Name : NJAUSS_0327 (NJAUSS_0327) Accession : YP_007570295.1 Strain : Streptococcus suis SC070731 Genome accession: NC_020526 Putative virulence/resistance : Unknown Product : RecG-like helicase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 335354 - 337372 bp Length : 2019 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAAGACTATGTGATGAATTATCGGTTTTGCCAGGGATTGGTCCAAAATCGGCTGAAAAATTCTTAAAAATTAGCAT TCAGAATATTAATGATTTGCTGACTTACTATCCATTTAGATATGAAGATTTTGAGAGTAAGTCTATTTATGATTTGCAGG ATGGGGAGAAGGCAGTGGTAGTTGGGGAGGTGGTATCTCCAGCTAATGTACAGTATTATGGTTACAAAAGAAATAGACTC CGTTTTTCAATGAAACAGGGTGAGGTTGTCTTAGCAGTTTCGTTTTTTAATCAGCCTTATTTAGCAGATAAGATTGTTTT GGGGCAGGATATTGCAGTTTGGGGAAAGTGGGATAAGGCTAAGGCAAGTTTGACAGGAATGAAAATTTTGGCTCAAGTAT CAGATGAGCTCCAACCTGTCTATCATGTGGCGCAAGGGATTTCGCAAGTAAATTTGGTTAAGGCTATTAAAACAGCTATT GATCAGGGATATTTGCATTTATTAGAGGAGAACTTGCCATCAGTTTTACGAGAGCGCTATCGGTTAATGAATCGCCGAGA GGCGGTTTTTGCGATGCATTTTCCTACAAATTTAGAAGAGTATAGACAAGCTTTGCGACGTATGAAGTTTGAGGAATTAT TTTATTTTCAATTACAGTTGCAAATGCTGAAAGCCAACAATCGTGATATTTTGAATGGTTTGAAGATTGCCTATGATGCT GATAGATTGGCTATGCAAATAAGACAATTGCCGTTTGTCTTAACAGATGCTCAGTCTGGGGCTTTGGCTGAAATACTATC AGATATGAAGTCCTATGGGCACATGAATCGTTTGTTACAAGGGGATGTTGGTTCAGGGAAGACAGTAGTTGCTGGATTGG CTATGTTTGCTGCTGTGACTGCGGGGATGCAGGCTGCAATTATGGTGCCGACAGAAATTTTGGCTGAGCAACACTTTGAG AGTTTGCGCCAGCTTTTTCCAGAACTTTCTATTGCTCTTTTGACAGGTGGAATGAAAGCTGCGGAGCGTCGTACTGCTTT AGAGGCGATTTCTAGTGGTCAGGTAGACATCATTGTAGGAACTCATGCTCTTATACAGGAAAGTGTGACGTACCATAAGC TTGGTTTGGTTGTGACGGATGAGCAACATCGTTTTGGTGTTAAACAGCGCCGTCTGTTTCGTGAGAAGGGTGATAATCCG GATGTGCTTATGATGACTGCTACACCTATTCCTCGGACGTTAGCCATTACAGCTTTTGGAGATATGGATGTATCAATTAT TAATCAGTTACCTGCTGGTCGAAAGCCAATTATCACTCGCTGGGTCAAACATCAACAGCTGCCCACGGTCTTAGATTGGT TGGAGCGGGAGTTAGAAGTGGGTGCTCAGGTTTATTTTATCTCTCCGCTGATTGAAGAATCTGAGGCTCTAGATTTAAAG AATGCTGTAGATCTACAATCTGATTTACAGGCGCATTTTGGAGAGCAAGTTACAGTGGATTTGTTACACGGTAAGATGAA GAATGACGAGAAAGATGCCATCATGCAGGCTTTTAAGGAGCGAAAAACGAATATTTTGGTTTCTACCACTGTTATTGAAG TCGGAGTCAATGTGCCCAATGCAACGGTGATGGTTATTATGGATGCTGATCGTTTTGGTTTAAGCCAATTACATCAGTTG AGAGGGCGTGTAGGACGTGGTCATAAGCAGTCTTATGCAGTGTTAGTTGCTAATCCTAAAACAGAGTCTGGTAAGGAACG CATGAAAATTATGACAGAGACGACAGATGGTTTTATTTTGGCTGAAGCTGACTTAAAAATGCGTGGGTCTGGAGAAATAT TTGGAACTCGTCAATCAGGTTTGCCAGAATTTCAAGTTGCAAATATTATCGAGGACTATCCAATTTTAGAGGAAGCAAGG CGAGTTGCTAGTCAGATTGTTAGCGTGGAAAATTGGCAGGAGGACCCTAATTGGTCGATTTTGCTTGCTAATTTGAAAGA TCGAGAGGAATTGGACTAG Protein sequence : MKRLCDELSVLPGIGPKSAEKFLKISIQNINDLLTYYPFRYEDFESKSIYDLQDGEKAVVVGEVVSPANVQYYGYKRNRL RFSMKQGEVVLAVSFFNQPYLADKIVLGQDIAVWGKWDKAKASLTGMKILAQVSDELQPVYHVAQGISQVNLVKAIKTAI DQGYLHLLEENLPSVLRERYRLMNRREAVFAMHFPTNLEEYRQALRRMKFEELFYFQLQLQMLKANNRDILNGLKIAYDA DRLAMQIRQLPFVLTDAQSGALAEILSDMKSYGHMNRLLQGDVGSGKTVVAGLAMFAAVTAGMQAAIMVPTEILAEQHFE SLRQLFPELSIALLTGGMKAAERRTALEAISSGQVDIIVGTHALIQESVTYHKLGLVVTDEQHRFGVKQRRLFREKGDNP DVLMMTATPIPRTLAITAFGDMDVSIINQLPAGRKPIITRWVKHQQLPTVLDWLERELEVGAQVYFISPLIEESEALDLK NAVDLQSDLQAHFGEQVTVDLLHGKMKNDEKDAIMQAFKERKTNILVSTTVIEVGVNVPNATVMVIMDADRFGLSQLHQL RGRVGRGHKQSYAVLVANPKTESGKERMKIMTETTDGFILAEADLKMRGSGEIFGTRQSGLPEFQVANIIEDYPILEEAR RVASQIVSVENWQEDPNWSILLANLKDREELD |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 3e-96 | 44 |