Name : CDEE_0314 (CDEE_0314) Accession : YP_007447688.1 Strain : Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E Genome accession: NC_020283 Putative virulence/resistance : Virulence Product : arginine decarboxylase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 4.1.1.19 Position : 97078 - 99330 bp Length : 2253 bp Strand : + Note : Amino acid transport and metabolism; SecretomeP prediction: 0.13 DNA sequence : ATGCAAATGAAGTTCTTGTTTCCAATTTTTATCATAGATGAGGATTATCGTTCAGATAATGCCTCTGGTTTAGGAATCAG AGCATTGGCAGATGCTATTGAAGCACAAGGTATGCAGGTTATTGGAGTAACTGGTTACAATGATATAAGCTCTTTTGCTC AGCAACAAAGTAGGGCAAGTGCTTTCATTCTCTCTATAGATGATGAAGAGTTTGATGTAGATTCTCCGGAAGATGTGGCA ACTGCTATTAAGAAATTGCGAGTATTTATAGGGGAAGTAAGGTTTCGTAATTCTGATATACCAATTTATTTATATGGTGA AACAAGGACATCAGAACACATTCCTAATGATATATTGCGAGAGCTACATGGATTTATTCATATGTTTGAAGACACACCAG AATTTGTTGCTCGTCATATAATCAGAGAAGCTAATAGTTATATAGCTAGTCTTGCTCCTCCATTTTTTAGAGAATTAGTG AAATATGCGCAGGATGGTTCTTATTCTTGGCATTGTCCAGGACATTCTGGTGGTGTAGCTTTTCTAAAAAGTCCTGTCGG TCAGATGTTTCATCAGTTTTTTGGTGAAAACATGTTGCGCGCAGATGTTTGTAATGCAGTTGATGAGCTAGGTCAACTAC TTGATCATACTGGCCCAATATCTGATTCTGAAATTAATGCTGCTCGTATTTTTAATGCAGATCACTGTTATTTTGTTACC AATGGTACTTCTACATCAAACAAAATAGTATGGCATGCAAATGTTGCGGCAAATGATATAGTATTGGTTGATCGTAACTG TCATAAATCTATATTGCATGCAATAATTATGACTGGTGCAATCCCTGTGTTTTTAAAGCCTACTAGAAATAATTTTGGTA TTATTGGGCCAATAGCTCTAAGTGAATTTGATCCATCAAATATTAGAAAGAAAATAGAAGAGAATCCACTTACTAAGAAT CTCGAAAATAAGAAACCAAGAATTTTAACTTTAACTCAAAGTACTTATGATGGTGTCATATATAATGTTGAAATGATAAA AGAATACTTAGATGGTTATGTTGATACCTTGCATTTTGATGAGGCATGGTTACCACACGCATCTTTTCATGATTTTTATC GCAATATGCATGCTATAGGACAAGAAAGACCACGTAATGTAAACTCAATTGTTTTTGCTACTCATTCAACTCATAAATTA TTAGCTGGAATATCACAAGCTTCTCAAATTATTGTACAAGAGTCACAGAATAGTAAATTTGATCACGCTTCTTTTAATGA AGCGTATTTGATGCATACCTCTACTTCTCCACAGTACGCAATTATTGCATCTTGCGATGTTGCTGCTGCTATGATGGAAC CTCCAGGTGGAACTGCCTTGGTAGAGGAAAGTATAAGAGAAGCTATGGATTTTAGGCGAGCGATGCGCAAAGTTGAATCA GAGTATGGTAAAGATGACTGGTGGTTTAAAATATGGGGTCCAAATAAAATAATGCCTGATAGAATAGGTAGTCAGGATGA TTGGATGCTTGACTCTGATAATCAGTGGCATGGATTTGGTCAGCTAGCTGATAATTTTAATATGCTTGATCCAATTAAAG TTACAATAATTACACCAGGGTTAAGCATGTCAGGTAGTTTCGATGAAACTGGGATTCCTGCTTCTCTAGTCTCTAAATAT CTTACAGGACATGGGGTTGTAGTAGAAAAAACTGGTCTTTACTCTTTTTTTATTTTATTTACTATTGGGATAACTAAAGG ACGCTGGAATACTTTATTAACTGCTTTGCAACAATTTAAGGATGATTATGATCGTAATCAACCAATGTGGAGAATATTGC CTGAGTTTTGTAAAATCAATAAAAAATACGAAAAACTTGGTTTAAGAGATTTATGTGACTTGATACATGAAGATTATCGT AAATATGATGTAGCAAGATTAACTACTGAAATGTATTTGAGTGATATGGTGCCTGTTATGAAGCCATCTGATGCTTTTGC AAAAATTGCTCATCGTGAGGTAGAAAAGGTTGAAATTTCTCAATTGGAGGGTCGAGTTACTGGTGTTTTATTAACTCCAT ATCCACCGGGTATTCCATTGCTAATTCCTGGTGAAAGATTTAATAAAATTATTATCAAGTACCTAGAGTTTGCTCAGATT TTTAATAATAATTTTCCAGGTTTTGAAAACTATATACATGGCTTAACAATTGATAATAATACTAAACAATACTATATAGA TTGTTTAAAATAA Protein sequence : MQMKFLFPIFIIDEDYRSDNASGLGIRALADAIEAQGMQVIGVTGYNDISSFAQQQSRASAFILSIDDEEFDVDSPEDVA TAIKKLRVFIGEVRFRNSDIPIYLYGETRTSEHIPNDILRELHGFIHMFEDTPEFVARHIIREANSYIASLAPPFFRELV KYAQDGSYSWHCPGHSGGVAFLKSPVGQMFHQFFGENMLRADVCNAVDELGQLLDHTGPISDSEINAARIFNADHCYFVT NGTSTSNKIVWHANVAANDIVLVDRNCHKSILHAIIMTGAIPVFLKPTRNNFGIIGPIALSEFDPSNIRKKIEENPLTKN LENKKPRILTLTQSTYDGVIYNVEMIKEYLDGYVDTLHFDEAWLPHASFHDFYRNMHAIGQERPRNVNSIVFATHSTHKL LAGISQASQIIVQESQNSKFDHASFNEAYLMHTSTSPQYAIIASCDVAAAMMEPPGGTALVEESIREAMDFRRAMRKVES EYGKDDWWFKIWGPNKIMPDRIGSQDDWMLDSDNQWHGFGQLADNFNMLDPIKVTIITPGLSMSGSFDETGIPASLVSKY LTGHGVVVEKTGLYSFFILFTIGITKGRWNTLLTALQQFKDDYDRNQPMWRILPEFCKINKKYEKLGLRDLCDLIHEDYR KYDVARLTTEMYLSDMVPVMKPSDAFAKIAHREVEKVEISQLEGRVTGVLLTPYPPGIPLLIPGERFNKIIIKYLEFAQI FNNNFPGFENYIHGLTIDNNTKQYYIDCLK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | CAD66195.1 | putative cadaverin decarboxylase | Virulence | PAI III 536 | Protein | 2e-103 | 42 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
CDEE_0314 | YP_007447688.1 | arginine decarboxylase | VFG1670 | Protein | 1e-103 | 42 |