Gene Information

Name : BCUE_0310 (BCUE_0310)
Accession : YP_007449142.1
Strain : Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E
Genome accession: NC_020285
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : arginine decarboxylase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 98145 - 100400 bp
Length : 2256 bp
Strand : +
Note : Coenzyme metabolism; SecretomeP prediction: 0.08

DNA sequence :
ATGAGATTTTTATTTCCTATTTTTATAATTGATGAAGATTATCGTTCTGAAAATGTTTCTGGTCTTGGTATTAGGGCGCT
GGCCGATGCTATAGAAGCCCAGGGAGTGAAAGTTATAGGCGTTACAGGCTACGGAGACATAAGTTCATTTGCTCAACAGC
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GGCTCATCGCGAAGTGGAGAGAGTTAAGATATCCGATCTAGAAGGGCGCATTACAGGAGTGTTGCTAACACCATATCCGC
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GATGAGTATCCAGGATTTGAGAATTATATGCATGGATTAACTATAGATATTAATGAGGAAGGCCATAAAAATTATTATGT
TGATTGCTTAGCTTAA

Protein sequence :
MRFLFPIFIIDEDYRSENVSGLGIRALADAIEAQGVKVIGVTGYGDISSFAQQQSRASAFILSIDDEEFDVDSPEDVASI
IKKLRAFIGELRFRNADIPIYLYGETRTSEHIPNDILRELHGFIHMFEDTPEFVARHIIREANSYVASLAPPFFRELVKY
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DIARLTTEMYLSEMIPAMKPSEAFAKMAHREVERVKISDLEGRITGVLLTPYPPGIPLLIPGERFNKIIVNYLEFVRDFN
DEYPGFENYMHGLTIDINEEGHKNYYVDCLA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed CAD66195.1 putative cadaverin decarboxylase Virulence PAI III 536 Protein 1e-104 43
cadA NP_756988.1 lysine decarboxylase, inducible Not tested PAI II CFT073 Protein 1e-107 41

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
BCUE_0310 YP_007449142.1 arginine decarboxylase VFG1670 Protein 9e-105 43