Gene Information

Name : Halha_2145 (Halha_2145)
Accession : YP_007316121.1
Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150
Genome accession: NC_019978
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2145512 - 2146777 bp
Length : 1266 bp
Strand : -
Note : PFAM: PTS system sugar-specific permease component

DNA sequence :
ATGGGATTTTTAAATTTTTTAGTTAACGATGTATTAAGTGAACCAGCTGTTTTGGTAGGATTAATGGCTTGCATTGGTTT
GATAGCTTCTAAGAAACATTTTTCTGAAATTATGTCCGGGACGTTAAAGAGTATTATTGGTTTTGTTATTTTGGGAGCAG
GAGCAGGGGTTTTAATTGAAAGCTTAAATAACTTCGGGCCAATAATTAGAGAAGCCTTCAATATTCATGGTGTGATTCCA
ACTAATGAGGCTATAGTAGCTATGGCTCAGAAGACATTAGGAAAAGAAACAGCTTTGATTATGGGCTTTGGTTTTCTAGC
TAATTTAGCTTATGCTCGTTTTACTCCTTTAAAGTATGTATTTTTAACAGGACATCATACTTTCTTTATGGCCGCTTTAT
TGGCAGCAGTATTAGGAACTGCAGGTTTAACAGGAGCTCCATTAGTAATTGTAGGGTCAACAATATTAGGCTTTTTAATG
GTCTTAATGCCTGCATTAGCAGATATATATATGAAAGATGTAACTGGTAGTGATGATATCGCTCTAGGACACTTTGGAAC
AACAGGTTATATTACAGCTGGCTTTATTGGTAGTTTAGTAGGAGACCCAGAAGATACTACAGAAGATATTGAAGTTCCAA
AGTCATTAGGTTTTTTAAAAGAATCATTATTATCTACCGCTTTAACTATGATAGTTATCTTTTTAATTATTGTTTTTAAA
GCCGGTCCAGAAATTGTTAGCGAATATGCAGGAGATCAGAGCTTGTTTATGTTTGCTGTAATGCAAGGGATTACGTTTGC
TGCAGGAGTCAGTATTATCATGTCAGGTGTAAGAATGATTTTAGGAGAAATTGTTCCAGCCTTTGAAGGAATCGGTGAAA
GAGTAGTTCCAGATGCTAAACCAGCTTTAGATTGTCCAGTTACCTTTAACTTTGCTCCAACAGCTGTAACTATTGGTTTC
CTATTTAGTTTCCTAGGTGGAATTGTAGGAATGTTTTTACTAGGACCAATAGGATTATCTATAATCATTCCAGGATTAGT
ACCACATTTCTTTACTGGAGCTACTGCAGGAGTATTTGGTAATGCTACTGGAGGTAAAAAAGGAGCCATTTTTGGTTCTT
TTGCTAATGGATTATTAATAACTTTCTTACCTGCTTTATTACTTCCGGTGTTAGGAAAGTTAGGTTTTGCTAATACTACT
TTTGGGGATGCAGATTTTGGAGTTGTAGGTATTATTATTGGAACAATAGCTAAATTAATTAATTAG

Protein sequence :
MGFLNFLVNDVLSEPAVLVGLMACIGLIASKKHFSEIMSGTLKSIIGFVILGAGAGVLIESLNNFGPIIREAFNIHGVIP
TNEAIVAMAQKTLGKETALIMGFGFLANLAYARFTPLKYVFLTGHHTFFMAALLAAVLGTAGLTGAPLVIVGSTILGFLM
VLMPALADIYMKDVTGSDDIALGHFGTTGYITAGFIGSLVGDPEDTTEDIEVPKSLGFLKESLLSTALTMIVIFLIIVFK
AGPEIVSEYAGDQSLFMFAVMQGITFAAGVSIIMSGVRMILGEIVPAFEGIGERVVPDAKPALDCPVTFNFAPTAVTIGF
LFSFLGGIVGMFLLGPIGLSIIIPGLVPHFFTGATAGVFGNATGGKKGAIFGSFANGLLITFLPALLLPVLGKLGFANTT
FGDADFGVVGIIIGTIAKLIN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 1e-96 60
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 7e-97 60
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 7e-97 60