|
Name : polA (Cspa_c08810) Accession : YP_007453912.1 Strain : Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) Genome accession: NC_020291 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.7 Position : 970874 - 973477 bp Length : 2604 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAAAATTATTAATATTAGATTCCAATTCGCTTATGAATAGGGCTTTTTATGCCTTACCTCCTCTTACAAATAGTGA CGGAATAAATACTAATGCCATTTATGGTTTTATAAATATGTTATTTAAAATAAAGGATGAAATTAATCCAGATTCTATAA TAGCTACCTTTGATTTAAAGGCTCCAACCTTTAGACATAAGGAATATGCAGAATATAAAGCTGGTAGAAATAAGATGCCG CCTGAACTTGCAGAGCAATTTCCGATTATTAAAGACTTATTTAAACTTATGGGAATAAAGATTTTTGAAATAGAAGGTTT TGAGGCAGATGACTTAATTGGTACAGTATCTAAGTTTGCAGAAAACAATGCTACAGAAGTGGCAATAGTCACAGGAGATA AGGATGCACTTCAATTGGCATCTGATAGTACTAAAGTTATTATAACTAAAAAAGGTGTTAGTGAAACAGCAGTTTATGAT AGTAAGACTTTTATAGATGAATTTGAAGTGACTCCAACTCAATTCATAGATGTTAAAGGACTTATGGGCGATAAATCTGA CAATATTCCAGGGGTTCCTGGAGTAGGAGAGAAAACCGCGTTTAAACTAATTAAAGAATATGGTTCTGTTGAAGAAGTCA TGAAAAATATTGATAATATTCCAGGTAAAAAACTTAAGGAAAATTTAGAAAACAATGTTGAACAAGCAATATTTTCCAAA AAACTTGCTACTATAATGAGAGAGGTTCCAATTGAATTAACATTAGACGATATTAATTCAATGGAAAAGGAAAACATAGC AGAAATAAAGAAAATGCTTATAAAACTTGAAATGAAATCAATTTTAGCAAAGTTTAAAGATGATACGGTCTCAGAAGAAT CAACGGTTGAAATAAAAAAGATACATAATATAAAAGAAATGAAGGAATTATTTTTAGAAAAGAAAAATAGAATTTATATA GATTATACTTTAAGTGATGCCTCTATATATTCTAAGTTAGAACTTGAATATTTGGTTTTGGGTGAAGATAATAAAGGTAT TATTATATACTTTAAAGATATAATTTCTGAAAATAAAGATGAAGCATTAAAGGTTTTAAGAACGTTAATGGAAGATGAAA ATATTAAGAAAGTTATTCACGATGGAAAAAACTTTGTTACTTATTTAAATAAGAATAAAATTGAAATTAAAGGTTTTGAT TTTGATACAGCAATAGCAGCTTATTTAATAGACTCATCTAAAAATAAATATGAAATTTTAGAACTTGTTAATCGTTACAT TGGTGATAATCCAAATACCGAAGATGAGAACCTAAAAGGAATTCTTTCTAGTTACTTGCCAGAAATTTATGAGGAATTAA AAGAAACTCTTCATAAAGAAAATATGGATAAACTTTATTATGAAGTTGAGCATCCGCTTATTTATGTACTTTCATCTATG GAGAGCATTGGATTTAATATAAATAAAGGCATGCTAGATGAATTACAGATTAAGTTTAAGAAAGAAATAGAAGAAACTCA AAACGAAATATACAAATTGTCTGAAGAAGAATTTAATATAAGTTCTCCAAAGCAATTAGGAAAAATACTTTTTGAAAAAT