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Name : busAB (lilo_1369) Accession : YP_007508692.1 Strain : Lactococcus lactis IO-1 Genome accession: NC_020450 Putative virulence/resistance : Unknown Product : betaine ABC transporter permease and substrate binding protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1486940 - 1488661 bp Length : 1722 bp Strand : - Note : K02001 glycine betaine/proline transport system permease protein; K02002 glycine betaine/proline transport system substrate-binding protein DNA sequence : ATGATTGATTTAGCTATTGGACAAGTCCCCTTAGCAAAATGGGTGTCATCGGCAACAGATTGGATTACTAGTACTTTTAG TTCAGGATTTGATGTGATTCAAAAATCAGGAACAGTATTGATGAATGGTATTACAGGTGCTTTAACTGCTGTTCCATTCT GGTTGATGATTGCTGTTGTTACTATCCTTGCCATTTTGGTTTCAGGTAAAAAAATTGCCTTTCCTTTATTCACTTTCATT GGTCTTTCTTTAATTGCTAATCAAGGCTTATGGTCAGATTTGATGAGTACTATCACACTTGTCTTACTTTCAAGTTTATT GTCAATCATCATTGGAGTTCCTTTAGGGATTTGGATGGCCAAATCTGATTTAGTGGCTAAGATCGTTCAACCGATTTTGG ACTTTATGCAAACAATGCCTGGTTTCGTTTATTTGATTCCAGCGGTTGCATTCTTTGGAATTGGAGTTGTTCCTGGGGTA TTTGCCTCTGTTATCTTTGCACTTCCACCAACAGTCAGAATGACTAACTTGGGAATTCGTCAAGTTTCAACAGAATTAGT TGAAGCGGCAGATTCATTTGGTTCAACTGCCCGTCAAAAGCTCTTTAAATTGGAATTTCCTTTGGCTAAAGGAACAATTA TGGCCGGTGTTAACCAAACGATTATGTTAGCTCTTTCTATGGTTGTTATTGCTTCTATGATTGGGGCGCCTGGCTTAGGT CGTGGTGTACTTGCAGCCGTTCAATCAGCTGATATTGGTAAAGGGTTTGTAAGTGGGATTTCATTAGTTATTTTGGCTAT TATTATTGACCGCTTTACACAAAAACTTAATGTTTCTCCTCTTGAAAAACAGGGAAATCCTACAGTTAAAAAATGGAAAC GTGGAATTGCCTTAGTTTCATTGTTAGCTTTAATTGTTGGTGCCTTTTCAGGAATGTCTTTTGGAAAAACGGCCTCTGAT AAAAAAGTTGACTTGGTTTATATGAACTGGGATTCAGAAGTTGCATCAATCAATGTTTTGACTCAAGCGATGAAAGAACA TGGCTTTGATGTAAAAACGACAGCTTTAGATAATGCAGTGGCTTGGCAAACGGTAGCCAATGGTCAAGCAGATGGAATGG TTTCTGCTTGGTTACCAAATACTCATAAAACACAATGGCAAAAATATGGTAAATCTGTTGATTTGTTAGGTCCTAACCTT AAAGGCGCTAAAGTTGGGTTTGTTGTTCCAAGTTATATGAATGTTAATTCAATTGAAGATTTAACAAATCAAGCGAATAA GACAATCACAGGTATTGAACCAGGTGCAGGTGTAATGGCTGCTAGTGAAAAAACGCTTAATAGCTATGATAATCTTAAAG ATTGGAAACTTGTTCCTTCATCATCAGGTGCTATGACTGTAGCTCTTGGTGAAGCAATCAAACAACATAAAGATATTGTC ATTACTGGTTGGTCACCTCATTGGATGTTTAACAAATATGATTTGAAATATTTGGCTGATCCAAAAGGAACAATGGGAAC TTCAGAAAATATTAATACCATTGTTCGTAAAGGTTTGAAGAAAGAAAATCCAGAAGCTTATAAAGTTTTAGATAAATTTA ATTGGACAACTAAGGATATGGAAGCTGTCATGCTTGATATTCAAAATGGTAAAACACCAGAAGAAGCTGCCAAAAATTGG ATTAAAGATCATCAAAAAGAAGTTGATAAATGGTTTAAATAA Protein sequence : MIDLAIGQVPLAKWVSSATDWITSTFSSGFDVIQKSGTVLMNGITGALTAVPFWLMIAVVTILAILVSGKKIAFPLFTFI GLSLIANQGLWSDLMSTITLVLLSSLLSIIIGVPLGIWMAKSDLVAKIVQPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGV FASVIFALPPTVRMTNLGIRQVSTELVEAADSFGSTARQKLFKLEFPLAKGTIMAGVNQTIMLALSMVVIASMIGAPGLG RGVLAAVQSADIGKGFVSGISLVILAIIIDRFTQKLNVSPLEKQGNPTVKKWKRGIALVSLLALIVGAFSGMSFGKTASD KKVDLVYMNWDSEVASINVLTQAMKEHGFDVKTTALDNAVAWQTVANGQADGMVSAWLPNTHKTQWQKYGKSVDLLGPNL KGAKVGFVVPSYMNVNSIEDLTNQANKTITGIEPGAGVMAASEKTLNSYDNLKDWKLVPSSSGAMTVALGEAIKQHKDIV ITGWSPHWMFNKYDLKYLADPKGTMGTSENINTIVRKGLKKENPEAYKVLDKFNWTTKDMEAVMLDIQNGKTPEEAAKNW IKDHQKEVDKWFK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 4e-151 | 60 |
