Gene Information

Name : CDEE_0352 (CDEE_0352)
Accession : YP_007447718.1
Strain : Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E
Genome accession: NC_020283
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 2.2.1.1
Position : 131859 - 133916 bp
Length : 2058 bp
Strand : +
Note : Carbohydrate transport and metabolism; SecretomeP prediction: 0.14

DNA sequence :
ATGAACAAAGACATATATAAATCTAAAATTGTTTTGGCTGATGCCATTCGTGTTCTAGCAATGGATGCAGTGCAGCAAGC
TAACTCTGGGCATCCTGGTGCTCCTATGGGTATGGCAGAGATGGCACAGGCAATATGGAAAGATAATTTAAAACATAATC
CAAATGATCCAGGATGGATTAATAGAGATCGTTTTGTTTTGTCAAATGGTCACAGTTCTATGTTGCTTTACGCTGTTTTG
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TATGAATGGTATTGCATTGCATGGAGGCTACTTGCCTTTTGGCGGAACATTTTTAACTTTCTCAGATTATTCTCGTAATG
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CCCACTCATCAGTCTATTGAACATGTGGCTAGTTTACGTCTGATTCCAAATTTATCAGTATGGAGGCCTTGTGATACTGT
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CATTATTGCTTTCCAGGCAAAACCTTCCTTTTGTCGAACGTGATTCTTCTACAATTAACTCTATAGAAAAGGGCGGTTAT
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GGAAAGAAAAAGTTTTGCCAGGCAATCTTCCAAAGATTGCAATAGAAGCTGGTGTAACTTCCGGATGGTATAAGTATGTT
GGCTTAGATGGTTTGGTTTTAGGTATAGATCGTTATGGAGAATCAGCTCCAGCCGGAGAGTTATTTAAATTTTTTGGATT
GACATCAGATAATGTTGTTTCGTCAGTGAAAAAGATTTTGTCATTGAAAGGGGTTTAG

Protein sequence :
MNKDIYKSKIVLADAIRVLAMDAVQQANSGHPGAPMGMAEMAQAIWKDNLKHNPNDPGWINRDRFVLSNGHSSMLLYAVL
HLTGYDVSMNDIRNFRQLHSKTPGHPEVGITPGIETTTGPLGQGLANAVGMALAESLLAEEFNKPGFDIINHNTYAMVGD
GCLMEGISHEVCSLAGTLKLSKLIVLYDDNGISIDGNVKHWFNDDTAGRFRGYGWNVITDINGHDASAINAAIKLARSQS
KKPTIIICKTTIGKGSPNMAGTHNVHGSPLGKDEILASREFLGWPHDPFVIPQEMYDAWDARESGEKAQAIWKSKFDSYA
IEYPSFAHELKRRMNGELPCNFDEFVQNFIKTTVKKAETLATRKASQLAIAEIANTLPEFLGGSADLTGSNYTDWKGVAP
VRAANDKGISFGRHINYGVREFGMAAIMNGIALHGGYLPFGGTFLTFSDYSRNAIRMAALMKQRVIHVFTHDSIGLGEDG
PTHQSIEHVASLRLIPNLSVWRPCDTVETVVAWEYAIKRPVSVGMDVRDGGPTALLLSRQNLPFVERDSSTINSIEKGGY
ILKDVDNAQAIIIATGSEIAIALDAQNKLNELGIGVRIVSMPSTDVFDKQDNSWKEKVLPGNLPKIAIEAGVTSGWYKYV
GLDGLVLGIDRYGESAPAGELFKFFGLTSDNVVSSVKKILSLKGV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 60
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 7e-174 55