Gene Information

Name : CDSE_0346 (CDSE_0346)
Accession : YP_007459114.1
Strain : Candidatus Kinetoplastibacterium desouzaii TCC079E
Genome accession: NC_020294
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 2.2.1.1
Position : 132804 - 134846 bp
Length : 2043 bp
Strand : +
Note : Carbohydrate transport and metabolism; SecretomeP prediction: 0.14.

DNA sequence :
ATGGGTAATATAACTACATCTAAATTTGTTTTGTCTGATGCCATACGTATTCTTGCTATGGATGCAGTGCAACAGGCTAA
TTCTGGTCATCCTGGTGCCCCTATGGGCATGGCTGAAATGGCGCAAGCGTTATGGAAGAATAATTTAAAACATAACCCTA
ATGATCCTAATTGGATTGATAGGGATCGCTTTGTTTTGTCTAATGGACATGGTTCTATGTTAGTATATGCTTTATTGCAT
TTAACAGGATATGATGTATCCATAGACGATTTAAGAAATTTTCGTCAGCTTCACTCAAAGACTCCTGGTCATCCAGAGGT
TGGGATTACTCCAGGAATAGAAACAACAACAGGACCACTTGGTCAAGGATTAGCTAATGCAGTTGGTATGGCTTTGGCAG
AATCATTATTAGCAGAAGAGTTTAATAAACCTGATTTTAATATTATAGATCATCATACATATGCAATAGTAGGTGATGGT
TGTTTAATGGAAGGTATTTCTCATGAGGTTTGTTCTTTAGCAGGAACATTGAAACTTTCTAAGTTAATAGTTCTATATGA
TGATAATGGTATTTCTATTGATGGTGATGTAAAGAACTGGTTTAATGATAATACAGCAGAACGTTTTCGTGGATATGGTT
GGAATGTTATTGAAGGCGTTAATGGTCATGACGTCTCTGCTGTTGACTCTGCTATAAAATTAGCTCGTTGTCAGTCGCAA
AAACCTACAATAATTATTTGTAAAACAGTTATTGGCAAAGGCTCTCCAAATATGGCTGGTACCCATAAGGTGCATGGTTC
TCCTTTAGGAAGTGATGAAATTATTGCCTCTAGAGAATTTCTTAATTGGAATTATGAGCCATTTGTTATACCTGAATTTA
TATATAACGAATGGAGCGCTAGAGAAAATGGTCAGGAGGTGCAAAATATTTGGCAATCTAAATTTGATGCTTATTTAAAT
AAATATCCAAGCGCAGCATCTGAATTAAAACGTAGAATGCAAGGTAATTTACCAGATGGGTTCGAGAACTTTGCTAAAGA
TTTAATACAAAAAACAATTAAAAATTCAGAAACAATTGCTACTAGGAAAGCTTCACAAAATACTATTACAGAAATTGCTA
AATATTTGCCAGAATTTTTAGGTGGATCGGCTGATTTAACTGGTTCAAATTTTACGGACTGGAAAGGAGTTGTGCCTGTT
AGAGCTGGTGTCAATAAGGCTATTAACTTTGGACGTCATATTAATTATGGTGTTAGAGAGTTTGGAATGGCAGCTATTAT
GAATGGAATTGCTCTACATGGAGGTTATTTGCCTTTTGGTGGTACATTCTTAACATTCTCGGATTATTCTCGTAATGCAA
TTCGCATGTCTGCTTTAATGAAGCAGAAAGTTGTTCATGTGTTTACTCATGATTCTATAGGACTAGGAGAAGATGGTCCT
ACTCATCAATCGATAGAACATGCGGCTAGTTTGCGCCTTATACCTAACTTATCTGTCTGGAGGCCTTGTGATACAGTAGA
AACTACGGTGGCTTGGTTGTATGCTATTCAAAGACCGGCAAGTGTTGGTATGAAGGTGCAGGATGGTGGTCCTTCAGCTT
TATTGCTATCTAGACAGAACTTGCCTTTTGTAGAGCGTGATTCAAGAACAGTTGATTCAATATATAAAGGTGGTTATGTA
TTGAAAGACTCAAGTAGCTTCTCAGCTATCATTATAGCAACAGGTTCGGAAGTGGCTATTGCTTTAGATGCTCAGCAAAT
ATTACTGGAACAAGGTATTAGAGTAAGAGTGGTTTCTATGCCTAGTGTTGATGTATTTGATAAACAAGATCTTAATTGGA
AAGAAAGTGTTTTGCCAAGAAAAATACCAAAAATTGCTATAGAAGCAGGTGTTACAACATGTTGGTATAAATATGTTGGT
TTAGATGGTTTGGTACTGGGTATAGATCGTTATGGGGAATCAGCTCCAGCCGGAAAACTATTTAAATTTTTTGGCTTAAC
AGTAGAAAATGTAATTTCCGCTGTAAAAAAAGTTTTATTATAA

Protein sequence :
MGNITTSKFVLSDAIRILAMDAVQQANSGHPGAPMGMAEMAQALWKNNLKHNPNDPNWIDRDRFVLSNGHGSMLVYALLH
LTGYDVSIDDLRNFRQLHSKTPGHPEVGITPGIETTTGPLGQGLANAVGMALAESLLAEEFNKPDFNIIDHHTYAIVGDG
CLMEGISHEVCSLAGTLKLSKLIVLYDDNGISIDGDVKNWFNDNTAERFRGYGWNVIEGVNGHDVSAVDSAIKLARCQSQ
KPTIIICKTVIGKGSPNMAGTHKVHGSPLGSDEIIASREFLNWNYEPFVIPEFIYNEWSARENGQEVQNIWQSKFDAYLN
KYPSAASELKRRMQGNLPDGFENFAKDLIQKTIKNSETIATRKASQNTITEIAKYLPEFLGGSADLTGSNFTDWKGVVPV
RAGVNKAINFGRHINYGVREFGMAAIMNGIALHGGYLPFGGTFLTFSDYSRNAIRMSALMKQKVVHVFTHDSIGLGEDGP
THQSIEHAASLRLIPNLSVWRPCDTVETTVAWLYAIQRPASVGMKVQDGGPSALLLSRQNLPFVERDSRTVDSIYKGGYV
LKDSSSFSAIIIATGSEVAIALDAQQILLEQGIRVRVVSMPSVDVFDKQDLNWKESVLPRKIPKIAIEAGVTTCWYKYVG
LDGLVLGIDRYGESAPAGKLFKFFGLTVENVISAVKKVLL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 60
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 9e-179 55