|
Name : Cst_c17650 (Cst_c17650) Accession : YP_007373355.1 Strain : Clostridium stercorarium DSM 8532 Genome accession: NC_020134 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transposase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1919305 - 1920576 bp Length : 1272 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGTCTCTTAATGATTGTATAATAAATTTATTAAATTTAAAAGATGAAAATATAAAATTTGATGATAACTTTTATTCTGA AGAAACCATTGATCATGTTGAATCGAAGATGTTTCACGGTATCTTAAGCTATACCCCTGATGCTTGCTATAATTGTGGAC ATGTTATGGATAATAATATTATTAAACATGGCTTTAAAACATCTACTATCAAGATTCCTAAGGTATCTGGTTTTAATGCT TATTTAAAATTAAAGAAACAACGTTATTACTGTAAACATTGTAATTCTACCTTTACCCTTAAGACCAATATTGTTAATAA AAATTGCTATATCTCTAATAATACTAAAGTTTCTATAGCTCTTAGCGCTAAGGATAAACTATCTGAAAAGGATATTGCCA AGAATCATAATGTTTCTCACTCAACTGTAAATAGGGTGATTGATAGCTTCTATCAGCACTATAAACCTAAGTTTAACTAT CTACCTAAACATTTATGCTTTGATGAATTTAAATCAGTTAAATCAGCTGATGGGGCAATGTCCTTCATATTTTGTGATGC AGACACTGGTCAAATTGTTGATATCGTTGAAGATAGAAGATTACATGTACTTAATAATTATTTTATGAAGTACTCTAAGG CAGCTAGAAATGCTGTAAGAACTGTAGTTATTGATATGTACAGTCCCTATATCTCATTAATTAAGTCTATATTCCCAAAA GCTAAAATTATTATTGATAAGTTTCATATAATTCAATTATTTAGCAGAGCTTTAAATAAAACAAGAATAAAAATTATGAA CAAGGATAAGAAGAACTACAATAAATTTAAAAAGTATTGGAAGCTTCTCTTAAAAGATACATCATCAATTAACTATACTA CGTACAATTATCATAGATCCTTTAAGAAGCCAATGAGAGAAATAGATATCATTAACTATTTAATTGACCTAGATCCAGAG CTTAAAGCAACTTATGAGTTATATCACGATATTAGATATTGTATTAAACACAAGGATTTCTCATTATTAAATAGAACTTT ATCTAATGTAAATAACCTAATTTCCGACTATATGAAGACATCAGTTAAGACCCTACAGAAGTACATAGGTTACATAGAAA ATTCATTTATATATGACTATACAAATGGTATCTTAGAAGGCATAAACAACAAAATTAAAGTTATTAAGCGAATAGCATTT GGTTATAGAAGCTTTTATCATTTTAGAAATAGGATACTCATTACACAAAACTTAGCAACATTAAAGGCTTAG Protein sequence : MSLNDCIINLLNLKDENIKFDDNFYSEETIDHVESKMFHGILSYTPDACYNCGHVMDNNIIKHGFKTSTIKIPKVSGFNA YLKLKKQRYYCKHCNSTFTLKTNIVNKNCYISNNTKVSIALSAKDKLSEKDIAKNHNVSHSTVNRVIDSFYQHYKPKFNY LPKHLCFDEFKSVKSADGAMSFIFCDADTGQIVDIVEDRRLHVLNNYFMKYSKAARNAVRTVVIDMYSPYISLIKSIFPK AKIIIDKFHIIQLFSRALNKTRIKIMNKDKKNYNKFKKYWKLLLKDTSSINYTTYNYHRSFKKPMREIDIINYLIDLDPE LKATYELYHDIRYCIKHKDFSLLNRTLSNVNNLISDYMKTSVKTLQKYIGYIENSFIYDYTNGILEGINNKIKVIKRIAF GYRSFYHFRNRILITQNLATLKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tnp | YP_251945.1 | transposase for ISSha1 | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-66 | 44 |
| tnp | YP_251995.1 | transposase for ISSha1 | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-65 | 43 |
