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Name : Halha_0427 (Halha_0427) Accession : YP_007314513.1 Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150 Genome accession: NC_019978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 440869 - 443439 bp Length : 2571 bp Strand : + Note : PFAM: 5'-3' exonuclease, C-terminal SAM fold; 5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain; DNA polymerase family A; TIGRFAM: DNA polymerase I DNA sequence : ATGTCGAAACAGAGATTATATTTATTAGATGGGAATAGTTTAGTTTATAGAGCTTTTTATGCTTTACCAGATACACTAAC TACATCAGATGGGACAGTTACTAATGCAGTATTTGGTTTTACTAAAATGTTACTTAGTTTAATCGATAATCAAGCGCCTG ATTTAATTGGCATTGCTTTTGATGCCCAAGGGGCTACATTTAGACACGAGGAGTATGAAGAATATAAGGCTAATCGAAAA GAAACTCCTGATAAGTTAAAGCATCAGTTTGACTTAGTAAAAGAGGTGGTAGATGCTTTAGAGATTCCTAGATTTGAGGT AGAAAGTTTAGAGGCAGATGATTTAATTGGAACTCTAGCAATAGAAGCAGAGAAAGAAGATTATAAAGTTACGATTGTAA CTGGAGACCGTGATGCTTTACAGTTAATTAGTGATAATATCGAGATAATGTATACCAAGCGAGGTATCAGTAATATAATT AGATATGATGTGGACAAGTTTAGAGAAGATTATGAATTGGACCCAGAACAATTAGTAGATAAAAAAGCATTGATGGGGGA TAAGTCAGATAATATTCCTGGTGTTGATGGGATTGGAGATAAGACTTCTACTAAATTATTAAAAGAATTTGGTGGGTTAG AAGAAGTATTAGATAATATTGACCAAGTTGGTGGCAAAAAAAGAAAACAAATGCTAAGAGAGCAAGGAGCTAGGGCCAAG CTTAGCAAAAGGCTAGCTACTATTAAGGTTGATTGTCCACTAGAGATCAATTTTGATAAGTTAGTTTTAGCTGATTTAGA GGATATTGACCAAGCTTATGATTTATTTAATAGGTTAGAATTTACTAGTTTGATTTCTTATTTAGGAGGGCATAAAGGTT TAGAAAAAGTAGACTACCAAGAAGTTAATGAGTTAGAAGAATTACAAAGCCTTAAGCTTCCTTCCACAATAGCTATTAAA CTTAATTTAAACGGGCCAAGGTTAAAACAAACGCTAGAGGGAATAATAATAGCTACTCTTGAGCAAGTATATTATATTAA TTTAGCTGAAAAAGAGTTAATCACCTACTTAGAAGATACTTTAGTAGATAAGAAATTATTAATGTATCAGGCTAAAGGGC AATTGAGGTATTTATTGCAGCAGGGAATCGAGGAGTTTAATTTATCTTTTGATCCACTATTGGCTGCTTATTTATTACAA CCTAGTGAAGATGCAATTGATTTAGCAGGAATAATAGAAAAGTATCTACAACAGGCTGAACCAGAAGTAACAGGGATAAA GCTATTAGCAGTTAGAACAAATATTTTGTTTAAGTTACAAATTAAATTAGAGGAAGAACTAAAAGAAAATGATTTATTAG AGTTGTTTCAAGATATGGAACTACCTTTGGTTAGAATCTTAGCTCAATTAGAATTAAATGGTATTAAGGTTAGCCAAGAG CAATTAGAAAATTTATTTACTGAGTTATCTACAAAAATATCTAAACTAAAGAAAGAAATTTGTAATTTAGCAGGAGAAGA