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Name : Cspa_c38990 (Cspa_c38990) Accession : YP_007456913.1 Strain : Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) Genome accession: NC_020291 Putative virulence/resistance : Resistance Product : ABC transporter permease/ATP-binding protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 4221948 - 4223729 bp Length : 1782 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAAAAGAATCTAGTATGTCAAAGTTATTTGGATATGCCGGAAAATTTAAATATCTAACAATAGCTTCGTGGATATT GTCTGGGGCAAGTGCACTTTTGGCATTAATACCATTTGTGTATATATGGAAAATTATTAAAGATGTATTGGAGGTTTCAC CCAATTACAGTGCAGCTGAAAATCTATCATATTATGGTTGGATGGCAGTAGTTTTTTCGGCTTGTTCTATGGTTATTTAT ATAGGAGCTTTAATGTGCTCTCATATAGCGGCTTTTCGTGTTCAGGCTAATATGCGATCAAGAGCTATGCATCATATTCT CACCTTACCTTTAGGATTTATGGATGATGTTGGAAGTGGAAAGATTAGAAAAATTGTAAATGAGTCTAGTGCAGCGACTG AGACTTACTTAGCTCACCAATTGCCTGATAGAGCAGGTGCTTTAGCAACTCCAATTGGTCTGCTTGCTATGCTTTTGGTA TTTGATTGGCGTCTTGGAATGCTAAGTTTAATACCTGTTGTGATTGCTTTTATTATTATGTCAGCAATGACTGGAACCAA GATGAAGCAAAAAATGAAAGAATATCAAAATTCTTTAGAACAGATGTCAAATGAAGCAGTTGAATATGTTCGTGGTATAC CAGTTGTAAAAACCTTTGGACAGTCTGTATTTTCTTTTAAGCGATTTAAAAGTTCCATAGACAGTTATGAAAAGTGGGTT ATTTCTTATACTAAGGATTTACGTATGCTAATGGTATTTTATACTACAGCGATTAATTCAGTTTTTGCTGTATTAATAGG AGTTGCTTTAGTTTTTACCCAGAATGGAGTTACAAATGAGTTTTTATTAAATCTTTTGTTCTATATTATAATTACTCCTA TTATAACAGTTACATTAAATAAAATTATGTTTTCTAGTGAAAATATGATGATAGTTGAGGATGCATTAGAGCGTATTGAC AGCATAATGGATATAAAGCCATTAGTAGAAACCAAAGCACCTAAAAATCCAAAAGATAACTCAGTGGTACTTAAGGATGT GTCCTTTCACTATAAAGATGCAAAAGAAAATGCCTTAAACCGAATTTCATTGAAAATTAATCCAGGTGAGCATGTAGCTT TTGTTGGTCCCTCCGGAGGTGGGAAAACAACTTTAGCTAGTGTAATAGCTCGTTTTTGGGATGTAGATAGTGGGGAAGTT TTAATTGGAAACGTAAATGTTAAGGATATTCCAAAAGAAGAATTGATGAATATAGTATCCTTTGTATTTCAAGACAGTAG ACTTTTGAAAACTTCCATTTTGGAAAATGTTAGACTTGCCAAACCAAACGCCACAAGGGAAGAAGTATTAAAAGCACTAA AAGATGCTCAGTGTGAGGATATTATAGAAAAAATGACAGATGGAATTGATACTATAATTGGAACAAAAGGAAATTACCTT TCAGGAGGTGAGATGCAACGTATTTCTATTGCAAGAGCTATGTTAAAAAATGCTCCTATTTTAATACTGGACGAAGCTAC AGCTTTTGCTGATCCAGATAATGAAGCAAAGGTGCAAGAGGCGTTCTCAATTTTATCAAAAGAAAAAACAGTATTTATGA TAGCACATAGACTTTCTACTGTTATAGAAACAGATTGTATCTATGTTTTAAAAGATGGAGGTATCTGTGAATTTGGAACT CATTCAGAATTAATACAACAAGAGGGATTATATTCACATATGTGGAACCAATATAATGGTGCTGTAAAATGGAAGGTTGG TGTTAAAAGTGAAATTAATTGA Protein sequence : MKKESSMSKLFGYAGKFKYLTIASWILSGASALLALIPFVYIWKIIKDVLEVSPNYSAAENLSYYGWMAVVFSACSMVIY IGALMCSHIAAFRVQANMRSRAMHHILTLPLGFMDDVGSGKIRKIVNESSAATETYLAHQLPDRAGALATPIGLLAMLLV FDWRLGMLSLIPVVIAFIIMSAMTGTKMKQKMKEYQNSLEQMSNEAVEYVRGIPVVKTFGQSVFSFKRFKSSIDSYEKWV ISYTKDLRMLMVFYTTAINSVFAVLIGVALVFTQNGVTNEFLLNLLFYIIITPIITVTLNKIMFSSENMMIVEDALERID SIMDIKPLVETKAPKNPKDNSVVLKDVSFHYKDAKENALNRISLKINPGEHVAFVGPSGGGKTTLASVIARFWDVDSGEV LIGNVNVKDIPKEELMNIVSFVFQDSRLLKTSILENVRLAKPNATREEVLKALKDAQCEDIIEKMTDGIDTIIGTKGNYL SGGEMQRISIARAMLKNAPILILDEATAFADPDNEAKVQEAFSILSKEKTVFMIAHRLSTVIETDCIYVLKDGGICEFGT HSELIQQEGLYSHMWNQYNGAVKWKVGVKSEIN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| smi_1698 | YP_003446800.1 | multidrug ABC transporter ATPase/permease | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 3e-117 | 43 |
