Gene Information

Name : polA (lilo_2122)
Accession : YP_007509444.1
Strain : Lactococcus lactis IO-1
Genome accession: NC_020450
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : DNA polymerase I
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2277101 - 2279755 bp
Length : 2655 bp
Strand : -
Note : K02335 DNA polymeraseI

DNA sequence :
ATGGAAGAGATAGGAAATAAAATGGAGAACAAGGACAGACTTTTACTAATTGATGGGTCATCGGTTGCCTTTCGGGCCTT
TTTTGCGCTATATAATCAGATAGATCGCTTTAAAGCGCCAAATGGGTTACATACTAATGCTATTTTTGCATTTCATACAA
TGCTTTCTTCTTTGATGGAACGGATTGAGCCCACACATGTTTTGATTGCATTTGATGCAGGAAAAACAACTTTTCGTACG
GAAATGTTTGCTGACTATAAAGGCGGACGTTCAAAAACACCAGATGAATTTCGTGAGCAATTACCTTTTATCAAGGAAAT
GATTGAGAAATTGGGAATTCGCCATTATGAGTTAGCTAACTATGAGGCTGATGATATTATTGGGACTTTGGACAAAATGG
CGGAAGCCCCAGATGTTAATTTTGATGTTACTATTGTGACGGGTGATAAGGATATGATTCAGCTTGTGGATGGAAATACG
CGAGTTGAAATTTCTAAGAAGGGGGTTGCTGAGTTTGAGGAGTTTACACCTGATTATCTTTTAGAAAAAATGGGATTGAC
TCCAGCTCAATTTATTGATTTAAAAGCATTAATGGGCGATTCTTCTGATAATTACCCTGGCGTGACAAAAGTTGGCGAAA
AAACTGGTCTTAAACTTTTGCAAGAGTTTGGGTCACTTGAAAATCTCTATGAAAATGTTGATTCTTTGAAAGCCAGCAAA
ATGAAAGAAAATCTAATTGCTGACAAAGAAATGGCTTTTTTGTCACAACAATTGGCAACGATAAATACGAAAGCTCCAAT
TGAAATTGGCTTAGATGATACGCTTTTAAAAGATAAAAAGGTTGATGAACTTAGTCAATTTTATGATGAAATGGGCTTTG
CTCAATTCAAAAGTAAATTATTGACTGAGGCTGGTGGAGAAGTTACTGACGAAAAAGTTGTTGACGAAATTGATTTTGAA
ATAGTTACTGATGGCTCTATCAGTGAAAAGGTAAATGCTGATGATTTCTTCTATTTGGAAACTTTAGGGGAAAATTATCA
TCGTGAGCAAATTGTGGCTTTTGCCTGGGGAAATGCTGAGAAAATTTATGTTTCTAAAAATATAGATTTACTGACAAAAA
TGAAGTTCCCCGAAAATACTTATGATTTCAAGAAAAATCGGGTACTTTTGAGTCACTTGGATATCGAATTACCTTTGGTC
AAATTTGATGCAATGCTTGCAAAATATCTAATTTCAACAACAGAAGATAATAAAATTTCGACGATTGCAAGACTTTTCAA
TAGCGGACATTTGGCAACGGATGAAGAAGTTTTTGGCAAAGGGACAAAAATTGCTTTACCTGATGATGCGGTTTTATTTG
AACATTTAGCTCGTAAAATTAAAGTGCTTGCCTTGGCCAAAGAAAAAATGATGGCTGAATTGCTTGAAAATGAACAAGAA
CACCTTTTGGCTGATATGGAATTACCATTAGCAGAAGTTTTAGCAAAAATGGAAATTACAGGGATTGCTGTCAGCCAAAA
TACGCTGGAAGAAATTGGTGCGGAAAATGAAGAAAAATTGGCTTCTTTGACGCGCGAAATTTATGATTTGGCTGGTGAAG
AATTTAATATTAATTCACCAAAACAGTTGGGTGTGATTTTATTTGAAAAATTACAGCTACCGGTTGGAAAGAAAACAAAA
ACAGGCTATTCAACGGCAGTGGATGTTTTAGAAGATTTAGCTGCTTTATCTCCCGTTGTAGCAAAAATTTTGGAATATCG
TCAAATCAATAAAGTACAATCAACTTATGTGAAAGGTCTGATTCCTCAAATTGCTGATGATGGAAAAATTCATACACGTT
ATGTTCAAGATTTGACTCAAACTGGACGTTTGAGCTCAGTTGACCCGAATTTACAAAATATTCCTGTTCGACTTGAGGAG
GGACGAAAAATTCGTAAAGCTTTTGTCCCAAGCAAAGATTCGCTTTTATTGAGTTCTGACTATTCACAAATTGAATTGCG
GGTTTTGGCACATATTTCTGGGGATGAACATTTAATTGATGCCTTTAAACATGGAGCTGATATCCATACTTCAACGGCTA
TGCGTGTTTTCGGCATTGAAAAAGCAGAAGATGTGACTGCTAATGATCGTAGAAATGCTAAAGCAGTCAATTTTGGAGTA
GTCTATGGAATTTCCGATTTTGGTTTAGCAAGAAATCTTGGAATTACAAGAAAAGATGCTAAAAATTACATTGAAACTTA
TTTTGAACGTTATCCTGGGATTAAAACCTATATGGAAAATATTGTTCGTGAGGCACGAGACAAAGGTTTTGTTGAAACAA
TGAGTCACCGTCGTCGTAAGATTCCAGATATTAATGCTCGTAATTTTAATGTTCGTGGTTTTGCAGAACGGACGGCTATT
AACTCACCAATTCAAGGTTCGGCAGCTGATATCTTAAAAATTGCGATGATTAATTTGGATAAAGCTTTGAGTGCTCGTGA
TTTTAAATCAAAATTATTATTGCAAGTACACGATGAAATTATCCTTGATGTTCCTTTAGAGGAATTAGATGAAATTAAGG
CCTTGGTAAAACAAACGATGGAAGAAGCGATTGAACTTGCTGTCCCATTAAAAGTGGATGAAAATACTGGTAAGACTTGG
TATGAAGCTAAATAA

