Name : polA (lilo_2122) Accession : YP_007509444.1 Strain : Lactococcus lactis IO-1 Genome accession: NC_020450 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2277101 - 2279755 bp Length : 2655 bp Strand : - Note : K02335 DNA polymeraseI DNA sequence : ATGGAAGAGATAGGAAATAAAATGGAGAACAAGGACAGACTTTTACTAATTGATGGGTCATCGGTTGCCTTTCGGGCCTT TTTTGCGCTATATAATCAGATAGATCGCTTTAAAGCGCCAAATGGGTTACATACTAATGCTATTTTTGCATTTCATACAA TGCTTTCTTCTTTGATGGAACGGATTGAGCCCACACATGTTTTGATTGCATTTGATGCAGGAAAAACAACTTTTCGTACG GAAATGTTTGCTGACTATAAAGGCGGACGTTCAAAAACACCAGATGAATTTCGTGAGCAATTACCTTTTATCAAGGAAAT GATTGAGAAATTGGGAATTCGCCATTATGAGTTAGCTAACTATGAGGCTGATGATATTATTGGGACTTTGGACAAAATGG CGGAAGCCCCAGATGTTAATTTTGATGTTACTATTGTGACGGGTGATAAGGATATGATTCAGCTTGTGGATGGAAATACG CGAGTTGAAATTTCTAAGAAGGGGGTTGCTGAGTTTGAGGAGTTTACACCTGATTATCTTTTAGAAAAAATGGGATTGAC TCCAGCTCAATTTATTGATTTAAAAGCATTAATGGGCGATTCTTCTGATAATTACCCTGGCGTGACAAAAGTTGGCGAAA AAACTGGTCTTAAACTTTTGCAAGAGTTTGGGTCACTTGAAAATCTCTATGAAAATGTTGATTCTTTGAAAGCCAGCAAA ATGAAAGAAAATCTAATTGCTGACAAAGAAATGGCTTTTTTGTCACAACAATTGGCAACGATAAATACGAAAGCTCCAAT TGAAATTGGCTTAGATGATACGCTTTTAAAAGATAAAAAGGTTGATGAACTTAGTCAATTTTATGATGAAATGGGCTTTG CTCAATTCAAAAGTAAATTATTGACTGAGGCTGGTGGAGAAGTTACTGACGAAAAAGTTGTTGACGAAATTGATTTTGAA ATAGTTACTGATGGCTCTATCAGTGAAAAGGTAAATGCTGATGATTTCTTCTATTTGGAAACTTTAGGGGAAAATTATCA TCGTGAGCAAATTGTGGCTTTTGCCTGGGGAAATGCTGAGAAAATTTATGTTTCTAAAAATATAGATTTACTGACAAAAA TGAAGTTCCCCGAAAATACTTATGATTTCAAGAAAAATCGGGTACTTTTGAGTCACTTGGATATCGAATTACCTTTGGTC AAATTTGATGCAATGCTTGCAAAATATCTAATTTCAACAACAGAAGATAATAAAATTTCGACGATTGCAAGACTTTTCAA TAGCGGACATTTGGCAACGGATGAAGAAGTTTTTGGCAAAGGGACAAAAATTGCTTTACCTGATGATGCGGTTTTATTTG AACATTTAGCTCGTAAAATTAAAGTGCTTGCCTTGGCCAAAGAAAAAATGATGGCTGAATTGCTTGAAAATGAACAAGAA CACCTTTTGGCTGATATGGAATTACCATTAGCAGAAGTTTTAGCAAAAATGGAAATTACAGGGATTGCTGTCAGCCAAAA TACGCTGGAAGAAATTGGTGCGGAAAATGAAGAAAAATTGGCTTCTTTGACGCGCGAAATTTATGATTTGGCTGGTGAAG AATTTAATATTAATTCACCAAAACAGTTGGGTGTGATTTTATTTGAAAAATTACAGCTACCGGTTGGAAAGAAAACAAAA