|
Name : secA (M1GAS476_1613) Accession : YP_007588126.1 Strain : Streptococcus pyogenes M1 476 Genome accession: NC_020540 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1511050 - 1513569 bp Length : 2520 bp Strand : - Note : similiar to M5005_Spy_1534 of S. pyogenes MGAS5005 DNA sequence : ATGGCCAATATTCTACGCAAAGTTATCGAAAATGACAAAGGCGAACTAAGAAAATTAGAAAAAATTGCAAAAAAAGTAGA ATCCTACGCAGACCAAATGGCGTCATTGTCGGATAGAGATCTACAAGGAAAAACACTTGAATTTAAAGAACGCTATCAAA AAGGTGAGACCCTCGAACAACTATTACCTGAAGCTTTCGCAGTTGTTCGTGAAGCAGCAAAACGTGTGTTGGGCTTGTTC CCTTATCGTGTTCAAATTATGGGAGGAATTGTTCTTCATAACGGGGATGTCCCTGAAATGCGTACTGGTGAAGGAAAAAC TCTTACAGCCACCATGCCAGTTTATCTCAATGCTATTGCTGGTGAGGGTGTTCACGTTATTACTGTTAATGAGTATCTTT CAACGCGTGACGCTACCGAAATGGGTGAAGTGTATAGCTGGTTAGGTCTTTCAGTTGGGATCAACCTAGCTGCTAAGTCT CCTGCTGAAAAACGTGAAGCTTATAATTGTGATATTACTTATTCAACCAACTCTGAAGTCGGTTTTGATTACCTTCGTGA CAACATGGTTGTTCGCCAGGAAGACATGGTACAACGCCCACTCAATTTTGCCTTGGTTGATGAAGTGGACTCAGTCTTAA TTGACGAGGCAAGGACACCTTTAATTGTTTCTGGTGCTGTTAGCTCTGAAACCAATCAATTGTATATTCGTGCTGACATG TTTGTAAAAACTCTGACGTCAGTGGATTATGTTATTGATGTGCCCACTAAAACGATTGGATTAAGCGATTCAGGTATTGA TAAAGCTGAGAGTTACTTTAACTTGAGCAATCTTTACGATATTGAAAATGTAGCCTTGACTCACTTTATAGACAACGCCC TTCGTGCAAACTATATTATGTTGTTAGATATCGATTATGTGGTCAGCGAAGATGGTGAGATTCTTATTGTTGACCAATTT ACAGGTCGTACGATGGAAGGGCGTCGCTTCTCAGACGGCTTGCACCAAGCTATTGAGGCAAAAGAAGGCGTTCGTATTCA GGAAGAATCAAAAACCAGCGCCTCAATCACTTACCAAAATATGTTTCGTATGTACAAAAAATTGGCAGGTATGACTGGTA CTGCGAAGACCGAGGAAGAAGAATTTCGCGAAGTTTATAACATGCGTATTATTCCAATTCCAACCAATCGTCCAATTGCC CGTATTGATCACACTGATTTGCTTTACCCGACCTTAGAATCAAAGTTTAGAGCAGTTGTGGAAGACGTTAAAACGCGTCA TGCAAAAGGACAACCTATCCTTGTAGGTACGGTTGCTGTTGAAACTAGTGATTTGATTTCACGCAAGCTGGTTGAAGCAG GGATTCCTCATGAGGTTTTGAATGCTAAAAATCACTTTAAAGAAGCTCAAATCATTATGAATGCTGGGCAACGTGGTGCT GTTACAATCGCAACTAACATGGCTGGTCGTGGTACTGATATCAAGCTTGGTGAAGGTGTTCGTGAACTTGGTGGGTTATG TGTCATTGGTACAGAGCGTCATGAAAGCCGTCGTATCGATAACCAGCTTCGTGGACGTTCAGGTCGTCAAGGAGATCCAG