAGATAGCAAGTCTCAAATGCTAGACAAGCTCACTGCCCATGAGCAACTAGACCTCTATCAGAATATTGAA TTGCCTTTGGCTAATGTCCTTGCTAAAATGGAAATTGAAGGGATCAAGGTTAATAGGGCGACTTTGCAAGATATGGCAGA GCAAAACAAGGTCATTATTGAAGCGCTCACCCAAGAGATTTATGATATGGCTGGCCAAGAATTTAACATTAATTCGCCTA AACAGCTGGGCAGTATCTTGTTTGAGAAGATGCAACTACCTCTTGAGATGACTAAGAAGACCAAAACAGGTTATTCTACA GCTGTTGATGTTTTGGAACGTTTGGCACCGATTGCTCCAATTGTGGCTAAAATTTTGGATTACCGCCAGATTACTAAATT GCAATCCACCTATGTGATTGGTTTACAGGATTATATTCTGGCTGATGGCAAGATTCATACCCGCTATGTGCAGGATCTCA CCCAGACAGGGCGTTTGTCTAGTGTGGACCCTAATCTTCAAAACATTCCCATTCGTTTGGAACAGGGGCGTTTGATTCGT AAGGCCTTTACCCCATCTCATGAAGATGCCGTCTTGTTGAGTTCAGATTACTCACAGATTGAATTGCGCGTGCTAGCACA TATTTCAGGGGATGAGCATTTGATTGCTGCCTTTAATGAAGGGGCAGACATTCATACCTCAACGGCTATGCGTGTGTTTG GGATTGACAAGGCAGCAGATGTTACTGCCAATGACCGCCGTAATGCCAAGGCTGTTAACTTTGGAATTGTGTATGGGATT TCTGATTTTGGTTTGTCAAATAACCTTGGTATCACCCGTAAACAGTCCAAGTCTTACATTGATACCTATTTTGAACGCTA TCCTGGGATTAAAGCCTATATGGAAAATGTGGTGCGTGAGGCTAAAGACAAGGGCTATGTAGAGACCCTCTTTAAGCGTC GCCGTGAATTACCGGATATCAACTCTCGTAATTTCAACGTTCGCTCTTTTGCGGAGCGTACAGCCATCAACTCGCCCATT CAAGGAAGCGCAGCTGATATTCTCAAAATCGCTATGATTAATCTGGATAAGGCCTTGCAAGCAGGTGGTTTTAGAGCTAA AATGCTGCTTCAAGTGCATGATGAAATCGTTTTGGAAGTGCCAAATGATGAGTTGACTGCTATAAAAAAACTTGTCAAAG ACACCATGGAAGCTGCTGTTGATTTAGCTGTTCCTTTATGTGTCGATGAAAGTACTGGGCAGAGCTGGTACGAAGCCAAA TAA Protein sequence : MENKNKLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKNHSGLHTNAIYGFHLMLDHMMKRVRPTHVLVAFDAGKTTFRTEMYADYK AGRAKTPDEFREQFSYIREMLTALGIAYYELEHYEADDIIGTLDKMAERTEVPFDVTIVSGDKDLIQLTDENTVVEISKK GVAEFEEFTPAYLMEKMGLTPNQFIDLKALMGDKSDNIPGVTKIGEKTGLKLLHEFGSLEGIYEHIDGFKTSKMKENLIN DRDQAFLSKTLATINTASPITIGLDDIVYNGPDVASLSQFYDEMDFVQLKKGLASQMPQEPVAVISYQEVTNVSADLFSA EDIFYFETLRDNYHREAIIGFAWGHGEQIYASTDLSLLATDSFKQVFQKPIATYDFKRSKVLLSHLGIELVAPSYDARLA NYLLSTVEDNELSTIARIFTDISLEEDDTVYGKGAKRAVPDKDVLLEHLARKVKVLLDSKSQMLDKLTAHEQLDLYQNIE LPLANVLAKMEIEGIKVNRATLQDMAEQNKVIIEALTQEIYDMAGQEFNINSPKQLGSILFEKMQLPLEMTKKTKTGYST AVDVLERLAPIAPIVAKILDYRQITKLQSTYVIGLQDYILADGKIHTRYVQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPIRLEQGRLIR KAFTPSHEDAVLLSSDYSQIELRVLAHISGDEHLIAAFNEGADIHTSTAMRVFGIDKAADVTANDRRNAKAVNFGIVYGI SDFGLSNNLGITRKQSKSYIDTYFERYPGIKAYMENVVREAKDKGYVETLFKRRRELPDINSRNFNVRSFAERTAINSPI QGSAADILKIAMINLDKALQAGGFRAKMLLQVHDEIVLEVPNDELTAIKKLVKDTMEAAVDLAVPLCVDESTGQSWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 100 |
