Name : lldP-1 (HPOK113_0148) Accession : YP_007536262.1 Strain : Helicobacter pylori OK113 Genome accession: NC_020508 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 156325 - 157974 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCAATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCGTTATCGCCTATTGCACTCTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCATTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCTGCTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGCTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGGATTTTGGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATTGGTT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATTCCTATTACGGCAATGGCTGGCGTGGTGGGTATCCCTGA GTTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGAGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCAGTGGCTGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATCGTGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCACAACTCCCGGATATTATTTCAGCCTTAGTGTCATTGATCGCTACCACTTTGTTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAGCGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCTACGATCAGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATTACGATTATCATATGGACACAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTTAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCCATTTTCCTGTCGTGTTCAAATTCCCTCTGATTCTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGTGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGGGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGTTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGCT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACGGTAAAATACTCCGTTGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTATCTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCGGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGNIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMAGVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIVQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPTISTEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATHFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALGDTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSVALAIIMGIIFTLIAYVFPFIIPVTPT |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-132 | 55 |