ACAGGCTATTCAACGGCAGTGGATGTTTTAGAAGATTTAGCTGCTTTATCTCCCGTTGTAGCAAAAATTTTGGAATATCG TCAAATCAATAAAGTACAATCAACTTATGTGAAAGGTCTGATTCCTCAAATTGCTGATGATGGAAAAATTCATACACGTT ATGTTCAAGATTTGACTCAAACTGGACGTTTGAGCTCAGTTGACCCGAATTTACAAAATATTCCTGTTCGACTTGAGGAG GGACGAAAAATTCGTAAAGCTTTTGTCCCAAGCAAAGATTCGCTTTTATTGAGTTCTGACTATTCACAAATTGAATTGCG GGTTTTGGCACATATTTCTGGGGATGAACATTTAATTGATGCCTTTAAACATGGAGCTGATATCCATACTTCAACGGCTA TGCGTGTTTTCGGCATTGAAAAAGCAGAAGATGTGACTGCTAATGATCGTAGAAATGCTAAAGCAGTCAATTTTGGAGTA GTCTATGGAATTTCCGATTTTGGTTTAGCAAGAAATCTTGGAATTACAAGAAAAGATGCTAAAAATTACATTGAAACTTA TTTTGAACGTTATCCTGGGATTAAAACCTATATGGAAAATATTGTTCGTGAGGCACGAGACAAAGGTTTTGTTGAAACAA TGAGTCACCGTCGTCGTAAGATTCCAGATATTAATGCTCGTAATTTTAATGTTCGTGGTTTTGCAGAACGGACGGCTATT AACTCACCAATTCAAGGTTCGGCAGCTGATATCTTAAAAATTGCGATGATTAATTTGGATAAAGCTTTGAGTGCTCGTGA TTTTAAATCAAAATTATTATTGCAAGTACACGATGAAATTATCCTTGATGTTCCTTTAGAGGAATTAGATGAAATTAAGG CCTTGGTAAAACAAACGATGGAAGAAGCGATTGAACTTGCTGTCCCATTAAAAGTGGATGAAAATACTGGTAAGACTTGG TATGAAGCTAAATAA Protein sequence : MEEIGNKMENKDRLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKAPNGLHTNAIFAFHTMLSSLMERIEPTHVLIAFDAGKTTFRT EMFADYKGGRSKTPDEFREQLPFIKEMIEKLGIRHYELANYEADDIIGTLDKMAEAPDVNFDVTIVTGDKDMIQLVDGNT RVEISKKGVAEFEEFTPDYLLEKMGLTPAQFIDLKALMGDSSDNYPGVTKVGEKTGLKLLQEFGSLENLYENVDSLKASK MKENLIADKEMAFLSQQLATINTKAPIEIGLDDTLLKDKKVDELSQFYDEMGFAQFKSKLLTEAGGEVTDEKVVDEIDFE IVTDGSISEKVNADDFFYLETLGENYHREQIVAFAWGNAEKIYVSKNIDLLTKMKFPENTYDFKKNRVLLSHLDIELPLV KFDAMLAKYLISTTEDNKISTIARLFNSGHLATDEEVFGKGTKIALPDDAVLFEHLARKIKVLALAKEKMMAELLENEQE HLLADMELPLAEVLAKMEITGIAVSQNTLEEIGAENEEKLASLTREIYDLAGEEFNINSPKQLGVILFEKLQLPVGKKTK TGYSTAVDVLEDLAALSPVVAKILEYRQINKVQSTYVKGLIPQIADDGKIHTRYVQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEE GRKIRKAFVPSKDSLLLSSDYSQIELRVLAHISGDEHLIDAFKHGADIHTSTAMRVFGIEKAEDVTANDRRNAKAVNFGV VYGISDFGLARNLGITRKDAKNYIETYFERYPGIKTYMENIVREARDKGFVETMSHRRRKIPDINARNFNVRGFAERTAI NSPIQGSAADILKIAMINLDKALSARDFKSKLLLQVHDEIILDVPLEELDEIKALVKQTMEEAIELAVPLKVDENTGKTW YEAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 70 |