Name : BCUE_0310 (BCUE_0310) Accession : YP_007449142.1 Strain : Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E Genome accession: NC_020285 Putative virulence/resistance : Virulence Product : arginine decarboxylase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 98145 - 100400 bp Length : 2256 bp Strand : + Note : Coenzyme metabolism; SecretomeP prediction: 0.08 DNA sequence : ATGAGATTTTTATTTCCTATTTTTATAATTGATGAAGATTATCGTTCTGAAAATGTTTCTGGTCTTGGTATTAGGGCGCT GGCCGATGCTATAGAAGCCCAGGGAGTGAAAGTTATAGGCGTTACAGGCTACGGAGACATAAGTTCATTTGCTCAACAGC AAAGTCGCGCTAGTGCATTTATTTTATCTATCGATGATGAGGAGTTCGATGTTGATTCCCCTGAAGATGTGGCAAGTATT ATAAAAAAACTACGTGCTTTTATTGGAGAATTAAGATTTCGTAATGCTGATATTCCGATATATCTATATGGGGAAACTAG AACATCTGAACATATTCCAAATGATATTCTTAGAGAATTGCATGGTTTTATACATATGTTTGAAGACACTCCAGAGTTTG TTGCTAGACATATAATAAGAGAAGCTAATAGCTATGTGGCTTCTTTAGCGCCACCTTTCTTTAGGGAATTAGTTAAATAT GCCCAAGATGGGTCGTATTCTTGGCATTGCCCAGGTCATTCTGGTGGAGTTGCATTTCTAAAGAGCCCAGTTGGACAAAT GTTTCATCAATTTTTTGGCGAAAACATGCTTCGTGCAGACGTATGTAATGCTGTTGATGAATTGGGGCAATTATTGGATC ATACAGGTCCTGTTGCTGAATCTGAGCTTAATGCGGCACGTATCTTTCATGCTGATCGTTGTTATTTCGTTACTAACGGA ACATCAACATCTAATAAAATTGTTTGGCATGCAAATGTTGCTAATGACGATATAGTATTAGTTGATCGTAATTGTCATAA GTCTATTTTACATGCTATAACTATGACAGGAGCGATTCCTGTTTTTCTAAGACCTACACGCAATAATTTTGGAATAATAG GTCCAATTCCTTTGGATGAATTTGATCCTGAAAATATTAATAAGAAGATATTGTCAAATCCATTAGCAAAAAAAATAACA AATAAAAAACCAAGAATATTAACACTTACTCAAAGCACATATGATGGTGTTATTTATAATGTTGAAATGATAAAAAATCA TCTAGATGGTTATGTTGATACTCTTCATTTTGATGAGGCTTGGTTACCGCATGCATCATTCCATGATTTCTATAAAGATA TGCATGCCATTGGAGAAAATAGACCTAGAGGTAGTACCTCTATGATTTTTGCTACTCACTCTACACATAAGTTATTAGCT GGAATATCCCAAGCATCTCAAATAATTGTTCAGGAGCCGACCAATAGAAAGTTTGATCACTCAGCTTTTAATGAGGCTTA TTTAATGCATACTTCCACATCGCCGCAGTATGCCATTATAGCTTCTTGTGATGTTGCTGCTGCGATGATGGAGCCTCCAG GTGGTACAGCATTAGTTGAGGAAAGTATAAGAGAGGCAATGGATTTTAGACGAGCTATGCGCAAGGTGGAGTCTGAATTT GGTAAAAATGATTGGTGGTTTAAGGTTTGGGGACCTAACCGTATGGCTCATGAAGGCATAGGTAATCGTGAGGATTGGAT GTTAGATTCTGATGATCAATGGCATGGCTTTGGAGATCTAGCATGTAGTTTTAATATGTTAGATCCTATAAAGACTACAA TCGTAACTCCAGGACTTAGTATTTCTGGTAGTTTTGGGGAATCAGGTATTCCAGCTTCATTAGTATCTAAGTATTTAGCA GAACATGGAGTTGTTGTAGAAAAAACAGGTCTTTATTCTTTTTTCATTCTATTTACAATTGGTATTACTAAGGGACGATG GAATAGTTTATTGACTGCTTTACAGCAGTTTAAAGATGATTATGATCGCAATCAGCCGATGTGGCGCATATTACCAGACT TCTGTAAGTTACATAGGAAATATGAGCGGTTAGGCATTAGAGATTTATGTTATAAAATTCATAATACATATCGAGAATAC GATATAGCTCGTCTTACAACTGAGATGTATTTAAGTGAAATGATTCCGGCAATGAAGCCATCAGAAGCTTTTGCTAAGAT GGCTCATCGCGAAGTGGAGAGAGTTAAGATATCCGATCTAGAAGGGCGCATTACAGGAGTGTTGCTAACACCATATCCGC CTGGAATACCATTGCTAATCCCAGGAGAACGTTTCAACAAGATAATTGTTAATTATTTGGAGTTTGTTCGGGATTTCAAT GATGAGTATCCAGGATTTGAGAATTATATGCATGGATTAACTATAGATATTAATGAGGAAGGCCATAAAAATTATTATGT TGATTGCTTAGCTTAA Protein sequence : MRFLFPIFIIDEDYRSENVSGLGIRALADAIEAQGVKVIGVTGYGDISSFAQQQSRASAFILSIDDEEFDVDSPEDVASI IKKLRAFIGELRFRNADIPIYLYGETRTSEHIPNDILRELHGFIHMFEDTPEFVARHIIREANSYVASLAPPFFRELVKY AQDGSYSWHCPGHSGGVAFLKSPVGQMFHQFFGENMLRADVCNAVDELGQLLDHTGPVAESELNAARIFHADRCYFVTNG TSTSNKIVWHANVANDDIVLVDRNCHKSILHAITMTGAIPVFLRPTRNNFGIIGPIPLDEFDPENINKKILSNPLAKKIT NKKPRILTLTQSTYDGVIYNVEMIKNHLDGYVDTLHFDEAWLPHASFHDFYKDMHAIGENRPRGSTSMIFATHSTHKLLA GISQASQIIVQEPTNRKFDHSAFNEAYLMHTSTSPQYAIIASCDVAAAMMEPPGGTALVEESIREAMDFRRAMRKVESEF GKNDWWFKVWGPNRMAHEGIGNREDWMLDSDDQWHGFGDLACSFNMLDPIKTTIVTPGLSISGSFGESGIPASLVSKYLA EHGVVVEKTGLYSFFILFTIGITKGRWNSLLTALQQFKDDYDRNQPMWRILPDFCKLHRKYERLGIRDLCYKIHNTYREY DIARLTTEMYLSEMIPAMKPSEAFAKMAHREVERVKISDLEGRITGVLLTPYPPGIPLLIPGERFNKIIVNYLEFVRDFN DEYPGFENYMHGLTIDINEEGHKNYYVDCLA |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | CAD66195.1 | putative cadaverin decarboxylase | Virulence | PAI III 536 | Protein | 1e-104 | 43 |
cadA | NP_756988.1 | lysine decarboxylase, inducible | Not tested | PAI II CFT073 | Protein | 1e-107 | 41 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
BCUE_0310 | YP_007449142.1 | arginine decarboxylase | VFG1670 | Protein | 9e-105 | 43 |