|
Name : Halha_0964 (Halha_0964) Accession : YP_007315018.1 Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150 Genome accession: NC_019978 Putative virulence/resistance : Virulence Product : DNA mismatch repair protein MutS Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 950433 - 953069 bp Length : 2637 bp Strand : + Note : PFAM: MutS family domain IV; MutS domain II; MutS domain V; MutS domain I; MutS domain III; TIGRFAM: DNA mismatch repair protein MutS DNA sequence : GTGTCGGATTTAACACCATTGATGCAGCAGTATTTTTCAATAAAAGATAATTATCAAGAAGAGATTTTATTCTTTAGATT AGGTGATTTTTATGAGATGTTTGCTAAGGATGCTCAAATAGCAGCAAGAGAATTAGAATTGACCCTCACTGCTCGCAACA AAGGAAGTGGAGAAGAAACTCCAATGGCTGGAGTACCTTGTAAATCTGCTGAATCCTATATAGCTCAATTAATTGAGATG GGGTATAAGGTAGCAATTTGTGAACAGGTAGAAGACCCTAAGGCAACAAGTGGATTAGTAAAAAGAGAGGTAGTAAGGGT TGTGACGCCAGGTACAGTGGTTAATAATGACTTATTAGAGGATAAGGATAATAATTATTTAGCTGCTATAATAGGAAATC AGGATGGTTTTGGTTTCGCTGTAGTTGATGTTTCTACAGGTGAATTTGTGACTACTCAATTAGACGGGCCAACCCAAATA AATAAAGTAATTGATGAACTATCACGGATTAATCCAGCAGAAATATTATTAGATAATAAAGTAGAAGAAACGGAAGAAAT TATAGAATTTATTGATAATCAGTTAAATCCTATTTTATCTAAGACTAAAGAAGGCTTTACAACCAAAGAAGCTTATAGAT TATTAACTGATCAATTTGATGTAGTTAATTTAGAAGGATTTGGTTGTGAAGAGTTACCGTTAGCTATCCAGGCTGCTGGA GCAATCTTAGATTTTTTAGTTGAAACGCAAAAGAGAAGTTTAAATCATATTAATCAATTAGCAACTTATTCAACGACTGA TTATATGGTTTTAGATGCTAATACACGCAGAAATTTAGAACTAACTCAAACAATGCGTGATAAAAGTAAACGAGGCAGTC TATTATGGGTCCTAGATCAAACAGTAACAGCTATGGGAGGACGAAAGCTAAAAAAGTGGGTTGAACAACCCCTATTAGAA TTAGACAGGATTGAATACCGTCTCGATGCGGTTGAAGAAATTACCAAGAATATTTTTGCTAAAGAAGAGCTTAAAGAATT ATTAACAGAAGTATATGATATTGAGCGATTATTAGGTAAGATTATTTATGGGTCTGCTAATGCTCGTGATTTGATATCTT TAAAAAGCTCTTTACATATTTTACCTGAGGTTAAAGAGGTTTTAGACCAATTTAAGACGCCTAAATTAAAAAAGTTACAA GATAATTTAGATAAACTAGAAGATGTAGCTTGCTTAATTGAAAATTCTATTAAAGAAGACCCACCAACTACTTTAACGGA AGGAAGTATTATTAAAAAAGGATATGATAATCAGTTAGATGAATTATTAGAGGCTATGGAAAATGGTAAGCAATGGATTA TAGATTTACAAAAGCAAGAGCGAGAAAGAACCGGAATTAGCTCTTTAAAAGTAGGTCATAATAAAGTCCATGGTTATTAT ATTGAGGTAACTAAAGCTAATTTAGATGCTGTACCTGAGGATTACGTTAGAAAACAAACTTTAAGTAACAGTGAACGTTA TATTACTCCTGAATTAAAGGATAAAGAATCAGTAATTTTAGGGGCTCAGGAGAATAGTAAGGAATTAGAGTATAAATTGT TTGTTGAAATTAGAGATAAAGTAGCTCAAGAGACAGAAAGAATTCAAAAATCTGCCACTATATTAGCCCAATTAGATGCT