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Name : treA (Cspa_c24090) Accession : YP_007455428.1 Strain : Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) Genome accession: NC_020291 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase TreA Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.2.1.93 Position : 2649426 - 2651072 bp Length : 1647 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAGGATTTTAAGAAAAGTACCGTCTATCAAATATATCCTAAATCATTTTATGATACAAATGGTGATGGCGTTGGAGA TTTAAATGGAGTAATAGAAAAATTAGATTATTTAAAAAATTTAGGTATAGATTATATATGGCTTACCCCTTTTTATCCTT CACCTCAAGTGGACAATGGTTATGATATAGCAGATTACTATAATATAGATCCAAACTTTGGAACTCTAGAAGATTTTGAA AAATTAGTTGAAGAAGCTAGAGAAAGAAATATCTATATAATGCTTGATATGGTCTTAAATCATACGTCAACGGAGCATCA GTGGTTTAAAAAAGCATTGAATGGTGAAGAAAAATATAAAGCATTTTACTTTTTTAAAGAGCCAATAAATAATGCTGAGC CAACAAATTGGGAATCTAAATTTGGTGGAAATGCTTGGCAGTATGTTGAAAAGTTTGATGAATATTACTTGCATCTTTTT GATAAGACTCAAGCAGATTTAAATTGGGACAATGAAGAGGTTAGGAAAGAGATTTATTCTATAGTTAACTTTTGGATAAA CAAAGGCGTAAAAGGCTTAAGGTTTGATGTTATAAATTTAATATCAAAGCCAGAAAAGTTTGAAAATGATTTTAATGGTG ACGGAAGAAGGTTTTATACAGATGGTCCAAGAATTCATGAATATCTTAAGGAACTTAATCAAAACACCTTTGGAAAACAT GAAGATATTATAACTGTTGGAGAAATGTCCTCCACATCACTTGAAAATTGTCTGAAATATTCAAAGTCACAAGAAAATGA ATTATCAATGGTATTTAATTTTCATCACTTAAAGGTTGATTACAATAACCAAAATAAATGGGAATTGAAAGCATGTGATT TTAAAGATTTGAAGATGTTATTTAATGAATGGCAGCTAGGTATGGAAGAAGGTTGGAATGCTTTGTTTTGGTGCAACCAT GACCAACCACGTATAGTTTCTAGATTTGGAAATGATAGAAAATATCATAAAGAATCTGCTAAAATGCTGGCAACAATGCT TCACTTACTTAGGGGAACACCTTATGTGTATCAAGGTGAAGAAATTGGAATGACTAATGCATATTTTACAAATATTAATC AATATGTTGATGTTGAAAGTTTGAATTATTTCAGAATACTAAAAGAACAAGGAATAGCTGAAGAAGATATATATAAGGTT TTACAAGAGCGTTCAAGAGATAATTCAAGAACACCAATGCAATGGAATAAGTTCTTAAATGCAGGTTTTAGTGATGGAAA ACCGTGGCTTAGTGTGAATGACAATTATAATGAAATTAATGTTGAGGATAGTTTAAAGGATAAAAATTCAATATTTTATC ATTATAAAAGACTAATTTCTTTAAGAAAGGAATATGATGTTGTAGCTTATGGAAACTATGTCCCTTTATTAAATGAAAAT AATAATGTTTTTGCATATAAAAGAGAATATCTTGAGGAGTCTTTAATTGTAATAAATAATTTTTATGAAACAGAAGTAAC TGCTGTTCTAGATATTGAAGAATTAGAAAGCTATAAGTGTATTATCACAAATTATGAGGAAAGAAATTTAAAACAAATAT TTTCTTTAAAACCATTTGAATCTATAGCATTTTTAAAAATAAATTAA Protein sequence : MKDFKKSTVYQIYPKSFYDTNGDGVGDLNGVIEKLDYLKNLGIDYIWLTPFYPSPQVDNGYDIADYYNIDPNFGTLEDFE KLVEEARERNIYIMLDMVLNHTSTEHQWFKKALNGEEKYKAFYFFKEPINNAEPTNWESKFGGNAWQYVEKFDEYYLHLF DKTQADLNWDNEEVRKEIYSIVNFWINKGVKGLRFDVINLISKPEKFENDFNGDGRRFYTDGPRIHEYLKELNQNTFGKH EDIITVGEMSSTSLENCLKYSKSQENELSMVFNFHHLKVDYNNQNKWELKACDFKDLKMLFNEWQLGMEEGWNALFWCNH DQPRIVSRFGNDRKYHKESAKMLATMLHLLRGTPYVYQGEEIGMTNAYFTNINQYVDVESLNYFRILKEQGIAEEDIYKV LQERSRDNSRTPMQWNKFLNAGFSDGKPWLSVNDNYNEINVEDSLKDKNSIFYHYKRLISLRKEYDVVAYGNYVPLLNEN NNVFAYKREYLEESLIVINNFYETEVTAVLDIEELESYKCIITNYEERNLKQIFSLKPFESIAFLKIN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-126 | 48 |
