Gene Information

Name : CDEE_0314 (CDEE_0314)
Accession : YP_007447688.1
Strain : Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E
Genome accession: NC_020283
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : arginine decarboxylase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 4.1.1.19
Position : 97078 - 99330 bp
Length : 2253 bp
Strand : +
Note : Amino acid transport and metabolism; SecretomeP prediction: 0.13

DNA sequence :
ATGCAAATGAAGTTCTTGTTTCCAATTTTTATCATAGATGAGGATTATCGTTCAGATAATGCCTCTGGTTTAGGAATCAG
AGCATTGGCAGATGCTATTGAAGCACAAGGTATGCAGGTTATTGGAGTAACTGGTTACAATGATATAAGCTCTTTTGCTC
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AAATATGATGTAGCAAGATTAACTACTGAAATGTATTTGAGTGATATGGTGCCTGTTATGAAGCCATCTGATGCTTTTGC
AAAAATTGCTCATCGTGAGGTAGAAAAGGTTGAAATTTCTCAATTGGAGGGTCGAGTTACTGGTGTTTTATTAACTCCAT
ATCCACCGGGTATTCCATTGCTAATTCCTGGTGAAAGATTTAATAAAATTATTATCAAGTACCTAGAGTTTGCTCAGATT
TTTAATAATAATTTTCCAGGTTTTGAAAACTATATACATGGCTTAACAATTGATAATAATACTAAACAATACTATATAGA
TTGTTTAAAATAA

Protein sequence :
MQMKFLFPIFIIDEDYRSDNASGLGIRALADAIEAQGMQVIGVTGYNDISSFAQQQSRASAFILSIDDEEFDVDSPEDVA
TAIKKLRVFIGEVRFRNSDIPIYLYGETRTSEHIPNDILRELHGFIHMFEDTPEFVARHIIREANSYIASLAPPFFRELV
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FNNNFPGFENYIHGLTIDNNTKQYYIDCLK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed CAD66195.1 putative cadaverin decarboxylase Virulence PAI III 536 Protein 2e-103 42

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
CDEE_0314 YP_007447688.1 arginine decarboxylase VFG1670 Protein 1e-103 42