TGGATTTACCAGTGCTCAAGAAGACTAAGACAGGATATTCAACTAATCAAGAGGTTCTAGAAAAGTTAATTGATAAACAT GAAATAATTCCAAAGATAATGTATTATAGGCAGATTACTAAAATTAACTCAACCTATGTTGAAGGATTAAAAAATGTAAT TGATGAAGATGGACGTATTCATTCAAACTTCAATCAAACTGTAACTACAACAGGAAGATTATCAAGTACAGAACCTAATT TGCAGAATATCCCAATAAAATATGAAATGGGTCGTGAAATAAGAAAAGTTTTTATACCTATGGAAGAAACTGATATACTT GTTTCATGCGACTATTCTCAAATTGAGTTGAGAGTTTTGGCACACATTGCTGGAGATGAAAATATGATAGATGCATTTGA ACATCATAGTGATATTCATACAAAGACAGCTTCAGAGGTTTTCAAAGTACCAATAGATGAGGTGACTTCTCTTATGAGAA GTAGAGCAAAAGCTGTTAACTTTGGAATAGTATATGGAATAAGTGCATTTAGTTTGGCAGAAGATTTAAAGATATCTAAA AAAGAAGCAGAAGAATATATGTCAATTTACTTAGAAAGATATCCGAAGATAAAAGAATATCTGGAAAATGTAGTTAAAGA AGCTCAAGAAAAAGGATATGTACTTACAATTTTAAATAGAAGAAGATTTATTCCAGAAATAAAAGCTTCAAATAAAATAG TAAAAGCTTTAGGAGATAGATTGGCAATGAATGCGCCAATTCAAGGAAGTGCTGCAGATATAATTAAGTTAGCAATGGTT AATGTTTATAATAAGTTAAATGAAAAGAATTTAAAGAGTGAATTGATTCTTCAAGTTCATGATGAACTTATATTAAATGT TAAAAAAGAAGAATTTGAAGAGGTTAAAAAGTTAGTTGCAGAAGAAATGGAAAATGCTATTAAACTAAAAGTAGCTCTAG ATGTAGATGTGAATTTTGGAAAAACATGGTATGATGCAAAATAA Protein sequence : MKKLLILDSNSLMNRAFYALPPLTNSDGINTNAIYGFINMLFKIKDEINPDSIIATFDLKAPTFRHKEYAEYKAGRNKMP PELAEQFPIIKDLFKLMGIKIFEIEGFEADDLIGTVSKFAENNATEVAIVTGDKDALQLASDSTKVIITKKGVSETAVYD SKTFIDEFEVTPTQFIDVKGLMGDKSDNIPGVPGVGEKTAFKLIKEYGSVEEVMKNIDNIPGKKLKENLENNVEQAIFSK KLATIMREVPIELTLDDINSMEKENIAEIKKMLIKLEMKSILAKFKDDTVSEESTVEIKKIHNIKEMKELFLEKKNRIYI DYTLSDASIYSKLELEYLVLGEDNKGIIIYFKDIISENKDEALKVLRTLMEDENIKKVIHDGKNFVTYLNKNKIEIKGFD FDTAIAAYLIDSSKNKYEILELVNRYIGDNPNTEDENLKGILSSYLPEIYEELKETLHKENMDKLYYEVEHPLIYVLSSM ESIGFNINKGMLDELQIKFKKEIEETQNEIYKLSEEEFNISSPKQLGKILFEKLDLPVLKKTKTGYSTNQEVLEKLIDKH EIIPKIMYYRQITKINSTYVEGLKNVIDEDGRIHSNFNQTVTTTGRLSSTEPNLQNIPIKYEMGREIRKVFIPMEETDIL VSCDYSQIELRVLAHIAGDENMIDAFEHHSDIHTKTASEVFKVPIDEVTSLMRSRAKAVNFGIVYGISAFSLAEDLKISK KEAEEYMSIYLERYPKIKEYLENVVKEAQEKGYVLTILNRRRFIPEIKASNKIVKALGDRLAMNAPIQGSAADIIKLAMV NVYNKLNEKNLKSELILQVHDELILNVKKEEFEEVKKLVAEEMENAIKLKVALDVDVNFGKTWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 2e-147 | 42 |
