Gene Information

Name : H175_ch4122 (H175_ch4122)
Accession : YP_007480582.1
Strain : Bacillus thuringiensis IS5056
Genome accession: NC_020376
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 4069393 - 4071456 bp
Length : 2064 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTTTAAGAAGATCTTTGGTGTTCTTCAAAAAGTCGGAAAAGCGTTAATGCTTCCAGTAGCGATTTTACCGGCGGCAGG
TATTTTACTTGGATTTGGTAATGCATTTCAAAATCCACAGTTAACAAATGTTATTCCTGCTTTAAAAGCAGATTGGTTCG
TAATGGTTGCAAAAATTATGGAACAATCTGGTGATATTATTTTCGCTAACCTTGCATTATTATTCGCAGTTGGGGTAGCA
ATTGGTTTAGCTGGTGGAGACGGAGTAGCTGGTTTAGCAGCATTCGTCGGCTACTTAATTATGAACAAAACGATGAGTGT
GTTCTTAGAAGTAGATAAGCTAGTGAAAGTGACAAGTTCTGGAGCAGACCCAGTAAAAATTGGATTTACAGATCCAGCGT
ATGCAAACGTATTAGGTATTCCAACGCTACAAACAGGGGTATTTGGTGGTATTATCGTAGGTATAGTAGCGGCATATTGC
TATAATAAATACTTCAACATTGAATTACCATCATACTTAGGTTTCTTTGCAGGTAAGCGTTTCGTACCGATCGCAACTGC
AACATTCTCTTTAATAGTAGGTATTATCATGTGCTTCGTTTGGCCATACATTCAAGGTGGCTTAAACACGTTCTCACATC
AAATGATTGATGCAAATAGAACAATCGCAGCATTTATATTCGGTTTAATTGAACGTTCATTAATTCCATTTGGACTACAT
CACATTTTCTATTCACCGTTCTGGTTCGAATTCGGTCAGTATACAAATGCAGCTGGCGAATTAATCCGTGGTGACCAAAA
AATCTTTATGGCACAGTTAAAAGACGGTGTAGAATTAACAGCAGGTACATTTACAACTGGTAAGTATCCGTTCATGATGT
TCGGTCTTCCAGCAGCAGCTTTAGCAATGTACCATGAAGCACGTCCAGAAAATAAAAAATTAGCAGCAGGTATTTTAGGT
TCTGCAGCATTAACATCTTTCTTAACAGGTATTACAGAGCCACTTGAATTTTCATTCTTATTCGTAGCGCCAGTATTATT
CGGAATTCACGCTGTATTTGCTGGTCTATCATTTATGACAATGCAAATTTTAGGTGTTAAAATTGGTATGACATTCTCTG
GTGGTTTAATTGACTTCCTATTATTCGGTGTATTACCAGGCCGTACAGCATGGTGGTGGGTAATTATTGTTGGTCTTGTA
CTAGCAGTTATTTACTACTTCGGATTCCGCTTTGCAATCCGTAAATGGAATCTAAAAACACCTGGTCGTGAAGAGGCAAA
TGCGAATGACGGTGCAGGAAAAACAGAAGCAGGCGAACTTCCTCGTGAAGTATTAGTAGCACTTGGTGGTAAAGAAAACA
TTGCTTCTTTAGATGCTTGTATTACTCGTTTACGTGTTCAAGTTAACGAACAAAAGAATGTAAACAAAGACCGCTTAAAA
GAACTTGGAGCAGCTGGTGTACTTGAAGTTGGAAATAACATTCAAGCTATTTTCGGACCGAAATCTGACACGTTAAAATC
ACAAATTCATGATATAATGTCAGGTCGTACACCTCATGTTGAAAAAGAAGAACCTGTAAAAGTGGAAGAAACTCCTCAAA
AAGTTGATGAAAATGAAACAATTGTATCACCAATCGAAGGGAAAATCTTACCAATTACAGAAGTGCCTGACCAAGTATTC
TCAGGAAAAATGATGGGAGACGGATTTGCAATTGAGCCAACTGAAGGAACAGTAGTTTCTCCAGTTAACGGTGAAATTGT
CAATGTATTCCCTACAAAACATGCGATTGGTATTCAATCTGAAGGCGGAAAAGAAATTTTAATCCACTTTGGTATTGATA
CTGTAAAATTAAATGGTGAAGGATTCGAGGCACTTGTAGCACAAGGTGATAAAGTGAAGCAAGGCCAACCATTATTAAAA
GTAGATCTTGCATTTGTAAAAGAAAATGCACCATCTATCATTACACCAATTGTATTTACAAACTTACAACAAGGGCAACA
AGTCGAATTGAAAAAAGATGGAAATGTTAAGAAGGGCGAAACCGCTATTATTGACATTCAGTAG

Protein sequence :
MFKKIFGVLQKVGKALMLPVAILPAAGILLGFGNAFQNPQLTNVIPALKADWFVMVAKIMEQSGDIIFANLALLFAVGVA
IGLAGGDGVAGLAAFVGYLIMNKTMSVFLEVDKLVKVTSSGADPVKIGFTDPAYANVLGIPTLQTGVFGGIIVGIVAAYC
YNKYFNIELPSYLGFFAGKRFVPIATATFSLIVGIIMCFVWPYIQGGLNTFSHQMIDANRTIAAFIFGLIERSLIPFGLH
HIFYSPFWFEFGQYTNAAGELIRGDQKIFMAQLKDGVELTAGTFTTGKYPFMMFGLPAAALAMYHEARPENKKLAAGILG
SAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLFGIHAVFAGLSFMTMQILGVKIGMTFSGGLIDFLLFGVLPGRTAWWWVIIVGLV
LAVIYYFGFRFAIRKWNLKTPGREEANANDGAGKTEAGELPREVLVALGGKENIASLDACITRLRVQVNEQKNVNKDRLK
ELGAAGVLEVGNNIQAIFGPKSDTLKSQIHDIMSGRTPHVEKEEPVKVEETPQKVDENETIVSPIEGKILPITEVPDQVF
SGKMMGDGFAIEPTEGTVVSPVNGEIVNVFPTKHAIGIQSEGGKEILIHFGIDTVKLNGEGFEALVAQGDKVKQGQPLLK
VDLAFVKENAPSIITPIVFTNLQQGQQVELKKDGNVKKGETAIIDIQ

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
APECO1_2642 YP_859416.1 PTS system, glucose-specific IIBC component Not tested Not named Protein 8e-93 49