Protein sequence :
MEEIGNKMENKDRLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKAPNGLHTNAIFAFHTMLSSLMERIEPTHVLIAFDAGKTTFRT
EMFADYKGGRSKTPDEFREQLPFIKEMIEKLGIRHYELANYEADDIIGTLDKMAEAPDVNFDVTIVTGDKDMIQLVDGNT
RVEISKKGVAEFEEFTPDYLLEKMGLTPAQFIDLKALMGDSSDNYPGVTKVGEKTGLKLLQEFGSLENLYENVDSLKASK
MKENLIADKEMAFLSQQLATINTKAPIEIGLDDTLLKDKKVDELSQFYDEMGFAQFKSKLLTEAGGEVTDEKVVDEIDFE
IVTDGSISEKVNADDFFYLETLGENYHREQIVAFAWGNAEKIYVSKNIDLLTKMKFPENTYDFKKNRVLLSHLDIELPLV
KFDAMLAKYLISTTEDNKISTIARLFNSGHLATDEEVFGKGTKIALPDDAVLFEHLARKIKVLALAKEKMMAELLENEQE
HLLADMELPLAEVLAKMEITGIAVSQNTLEEIGAENEEKLASLTREIYDLAGEEFNINSPKQLGVILFEKLQLPVGKKTK
TGYSTAVDVLEDLAALSPVVAKILEYRQINKVQSTYVKGLIPQIADDGKIHTRYVQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEE
GRKIRKAFVPSKDSLLLSSDYSQIELRVLAHISGDEHLIDAFKHGADIHTSTAMRVFGIEKAEDVTANDRRNAKAVNFGV
VYGISDFGLARNLGITRKDAKNYIETYFERYPGIKTYMENIVREARDKGFVETMSHRRRKIPDINARNFNVRGFAERTAI
NSPIQGSAADILKIAMINLDKALSARDFKSKLLLQVHDEIILDVPLEELDEIKALVKQTMEEAIELAVPLKVDENTGKTW
YEAK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
polA YP_281523.1 DNA polymerase I Not tested Not named Protein 0.0 70