|
Name : H175_ch0357 (H175_ch0357) Accession : YP_007476819.1 Strain : Bacillus thuringiensis IS5056 Genome accession: NC_020376 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Alpha-glucosidase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.2.1.20 Position : 405438 - 407102 bp Length : 1665 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATAAGACATGGTGGAAAGAAGCAGTTGCTTATCAAATTTATCCACGAAGCTTTATGGATTCAAATGGTGATGGTAT TGGAGATTTACAAGGTATTATTGCAAAACTGGATTATTTAAAAGACTTAGGTATAGATGTAATTTGGATTTGTCCAATGT ATAAGTCGCCTAATGATGATAATGGTTATGATATTAGTGATTATCAAGATATTATGGATGAGTTTGGTACAATGGCAGAC TTTGATGCTTTACTAGATGAAGTTCATAAGCGTGATATGAAGCTTATTATTGATTTAGTTATTAATCATACGAGTGATGA ACATCCATGGTTTATTGAATCACGTTCATCTAAAGATAATCCGAAGCGTGATTGGTATATTTGGCATGATGGTAAAGATG GTGCGGAGCCAAACAACTGGGAAAGTATTTTTAATGGTTCGGCATGGGAATATGATGAAGAAACAGAACAATATTATTTA CATCTATTCTCACGTAAACAACCAGATTTGAACTGGGAGAATAAAGAAGTTCGCGAAGTACTATATGATACGGTTAATTG GTGGCTTGATAAAGGTATTGATGGTTTCCGCGTTGATGCGATCAGTCATATAAAAAAAGAAGAAGGCCTTAAGGATATGC CAAATCCAAAAGAGTTAAAATATGTGCCATCTTTTGATAAACATATGAATGTGAAAGGTATTCAACCTTTATTAGAAGAG CTAAAAGAAAATACATTCTCTAAGTACGATATTATGACTGTTGGTGAAGCAAATGGCGTTAAGATTGAAGATGCTGAGCT TTGGGTTGGAGAAGAGCAAGGTAAGTTCAATATGGTATTCCAGTTTGAACATTTAAGTTTATGGGATGCAGAGAAGAAGA AAGACCTTGATGTTGTAGGATTGAAAAAAGTATTAACGAAATGGCAAAAAGGATTAGAAAATAAAGGATGGAACGCTTTA TATATTGAGAATCACGATAAACCACGTATCGTTTCAACATGGGGAGATGACAAACAATATTGGCGTGAAAGTGCAACAGC TCTAGGAGCGATGTATTTCTTTATGCACGGTACACCGTTTATTTATCAAGGACAAGAAATTGGTATGACAAATGTTCAGT TACCAAATATTGAAGATTACGATGATGTAGCAATTAAAAATTTATATCGCGAGAAAATTGCAGAGGGCGTACCACATCAA GATATGATGGAGATTGTATGGGCTTCTTGCCGCGATAATTCACGTACACCTATGCAGTGGAATGATGAGATGAATGCTGG TTTCACAACAAGTACACCTTGGTTTAGCATGAATCCAAATTACAAAGAAATTAATGTTGAGAAGCAAAAAAATGAAGAAA AGTCTATTTTCAATTTCTATAAGAAAATGATTGCCCTGAAAAAAGAGCACGATGTACTGAACTATGGTACGTACGATTTA CTTTTAGAAGACGATCCACAAATTTATGCATATACACGTACGTTACAGGATGAAAAAGTCATTGTAATTAGTAATATCTC AAAAGAGGAAGCTGTGTATAATGAGGGTTCATTTGCACTAGAACGCAAACGTTTGCTTTTAAATAACTATGAAGTTGCAG AACATGAAGAAGTAACAACAATTGCTTTAAAACCTTATGAAACAAGGGTTTATCGCATTTCATAA Protein sequence : MNKTWWKEAVAYQIYPRSFMDSNGDGIGDLQGIIAKLDYLKDLGIDVIWICPMYKSPNDDNGYDISDYQDIMDEFGTMAD FDALLDEVHKRDMKLIIDLVINHTSDEHPWFIESRSSKDNPKRDWYIWHDGKDGAEPNNWESIFNGSAWEYDEETEQYYL HLFSRKQPDLNWENKEVREVLYDTVNWWLDKGIDGFRVDAISHIKKEEGLKDMPNPKELKYVPSFDKHMNVKGIQPLLEE LKENTFSKYDIMTVGEANGVKIEDAELWVGEEQGKFNMVFQFEHLSLWDAEKKKDLDVVGLKKVLTKWQKGLENKGWNAL YIENHDKPRIVSTWGDDKQYWRESATALGAMYFFMHGTPFIYQGQEIGMTNVQLPNIEDYDDVAIKNLYREKIAEGVPHQ DMMEIVWASCRDNSRTPMQWNDEMNAGFTTSTPWFSMNPNYKEINVEKQKNEEKSIFNFYKKMIALKKEHDVLNYGTYDL LLEDDPQIYAYTRTLQDEKVIVISNISKEEAVYNEGSFALERKRLLLNNYEVAEHEEVTTIALKPYETRVYRIS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 6e-129 | 50 |