ATTCAATATTAATTCTCCTCAGCAGTTAGGAACCATTTTATTTGATAAATTAGACTTACCTGTAATTAAAAAAACTAGCA CCGGTAACTATTCTACTAGTGCTAAAGTATTAGAAAAGTTAGAAGGAAATCATGAGATTATTCCATTAATTTCTGAATAT CGTTCTTTAACTAAATTAAAGTCTACTTATGTTGATCCTTTAGAGAGTTATATTAATGAGAAAACAGGCCGGATACATAC TAACTTTAAGCAACAAGTTACAGCGACAGGTAGATTAAGTAGTAGAGAACCTAATCTGCAAAATATTCCGATTAGAACAG AAGAAGGACGTAAAATCAGACAGGTATTTGTGGCCCAAGAAGGATATAAGTTAGTAGCAGCAGATTACTCTCAGGTTGAA TTGAGGGTCTTGGCCCATATTTCTCAGGACGAAAGATTAAAGAAGGCTTATCAACAAGGGCTTGATATTCATACTCAAAC TGCTAAAGAGCTGTTTGGTATCTCCACAAAACAGACACGCCGGAAAGCTAAAGCAGTTAACTTTGGGATAGCTTATGGAA TTAGTGATTGGGGATTAGCTGATCGGCTTAAAATTAACAAACGAGAAGCAAAAGAATATATTGATCTTTATTTTAGTCGT TATCCAAAAGTTAAAGAGTATATTGATGATAAGATTAGACAAGCTAAAAAACAAGGCTATGTAACAACTATTTTTGATCG CAAGAGATATTTGCCAGAAATAAATAGTAGAAATTATCATAAACGTCAATTTGCTGAAAGAACAGCTATTAATACTCCTA TTCAAGGGAGTGCTGCAGATATTATGAAGTTAGCTATGCTTGATGTAGCTAAAGCTTTAGAAAAAGAAGAGTTAGCTAGT GATATTTTATTACAGGTTCACGATGAATTAGTGTTAGAGGTTCCAAAGGATGAAGTTAAGAAGGTTGCTAAATTAGTAAA GAAAAGAATGGAAGATACAGTTAATTTAGATGTACCTTTAGAGGTTGATGTTAAGGTAGGAGATAATTGGAATGAAATGG AAGAGTATTAA Protein sequence : MSKQRLYLLDGNSLVYRAFYALPDTLTTSDGTVTNAVFGFTKMLLSLIDNQAPDLIGIAFDAQGATFRHEEYEEYKANRK ETPDKLKHQFDLVKEVVDALEIPRFEVESLEADDLIGTLAIEAEKEDYKVTIVTGDRDALQLISDNIEIMYTKRGISNII RYDVDKFREDYELDPEQLVDKKALMGDKSDNIPGVDGIGDKTSTKLLKEFGGLEEVLDNIDQVGGKKRKQMLREQGARAK LSKRLATIKVDCPLEINFDKLVLADLEDIDQAYDLFNRLEFTSLISYLGGHKGLEKVDYQEVNELEELQSLKLPSTIAIK LNLNGPRLKQTLEGIIIATLEQVYYINLAEKELITYLEDTLVDKKLLMYQAKGQLRYLLQQGIEEFNLSFDPLLAAYLLQ PSEDAIDLAGIIEKYLQQAEPEVTGIKLLAVRTNILFKLQIKLEEELKENDLLELFQDMELPLVRILAQLELNGIKVSQE QLENLFTELSTKISKLKKEICNLAGEEFNINSPQQLGTILFDKLDLPVIKKTSTGNYSTSAKVLEKLEGNHEIIPLISEY RSLTKLKSTYVDPLESYINEKTGRIHTNFKQQVTATGRLSSREPNLQNIPIRTEEGRKIRQVFVAQEGYKLVAADYSQVE LRVLAHISQDERLKKAYQQGLDIHTQTAKELFGISTKQTRRKAKAVNFGIAYGISDWGLADRLKINKREAKEYIDLYFSR YPKVKEYIDDKIRQAKKQGYVTTIFDRKRYLPEINSRNYHKRQFAERTAINTPIQGSAADIMKLAMLDVAKALEKEELAS DILLQVHDELVLEVPKDEVKKVAKLVKKRMEDTVNLDVPLEVDVKVGDNWNEMEEY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 1e-151 | 43 |
