|
Name : recG (lilo_2212) Accession : YP_007509534.1 Strain : Lactococcus lactis IO-1 Genome accession: NC_020450 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2386276 - 2388276 bp Length : 2001 bp Strand : - Note : K03655 ATP-dependent DNA helicase RecG DNA sequence : ATGAAATTAACAGATTCAGTGCAATTTTTAAAAGGTGTGGGACCGAAATCTGTGGAAAATTTCCATAAGTTAGGAATTTT CACGGTTCAAGATTTATTGCTTTATTTCCCTTTTCGTTATGAAGATTTCGCAAGTCGTTCGGTTTTTGAACTTGTTGACG GAGAAAAAGCAACAATTATTGGAACGGTAGTGACACCAGCTAATGTCCAGTATTACGGATTTAAACGTAATCGACTTTCA TTTAAAATTAAAGAAGGTGAGGCCGTGGTTGCTGTCAGCTTTTTTAATCAACCTTATTTGGCTGACAAAGTGGAAGTTGG TAAGGAAATTGCAGTTTACGGAAAATGGGAGCAGGCAAAGCAACAACTGATGGGGATGAAGGTTGTGGCTCAGGTGGACG ATGGCTTAGAACCTGTTTATCATTTGACAGCGGGTATGAAACAAAGTCAATTGGTCAAAGTAATTCATCAGGTTTTTGAA TCAGATCTTCTATCAGAATTACCTGAGAACTTACCAGAATTTTTGATTAAAAAATATCGTCTGATGAACCGGCAAGAAGC CGTTTTGGCTATGCATTTTCCTGAAGATATGGAAGCTCATAAGCAGGCTTTACGTCGTGTAAAATTTGAAGAATTATTCA TGTTTCAGTTGAAATTACAGGCCTTAAAAAATAAAGAAAAATCGGGCCGAGCAGGATTAGAAGTTGTTTTTGAGCAAGGA GAAATTGATCGGAAGATTTCTGAATTACCTTTTGAACTGACAGGTGCTCAATTAAGCGCTTTGTCAGAGATTCTGACGGA TATGAAATCTCCTTATCACATGAATCGACTTTTGCAAGGTGATGTGGGTTCTGGTAAAACAGTTGTTGCTTCCCTTGCCA TGTACGCGGCTTGTTTGGCGAATTTTCAAGCAGCAATTATGGTACCAACAGAAATCCTTGCCCGTCAGCATTTTGCAAAC TTGAAAGCTCTTTTTCCAGAATTGCAAATTTCACTTTTGGTTTCGGGTTTGAAAGTGGCAGAGCGCCGCGAGATTTTGGC TGATTTAGTTAGTGGTCATACACATATGGTAGTTGGAACTCATGCGCTGATTCAAGAAGGGGTCGATTTTTATAATTTGG GTCTTGTGATTACAGATGAACAACACCGTTTCGGAGTTAATCAGCGAAAAATTTTACGAGAAAAAGGGCAAAATCCAGAT GTTCTAATGATGACAGCTACACCCATTCCAAGAACGCTTGCGATTACGGCTTTTGGGGATATGGATGTTTCAATTATTGA TGAACTACCCAAGGGACGTCAACCCATTACTACAAGGTGGGTCAAACATGAACAATTTTCCGAAGTTTTAAGTTGGATAA AAGCAGAGGTTGCTAAAGATTCACAGGTTTATTTTATTTCACCTTTAATTGAGGAAAGTGAAACGTTGGACCTGAAAAAC GCAGAAGCTCTTTTTGCGGAATTAAATGAATACTTTGGATTATTTGCCAAAATTGGTCTTTTACATGGAAAAATGAAAAA TGATGAAAAAGACCAAATCATGCAAGAATTTAAGGCTAAAAAATTAGATATTTTGGTTTCAACAACAGTGATTGAAGTGG GAGTTGATGTTCCTAATGCTACCATTATGGTGATTATGGATGCTGACCGCTTTGGACTTTCGCAGCTTCACCAATTGCGT GGTCGTGTTGGTCGGGGAACAAAAAAATCTTATGCCATTTTAGTAGCAAATCCTAAGTCCGATTCAGGAAAACAACGGAT GAAAATTATGACAGAAACACAAAATGGTTTTATTTTAGCCGAAGAAGATTTAAAAATGCGTGGTTCTGGAGAGATTTTTG GACTTCGTCAGTCAGGACTTCCAGAATTTATTGCGGCTGATTTAGTCAATGATTATAATATTTTAGAAGTGGCTAGAAAA GAAGCAGTTGAAATTTTTAAAAATGCAGATGAGTTTCCTGATTTGATTGCTCAAGTTAGTGTTGACGGGGGCTTTGATTG A Protein sequence : MKLTDSVQFLKGVGPKSVENFHKLGIFTVQDLLLYFPFRYEDFASRSVFELVDGEKATIIGTVVTPANVQYYGFKRNRLS FKIKEGEAVVAVSFFNQPYLADKVEVGKEIAVYGKWEQAKQQLMGMKVVAQVDDGLEPVYHLTAGMKQSQLVKVIHQVFE SDLLSELPENLPEFLIKKYRLMNRQEAVLAMHFPEDMEAHKQALRRVKFEELFMFQLKLQALKNKEKSGRAGLEVVFEQG EIDRKISELPFELTGAQLSALSEILTDMKSPYHMNRLLQGDVGSGKTVVASLAMYAACLANFQAAIMVPTEILARQHFAN LKALFPELQISLLVSGLKVAERREILADLVSGHTHMVVGTHALIQEGVDFYNLGLVITDEQHRFGVNQRKILREKGQNPD VLMMTATPIPRTLAITAFGDMDVSIIDELPKGRQPITTRWVKHEQFSEVLSWIKAEVAKDSQVYFISPLIEESETLDLKN AEALFAELNEYFGLFAKIGLLHGKMKNDEKDQIMQEFKAKKLDILVSTTVIEVGVDVPNATIMVIMDADRFGLSQLHQLR GRVGRGTKKSYAILVANPKSDSGKQRMKIMTETQNGFILAEEDLKMRGSGEIFGLRQSGLPEFIAADLVNDYNILEVARK EAVEIFKNADEFPDLIAQVSVDGGFD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 1e-101 | 45 |
