Gene Information

Name : coxA (C427_5406)
Accession : YP_007546851.1
Strain : Glaciecola psychrophila 170
Genome accession: NC_020514
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome-c oxidase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 5199356 - 5200960 bp
Length : 1605 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGACAACAACAACTGATGACACACAGCATGATTCTCATGCAGATGATCACCATGAACATCATATTCCATACGGCATAAA
ACGTTGGTTATATACCACCAACCATAAAGATATCGGTACTCTATATTTGTGGTTTGCTTTCATCATGTTTCTAACTGGTG
GCGCAATGGCTATGGTAATACGAGCTGAATTGTTTCAACCGGGATTACAAATAGTAGAGCCTCACTTTTTTAATCAAATG
ACCACTGTGCACGGCCTTATCATGGTATTTGGTGCGGTTATGCCTGCCTTTACGGGACTGGCCAACTGGTTAATACCTAT
GATGATAGGTGCGCCAGATATGGCTCTGCCTAGAATGAATAACTGGAGCTTTTGGATATTACCTTTTGCTTTTTTAATTC
TGTTATCTTCATTATTTCTAGAAGGTGGCGGTCCTGCTTTTGGTTGGACCTTCTACGCACCTCTGTCAACAACATACAGT
GCCGACAGTACGGCATTGTTTGTGTTTGCTGTGCACATCATGGGCGCTTCATCCATCATGGGTGCAATTAACGTCATCGT
GACTATTTTCAACATGCGCGCCCCGGGTATGACTTGGATGAAGATGCCTTTGTTTGTTTGGACATGGTTAATTACAGCGT
TCTTGTTGATTGCTGTTATGCCTGTACTGGCGGGTGCGGTAACGATGGTGCTGACCGATAAATTCTTTGGTACCAGTTTC
TTTGATGCTGCCGGTGGTGGTGATCCTGTCATGTTCCAGCATATCTTTTGGTTCTTCGGGCACCCCGAGGTGTACATTAT
GATACTGCCTGCATTTGGTATCATTTCACAAATTATACCTACTTTCGCTCGTAAGCCGCTATTTGGATATGCCTCTATGG
TTTACGCCACGGCTTCTATCGCATTGTTGTCATTTATTGTATGGGCACACCATATGTTCACGACAGGCATGCCGGTGGCA
GCGGAGCTGTTTTTCATGTTCGCGACTATGTTGATATCGGTTCCCACAGGGGTGAAAGTCTTTAACTGGGTGGCGACTAT
GTGGCGCGGTTCGATGACTTTCGAAGTGCCTATGTTGTTTGCAATCGCCTTTATAGTGTTATTTACCATAGGTGGATTAT
CTGGACTAATGTTGGCCATAGTACCAGTGGACTTCCAATATCATGATACTTACTTTGTAGTTGCGCATTTCCATTATGTG
TTAGTAACCGGTGCTATATTCTCAATTATGGCTGCGGTGTATTACTGGCTACCTAAGTGGACTGGTAAAATGTTCCATAT
TGGTTTGGCGAAATGGCATTTCTGGTGTTCATTAGTATCGGTTAACGTGTTGTTTTTCCCTATGCACTTTGTAGGGTTAG
CGGGTATGCCACGTCGTATTCCAGACTATGCGTTACAGTTCGCAGACTTTAATAAGTGGATCAGTATTGGTGGTTTTGCC
TTTGGTCTATCGCAGCTGATTTTCTTAGTCTTGTTGGTTAAGGCTTGTAAGAAGCAAGGCGACCCAGTATCTGCCCAAGT
GTGGGAAGGAGCTGAAGGTTTAGAGTGGGAAATCCCATCTCCAGCACCTTATCACACCTTTGAAACACCGCCGGTTGTGA
AATAA

Protein sequence :
MTTTTDDTQHDSHADDHHEHHIPYGIKRWLYTTNHKDIGTLYLWFAFIMFLTGGAMAMVIRAELFQPGLQIVEPHFFNQM
TTVHGLIMVFGAVMPAFTGLANWLIPMMIGAPDMALPRMNNWSFWILPFAFLILLSSLFLEGGGPAFGWTFYAPLSTTYS
ADSTALFVFAVHIMGASSIMGAINVIVTIFNMRAPGMTWMKMPLFVWTWLITAFLLIAVMPVLAGAVTMVLTDKFFGTSF
FDAAGGGDPVMFQHIFWFFGHPEVYIMILPAFGIISQIIPTFARKPLFGYASMVYATASIALLSFIVWAHHMFTTGMPVA
AELFFMFATMLISVPTGVKVFNWVATMWRGSMTFEVPMLFAIAFIVLFTIGGLSGLMLAIVPVDFQYHDTYFVVAHFHYV
LVTGAIFSIMAAVYYWLPKWTGKMFHIGLAKWHFWCSLVSVNVLFFPMHFVGLAGMPRRIPDYALQFADFNKWISIGGFA
FGLSQLIFLVLLVKACKKQGDPVSAQVWEGAEGLEWEIPSPAPYHTFETPPVVK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 2e-90 45