Name : lldP-1 (HPOK310_0147) Accession : YP_007537781.1 Strain : Helicobacter pylori OK310 Genome accession: NC_020509 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 153743 - 155389 bp Length : 1647 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGCTGAGTGCTTTAGTGGCACTATCGCCTATTGCGCTCTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTATTGCTTTCAATCCTTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCCGCTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGTTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGCT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTGGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGCCTG ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATTCCTATTACGGCAATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAAACTTTTCCTGCAGTGGCTGTTACCGGGGTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCACAACTCCCAGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCATTGATCGCTACCACTTTGTTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAGCACATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCTGCAATCAGCACACAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGTGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGTTTTGCGTTTGAATTTAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCCATTTTCCTGTCGTGTTCAAATTCCCTCTGATTCTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTATTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGTGCCACGCTCGCTTT AGCGTTAGGGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGCTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGCT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACGGTAAAATACTCCGTCGCTTTAGCGATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCCATCATTCCTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLLLSILIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGVSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKHIFTSNGKEPAISTQKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATHFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALGDTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSVALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPIIP |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 5e-129 | 55 |