GTGAATCCCAATTCTATCTTTCATTAGAAGATGATTTGATGAGACGTTTCGGCTCTGATCGTATAAAAGCCTTTTTGGAT CGGATGAAATTAGATGAAGAAGACACTGTTATTAAATCAGGTATGTTAGGGCGTCAAGTGGAATCTGCTCAAAAACGGGT TGAAGGAAATAACTATGATACCCGTAAACAGGTCTTACAATATGATGATGTGATGCGTGAACAGCGTGAAATTATCTATG CTAACCGTCGTGATGTCATAACTGCTAATCGAGATCTTGGCCCAGAAATTAAAGCTATGATCAAGCGTACTATCGACCGT GCTGTAGATGCTCATGCACGTAGCAATCGTAAAGATGCTATAGATGCTATTGTAACTTTTGCTAGGACCTCGCTGGTACC AGAAGAGTCTATTAGTGCTAAAGAGTTACGTGGTTTAAAAGATGATCAAATCAAAGAGAAGCTTTATCAAAGAGCGCTTG CTATCTACGACCAGCAACTATCAAAACTTCGTGATCAAGAAGCTATTATTGAATTCCAAAAAGTACTCATTTTGATGATT GTGGATAACAAATGGACTGAACACATTGATGCCTTAGATCAACTTCGTAATGCTGTTGGACTTCGGGGGTATGCTCAAAA TAACCCTGTGGTGGAATACCAAGCAGAAGGTTTCAAGATGTTCCAAGATATGATTGGTGCTATCGAGTTTGATGTAACAC GTACCATGATGAAAGCACAAATTCACGAACAAGAACGTGAACGTGCAAGTCAACGTGCCACAACAGCAGCACCTCAAAAC ATCCAATCGCAGCAGTCAGCTAACACCGATGATTTACCCAAAGTGGAGCGTAACGAAGCTTGTCCATGTGGTTCAGGCAA AAAATTCAAAAATTGTCACGGTCGTAAATCCTTCTCATAA Protein sequence : MANILRKVIENDKGELRKLEKIAKKVESYADQMASLSDRDLQGKTLEFKERYQKGETLEQLLPEAFAVVREAAKRVLGLF PYRVQIMGGIVLHNGDVPEMRTGEGKTLTATMPVYLNAIAGEGVHVITVNEYLSTRDATEMGEVYSWLGLSVGINLAAKS PAEKREAYNCDITYSTNSEVGFDYLRDNMVVRQEDMVQRPLNFALVDEVDSVLIDEARTPLIVSGAVSSETNQLYIRADM FVKTLTSVDYVIDVPTKTIGLSDSGIDKAESYFNLSNLYDIENVALTHFIDNALRANYIMLLDIDYVVSEDGEILIVDQF TGRTMEGRRFSDGLHQAIEAKEGVRIQEESKTSASITYQNMFRMYKKLAGMTGTAKTEEEEFREVYNMRIIPIPTNRPIA RIDHTDLLYPTLESKFRAVVEDVKTRHAKGQPILVGTVAVETSDLISRKLVEAGIPHEVLNAKNHFKEAQIIMNAGQRGA VTIATNMAGRGTDIKLGEGVRELGGLCVIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGESQFYLSLEDDLMRRFGSDRIKAFLD RMKLDEEDTVIKSGMLGRQVESAQKRVEGNNYDTRKQVLQYDDVMREQREIIYANRRDVITANRDLGPEIKAMIKRTIDR AVDAHARSNRKDAIDAIVTFARTSLVPEESISAKELRGLKDDQIKEKLYQRALAIYDQQLSKLRDQEAIIEFQKVLILMI VDNKWTEHIDALDQLRNAVGLRGYAQNNPVVEYQAEGFKMFQDMIGAIEFDVTRTMMKAQIHEQERERASQRATTAAPQN IQSQQSANTDDLPKVERNEACPCGSGKKFKNCHGRKSFS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 2e-143 | 41 |