TTATTATCTTTAGCTGAAGTAGCCTTAAATAATGATTATACTAAACCGCAATTAAATACTGATGATCAAATTGATATTGA GGCTGGTCGTCATCCTGTAGTAGAAGAGATGATGGAGGAAGAAGTTTTTGTACCGAATGATACTTATCTTGATCAGCAAA GTGATCGGTTTGGAATTATTACTGGTCCTAATATGTCAGGAAAATCAACTTATATGCGCCAAGTAGCTTTGATTGTTTTA TTGGCCCAGATAGGTAGTTTTGTACCAGCAGATAAAGCAAAGTTAAGTATTGTAGACCGGATTTTTACTCGAGTAGGAGC TTCTGATGATTTAACTACAGGACAGAGTACATTTATGGTGGAGATGAATGAAGTAGCAAATATTTTAAATAATGCTACTG CTAATAGCTTAATTATTTTAGATGAAGTAGGTCGTGGGACAAGTACTTATGATGGCTTAAGTATTGCTTGGGCCGTAACT GAATATATTTCTAATCCAGAAAAGATTGGGGCCAAGTCTTTATTTGCCACCCACTATCATGAATTAACTGAACTAGAGGA GAGACTGCCTGGGGTTAGAAATTATAATGTAGCTGTTAAAGAAGAAGGTGATGATGTGGTCTTTTTACATAAGATTATCC CAGGAGAAGCCAACCAAAGTTATGGGATTGAAGTAGCCAAATTAGCAGGAGTACCAAGTGAAGTAACTAATCGCTCCAAA GAGATTTTAGACTGGTTAGAAGAGGAAGAAGACAAGAAGGTTACAGAAGATACAAACCAATCGCAAAAGAAAGAAAACCA GATTAAAGAAGAAGCAGGACAATTGGCCCTATTCCAAGGCCAGACTAGTGAGGTAGTCCAAAAGTTAAGTAAATTAGATA TTATGTCTTTAACTCCTTTAGAAGCAATGAATAAACTACATCAATTACAACAAAAGGCCCAAGAAGAGGTTAATTGA Protein sequence : MSDLTPLMQQYFSIKDNYQEEILFFRLGDFYEMFAKDAQIAARELELTLTARNKGSGEETPMAGVPCKSAESYIAQLIEM GYKVAICEQVEDPKATSGLVKREVVRVVTPGTVVNNDLLEDKDNNYLAAIIGNQDGFGFAVVDVSTGEFVTTQLDGPTQI NKVIDELSRINPAEILLDNKVEETEEIIEFIDNQLNPILSKTKEGFTTKEAYRLLTDQFDVVNLEGFGCEELPLAIQAAG AILDFLVETQKRSLNHINQLATYSTTDYMVLDANTRRNLELTQTMRDKSKRGSLLWVLDQTVTAMGGRKLKKWVEQPLLE LDRIEYRLDAVEEITKNIFAKEELKELLTEVYDIERLLGKIIYGSANARDLISLKSSLHILPEVKEVLDQFKTPKLKKLQ DNLDKLEDVACLIENSIKEDPPTTLTEGSIIKKGYDNQLDELLEAMENGKQWIIDLQKQERERTGISSLKVGHNKVHGYY IEVTKANLDAVPEDYVRKQTLSNSERYITPELKDKESVILGAQENSKELEYKLFVEIRDKVAQETERIQKSATILAQLDA LLSLAEVALNNDYTKPQLNTDDQIDIEAGRHPVVEEMMEEEVFVPNDTYLDQQSDRFGIITGPNMSGKSTYMRQVALIVL LAQIGSFVPADKAKLSIVDRIFTRVGASDDLTTGQSTFMVEMNEVANILNNATANSLIILDEVGRGTSTYDGLSIAWAVT EYISNPEKIGAKSLFATHYHELTELEERLPGVRNYNVAVKEEGDDVVFLHKIIPGEANQSYGIEVAKLAGVPSEVTNRSK EILDWLEEEEDKKVTEDTNQSQKKENQIKEEAGQLALFQGQTSEVVQKLSKLDIMSLTPLEAMNKLHQLQQKAQEEVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | AAA80578.1 | DNA mismatch repair protein | Virulence | SPI-1 | Protein | 7e-133 | 41 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| Halha_0964 | YP_007315018.1 | DNA mismatch repair protein MutS | VFG0562 | Protein | 5e-144 | 41 |
