|
Name : glcB (Cspa_c47240) Accession : YP_007457731.1 Strain : Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) Genome accession: NC_020291 Putative virulence/resistance : Unknown Product : PTS system glucoside-specific EIICBA component GlcB Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.1.69 Position : 5162504 - 5164627 bp Length : 2124 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAGAGAAGATTTTTGGTGTTTTGCAACGTGTAGGAAGAGCATTTATGCTTCCAATCGCGATTTTACCAGTGGCAGG TCTTTTTTTAGGAATTGGTGGGTCGTTTACAAATAGTACAATGCTTGATGCCTATGGACTTACTGAGTTAATAGGTCCTG GTACAATTATTAATGCCCTTCTTTTAGTAATGAATGATGCAGGAAATATAGTATTCAATAACTTATCTTTAATATTTGCA ATAGGCGTTGCAATTGGTATGTCTAAAAAAGAAAAAGAAGTTGCAGCTTTAGCTGCTGGTATTGCATTTCTCATAATGCA TGCGTCACTTGGTGCTATGATTAAAATTCATGGTGGTTCTGAGGCAATGTTAACTGGGGCAACAGTATCAGTACTGGGTA TTACTTCATTACAAATGGGTGTTTTTGGTGGTATTATTGTAGGGCTTGGAACTGCTGTATTACATAACAAGTATTATAAA ATTAAATTTCCACAAGTATTATCATTCTTTGGTGGAACAAGGTTTGTACCTATTATTAGTTCTATAGTTTATTTAATTGT CGGAATTTTAATGTTTTATATTTGGCCACCAGTTCAAGGATGTATTTATAAAGTTGGAAGTATAGTACTTGCATCAGGCT ATGCTGGAACTTGGGTTTATGGGTTAATGGAACGTTTATTAATACCTTTTGGACTTCATCATGTATTCTATTTACCATTC TGGCAAACAGCAGTTGGTGGGACAGCAGAAGTTGGTGGTAAAGTTATTGAAGGTGCGCAAAATATATTCTTTGCAGAGCT TGGAACTCCAGGAATAACACACTTCAGCGTTTCAGCAACAAGATTTATGTCGGGTAAGTTTCCACTAATGATATTTGGTT TGCCTGGGGCAGCACTTGCAATGTATCAATGTGCTAAACCAGAAAAGAGAAAAGTAGTTGGTGGATTGTTATTATCAGCA GCTTTAACTTCAATGCTTACTGGGATTACAGAACCAATTGAATTTACATTCTTATTTGTTGCACCAGCATTATATGGAAT TCATTGTATATTTGCAGGAGCTGCATATATGTTAATGCACATGTGTGGTGTTGGCGTAGGCATGACATTTTCAGGTGGAT TTATTGATTTGTTTTTATTTGGTATATTACAAGGAAATGCTAAAACAAGTTGGATATGGGTTGTTATTGTAGGGATTGGA TATTTTGTGGTATACTATGTATTGTTTACATTTCTAATTAAGAAATTTGATTTAAAAACTCCAGGTCGTGAGGACGCTGA GGAAGTTAAATTGTATACAAGAAGCGATGTAAATGCTAAGAAAAATTCTCAAAGTGAAAATGTTGAAGATGTATTTTCAG CCATGGTTTGCAGAGCACTTGGTGGAAAAAAGAACATTTCAGATATTGATTGTTGTGCTACTAGATTACGTTGCACAGTA CATAAATCTGAATTGGTTGATGTGGCATTATTAAAACAAACTGGCGCATCAGGGGTAGTTCATAAAGGTACAGGGGTTCA GATTATATATGGACCAATGGTAACTGTTATTAAATCAAATTTAGAGGAGTATTTAATTACAGCTCCAAATGAAGAAGTTA TAATGGATACAGTATTAGAAAAAGAAAAAGCTGATGAAAAAGAAATTCAAGGAAAAATTATTAATACAATAATATTAAAT AGTCCATTAACAGGTGAAGCTAAAGATTTATCTGAGGCACCGGATGAAGCTTTTGCAAGCAAAATGATGGGAGATGGAGC AGTAGTTATTCCAAGTGAGGGTATAGTTGTAGCGCCAGCAGATGGGATGATAAGTTTTGTATTCCCTTCAAAGCATGCAG TTGGAGTAACCGTAGCTGATGGAATTGAATTACTTATACACATTGGAATAGATACAGTAAGACTTGATGGTAAAGGCTTT CAAACTTTTGTAAAAGATGGTGATAAAGTAAAAGCTGGTGACAAGTTATTAAGCTTTGACTTAGAATTTATAGAAAACAA TGCGCCATCAATTATATCACCATGTATTTGTACTACATTAAGCAGAAAGCAAAAAGTACGGTTATTAAAAATTGGTGAAG TAAAAATGGGAGAAGCTTTAATTGCAGTTGATATATTAGAATAA Protein sequence : MKEKIFGVLQRVGRAFMLPIAILPVAGLFLGIGGSFTNSTMLDAYGLTELIGPGTIINALLLVMNDAGNIVFNNLSLIFA IGVAIGMSKKEKEVAALAAGIAFLIMHASLGAMIKIHGGSEAMLTGATVSVLGITSLQMGVFGGIIVGLGTAVLHNKYYK IKFPQVLSFFGGTRFVPIISSIVYLIVGILMFYIWPPVQGCIYKVGSIVLASGYAGTWVYGLMERLLIPFGLHHVFYLPF WQTAVGGTAEVGGKVIEGAQNIFFAELGTPGITHFSVSATRFMSGKFPLMIFGLPGAALAMYQCAKPEKRKVVGGLLLSA ALTSMLTGITEPIEFTFLFVAPALYGIHCIFAGAAYMLMHMCGVGVGMTFSGGFIDLFLFGILQGNAKTSWIWVVIVGIG YFVVYYVLFTFLIKKFDLKTPGREDAEEVKLYTRSDVNAKKNSQSENVEDVFSAMVCRALGGKKNISDIDCCATRLRCTV HKSELVDVALLKQTGASGVVHKGTGVQIIYGPMVTVIKSNLEEYLITAPNEEVIMDTVLEKEKADEKEIQGKIINTIILN SPLTGEAKDLSEAPDEAFASKMMGDGAVVIPSEGIVVAPADGMISFVFPSKHAVGVTVADGIELLIHIGIDTVRLDGKGF QTFVKDGDKVKAGDKLLSFDLEFIENNAPSIISPCICTTLSRKQKVRLLKIGEVKMGEALIAVDILE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ef0067 | AAM75272.1 | EF0067 | Not tested | Not named | Protein | 3e-75 | 43 |
