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Name : copB (lilo_0787) Accession : YP_007508114.1 Strain : Lactococcus lactis IO-1 Genome accession: NC_020450 Putative virulence/resistance : Resistance Product : copper-potassium transporting ATPase B Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 847812 - 849890 bp Length : 2079 bp Strand : - Note : K01533 Cu2+-exporting ATPase DNA sequence : ATGTCAAATAAAACTCATTCGTCTAATTACGATGAAATGATGTCTGAGCATCATCATAATCATGAAATGATGGATATGGA GCACGAAAACCATGAGATGCACAATATGGATAATATGCATGATATGGACAATATGGATATGATGAATCATGGAGGACACA TGATGCATATGGGTGATATGAGTAAAAAGCTCAAAGTTGCCATTATTCTAATGATTCCGCTTCTACTCATTTCACCAATC GCGGGCTTTACTATCCTTAAATTTCCTGGAAGTGAAATTTTGCAACTCATCCTTGGTACAATTATCTTCTTTTACTCTGG GACTCCTTTTTTTAGCGGAGCAAAAGGTGAATTAAAAAGCCGTAAGCCAGCCATGATGATGCTGATTACAATGGGAATTA CTGTTGCCTATGCTTATTCTGTTTACGCCACAATTATGAGTCTTAACGGACATATGGGCATGAACTTCTGGTTTGAACTG GCAACTTTAATTGTCATTATGTTGATTGGTCACCTGATTGAGATGAAAGCAATCATGGGTGCTGGCGATGCATTGAAAGA TTTAGCAAGCCTTGTTCCCAAAAAAGCTCACTTAAAAAGTGGGAAGGATGTGGAGCTTTCAGAACTAAAAGTTGGCGATT TACTTTTAGTGAAAGAAAATGAAAAAATACCTGCAGATGGCCTTATATTAAGTGAAGCGCTCGTTGATGAGTCAATGATT ACTGGTGAAAGCCGAGCAGTCAATAAAAAAATAAATGACCTTGTTTATGGTGGTTCCCTCAATCAAAACCAACCATTTGA GATGAAAGTCACAACCCTTGGAAAAGATTCATTTCTCAATCAAGTGGCCGAATTAGTCAAGAAAGCCCAAGCTCAAAAAT CTAATTTGGAAAATATGGCAGATAGAGTGGCTGGTTACCTTTTCTATGCCGCACTTATTGTCGGTATCTTCTCATTAATT TTTTGGACAATTAGTTCTAACTTTAGTTTTGCTCTACTTCTTGCGGTTTCTGTTTTTGTAATTGCATGTCCACACGCTTT AGGTCTTGCGGTTCCACTTGTTGTTTCTCGCTTAACCAGTATTTCTGCTAAAAATGGTTTATTAATTCAAAACAGAACCT CTTTGGAAAAAATAAATACAATTAAATATGCCTTAATGGATAAAACAGGAACATTAACTGACGGTAAGTTTATTGTTCGT AATGTTATTGATTTTACTGATGAAACAGACATTCTCCAAATCATGGCAGCACTTGAAGGAAGTTCCACTCACCCGATTGC TCAATCAATCGTTTCAGCTGCTAAACCTCTTGAAAATCTAAAAGTTGAAGCGGTTGAAAATATTCCAGGAGTTGGAATTA AAGGGCAAGTTAATCAAAACTTTTATCAAATTGTTAACTATAAATATCTTCGTGAAAATCAACTTTCTTATGATGAACAA AAGATTGCTCAATATTTAGATTTAGGTTTAACTGTATCTTTCCTAATCAATGAACAACAAGATGTTTTAGGATTTATTGC CTTAGGAGATTCTCCTAAAGCAGACGCGAAAGCCTTTATCAATGGTTTATTAGCCCAAGGAATTACCCCTGTTATGCTCA CGGGTGATAATAAAGAAACTGCTCAAAAAATTGCTAGTGCACTAAATATTCCCGAATTTAGAGCGGAATTAAAACCTGAA GATAAAGCAGAAATTGTGAAAGAGTACCAAAAGAAAGCCGGCGTGCTTTTCATTGGTGATGGTGTCAATGATTCCCCAGC TCTTGCAACTGCTACGATTGGTTTTGCGATTGGAGCAGGAACTTCGGTTGCTATCAGTACCGCTGATGTCGTCCTAGTTA ACTCCAATCCAAGTGACGTCCTGGATATGATTAATATCTCCAAACGCATGCTTAGAAAAATGAAACAAAACCTCTGGTTT GGAGCAGGCTATAACATTATTGCTATTCCTGTTGCAGCGGGTATTCTTTATCCATTTACAGGGATTTATATTGACCCTCT CATTGCAGCAGTCCTGATGTCAATCTCAACCGTGATTGTCTCAATCAATGCGATGGGATTGAGGTATGATAAAAAATAG Protein sequence : MSNKTHSSNYDEMMSEHHHNHEMMDMEHENHEMHNMDNMHDMDNMDMMNHGGHMMHMGDMSKKLKVAIILMIPLLLISPI AGFTILKFPGSEILQLILGTIIFFYSGTPFFSGAKGELKSRKPAMMMLITMGITVAYAYSVYATIMSLNGHMGMNFWFEL ATLIVIMLIGHLIEMKAIMGAGDALKDLASLVPKKAHLKSGKDVELSELKVGDLLLVKENEKIPADGLILSEALVDESMI TGESRAVNKKINDLVYGGSLNQNQPFEMKVTTLGKDSFLNQVAELVKKAQAQKSNLENMADRVAGYLFYAALIVGIFSLI FWTISSNFSFALLLAVSVFVIACPHALGLAVPLVVSRLTSISAKNGLLIQNRTSLEKINTIKYALMDKTGTLTDGKFIVR NVIDFTDETDILQIMAALEGSSTHPIAQSIVSAAKPLENLKVEAVENIPGVGIKGQVNQNFYQIVNYKYLRENQLSYDEQ KIAQYLDLGLTVSFLINEQQDVLGFIALGDSPKADAKAFINGLLAQGITPVMLTGDNKETAQKIASALNIPEFRAELKPE DKAEIVKEYQKKAGVLFIGDGVNDSPALATATIGFAIGAGTSVAISTADVVLVNSNPSDVLDMINISKRMLRKMKQNLWF GAGYNIIAIPVAAGILYPFTGIYIDPLIAAVLMSISTVIVSINAMGLRYDKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0105 | YP_252020.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-101 | 48 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| copB | YP_007508114.1 | copper-potassium transporting ATPase B | BAC0079 | Protein | 7e-121 | 49 |
| copB | YP_007508114.1 | copper-potassium transporting ATPase B | BAC0629 | Protein | 2e-107 | 46 |
| copB | YP_007508114.1 | copper-potassium transporting ATPase B | BAC0383 | Protein | 9e-110 | 46 |
