Name : Cspa_c55010 (Cspa_c55010) Accession : YP_007458500.1 Strain : Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) Genome accession: NC_020291 Putative virulence/resistance : Virulence Product : bacteriocin-processing peptidase, cysteine peptidase, MEROPS family C39 Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 6145941 - 6148193 bp Length : 2253 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACTATAAGAAGAAAATATTGTTGTATTAAACAACAGGATATAACAGACTGTGGTCCAGCTTGTATAGGTACTATTGC AATGAAATATGGATTGAAACTTTCACTTTCTAAACTAAGAGAAATCTCTGGAACAGATTCAGAAGGAACATCTGTTTATG GAATTATGGAAGCTGCTAAAAGTTTAGGCTTTTCTGCTAAAGCAGTAAAGGTATCTAGTAACGAAGAAATATTTGATGAT TTAAAAACTCCTTTAATTGCACATGTAGTTGTCGATAGTATATTGCTGCATTATGTAGTAATACATAAAATTACTAAGGA AAGTATTTTGATTGCAGATCCAGCTAAAGGAATTGTTAAATACACTCCAAAAGAATTTTTCGACATATGGACTGGCGTAT TAGTTTTTATGGTTCCAACAGCTGATTTTAAAAAAGGGGATGAGACTAAAGGTCTTTTTGAAAGATTCTGGGGACTAATT AAAATTCAAAAAATCCTATTAGCAGAAATATTTATATCATCCATAATAATAACTCTCTTTGGAATAGGTGGATCATTTTA TTTCCAATTTTTAATAGATGATATACTACCTAACAACTTAAGTCAGAAACTATTATCAATATCTATGGCAATGCTTGTGC TTGCTATCTTTAAGATTTTAACTGAATTTTTTAGAAGGATACTACTTATACACATGGCACAAAATATAGATATTCCATTA TTGCTAGGCTATTATAATCATGTAATTAATTTACCTATGAAATTTTTTAGCACAAGAAAAGTTGGGGAGATTATTTCTAG ATTTAATGATGGATGTAAAATAAGAGATGCAATTTCATCAGCAACATTAACTTTAATGATTGATGTTTTGATGGCAATTG TAGGAGGTATTATTTTATATATTCAAAGTTCAAAGTTATTTTTTATTTGCTCAGTACCAATATGTTTATATTTAATTTTA GTATTTGGATTTAAAAATAACTTAGAAAAGGTAAATAGAAATGTTATGGAAGATGATGCAGCATTAACATCTTATTTAGT TGAATCGATAGAAGGGATAGAAACAGTAAAAGCCTTTAATGGCGAAAAAAAAGTAAAGATAGAGACAGAAGCCAAATTTA TGAAATTTATAAAAAGTTTATTTAAGCATGCTTACATATATAATCTTCAAGATACATTGATGAATGCTGTTAAAGGAATT TTTGGTGTATGTATTTTGTGGATTGGAGGTATTTTTGTTTTAAATAGGCAAATAACAATAGGCGAATTAATAAGCTTTAA TGCATTACTTGTATACTACATTGGACCAATAGAAAGGTTGATAAATTTACAGCCACAATTACAAAGTGCAGTAGTTGCAA GTGATAGATTGGGTGATATATTGGATTTAGAGTTAGAAAAGTCACAAGATGAAGCTAAAAAAATAAATCCTAAATCATTA TCGGGAGATATAGTTTTAAAAGATATTAATTTCAGATATGGATTAAGGGAATTAGTTTTAAAAAATATAAATATAAGTAT AAAACCAGGAGAGAAAATAGCTTTAGTTGGAGAAAGCGGATCTGGCAAGACTACAATTGCAAAACTCTTAATGGGATTTT ATAAAATAGAAAAAGGTGAAATTATATTAAATGGTTATAATATAAAAGATATAAATAAGGAAGTGTTAAGAGATAAGATT AGTTACGTATCTCAAGAGTCATTTTTATTTTCAGGGACAATAAAAGAAAATTTACAATTTGCAAGAAAAAATTTAACTGA TGAAGATATAATATCTATTTGTAAAAATGTAGAAATACATGATTATATAAATAGATTACCATTAAAGTATGAAACTCCTT TAGTAGAACGGGGAAGTAATCTTTCAGGAGGACAAAGACAAAGATTATCAATAGCTAGGGCTTTATTAAAAAATCCAGAT GTATTAATAATGGATGAAGCAACATCTAACTTAGATTCTATAACTGAAAAAGCAATACAAAAGACATTGGAAGAATGCTC GGGAAATGTAACCTCGATAATAATTGCTCATAGATTGAGTACGATTATGAAATGTGACAAAATATATGTTATTGATAGTG GCGAAATAGTAGAAGAAGGCACTCATAAAGAGTTATTGAAAAAAAGAGGCTATTATTATAGGTTATGGGGTGAACAAAGT ATTGAAAAATTAAATAAAAGCCTGCCATCTTCTATTAATAATATTAATAGAAATGATACAAATTTTAATTCAAAAAACTC ATTAAGCATATAA Protein sequence : MTIRRKYCCIKQQDITDCGPACIGTIAMKYGLKLSLSKLREISGTDSEGTSVYGIMEAAKSLGFSAKAVKVSSNEEIFDD LKTPLIAHVVVDSILLHYVVIHKITKESILIADPAKGIVKYTPKEFFDIWTGVLVFMVPTADFKKGDETKGLFERFWGLI KIQKILLAEIFISSIIITLFGIGGSFYFQFLIDDILPNNLSQKLLSISMAMLVLAIFKILTEFFRRILLIHMAQNIDIPL LLGYYNHVINLPMKFFSTRKVGEIISRFNDGCKIRDAISSATLTLMIDVLMAIVGGIILYIQSSKLFFICSVPICLYLIL VFGFKNNLEKVNRNVMEDDAALTSYLVESIEGIETVKAFNGEKKVKIETEAKFMKFIKSLFKHAYIYNLQDTLMNAVKGI FGVCILWIGGIFVLNRQITIGELISFNALLVYYIGPIERLINLQPQLQSAVVASDRLGDILDLELEKSQDEAKKINPKSL SGDIVLKDINFRYGLRELVLKNINISIKPGEKIALVGESGSGKTTIAKLLMGFYKIEKGEIILNGYNIKDINKEVLRDKI SYVSQESFLFSGTIKENLQFARKNLTDEDIISICKNVEIHDYINRLPLKYETPLVERGSNLSGGQRQRLSIARALLKNPD VLIMDEATSNLDSITEKAIQKTLEECSGNVTSIIIAHRLSTIMKCDKIYVIDSGEIVEEGTHKELLKKRGYYYRLWGEQS IEKLNKSLPSSINNINRNDTNFNSKNSLSI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 63 |
CPR_0658 | YP_697985.1 | lactococcin g processing and transport ATP-binding protein | Virulence | Not named | Protein | 1e-134 | 43 |