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Name : Halha_1929 (Halha_1929) Accession : YP_007315933.1 Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150 Genome accession: NC_019978 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ABC-type bacteriocin transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1953651 - 1955873 bp Length : 2223 bp Strand : - Note : PFAM: ABC transporter; ABC transporter transmembrane region; Peptidase C39 family; TIGRFAM: ABC-type bacteriocin transporter; type I secretion system ABC transporter, HlyB family DNA sequence : ATGAAGAAAATATTGAAACTAATAATTAGAAAAATCAAGCGGTTATTCAAATCCTATTACTGCATTAAACAACACGACAT AACAGATTGTGCTGCAGCCTGTTTGGCTACAATTTCTAAACACTATGATTTGGAAATACCAATTACTCAAATAAGAGAAA TTGCTGGAACGGATAAGAGAGGTACCAATGCTCTAGGAGTAATCAAGGCAGCTAAAAAGCTTGGTTTTGAAGCAAAGGGA GTAAAAGGCCAATCAGATGATTTAACTTCTGAAGTACCTTTGCCTGCTATAGCTCATGTGGTAAAAGATAATTTAATGCA TTATGTGGTAGTTTATGAAATAAATGAAGATGAAATAGTAGTTGCTGATCCAGCCGAAGGAATGGTCTATTATGACCCAG AAGATTTTTATGAAATTTGGACAGGAGTATTAATTTTAATTACTCCTACTGAAGATTTTGAAACGGGCGATGAAAAGACT GGCTTTTTTGAACGTTTTTTAGGTTTAATAACTCCGCATAAAGGGTTATTAGTTAAGATATTTTTTGCTTCTATGCTATA TACTTTATTGGGGATAGCAGGTTCATTTTACTTTAAGTATTTGATTGATACTATTTTAGCTGATGGATTGGTTAAAACTT TACATATTATTTCTATTGGGATAGTCTTATTAACTCTCTTTAAAATATTAATGAACTTTTTTAGAAAGCATTTACTTCTT TATTTAAGCCAGAAAATAGATATTTCTTTGATTCTTAATTATTATCAACATGTATTAGAACTGCCAATGTCTTTTTTTGA CTCTCGAAAAGTAGGAGAGATTTTATCTAGATTACGGGATACAGCGAAAATTAGACAGGCTATTTCTGGGGCTACTATTA CAGTAATGATTGATAGTTTATTAGTTGCTGGAGGGGGAATTGTTTTATATATTCAAAGTTCTACTCTGTTTTGGGTTGCA GCTGTAATTATTCCTCTTTATGTATTAATTGTTTTGGGCTTTAGTAAACCTTTACGGAGGATTCATCGTAAAGAAATGGA AAATTCAGCTAATATGCAATCTTATCTGATAGAATCAGTTTCTGGAGTAGCTACTATAAAGGCATTTAATGGAGAAGAAC AGGCTAATTTAGAGACTGAAAGTAGGTTTATCAAGTATATTAAATCTATATTCAAAGCTACTTTTATGCGTAATATTCAG GGGTCATTGCAAAAATTGCTTACCTCAGTTAGTGAATTTGTAATTTTGTGGGTTGGTGGATTGAAGGTAATTAATGGAGT GATTAGTGTAGGTCAGTTAATTACTTTTAATGCATTATTAGCCTACTTTTATAATCCAATTCAGAGATTAATTAATTTGC AGCCTAAATTAATGGAGGCTTATGTAGCAGCTGATAGATTAGGAGAAATCTTTGATTTAGAACAAGAAAAACAAAATGAA TCTAAGAAGATACAACTAGATAAATTGGAGGGTAAAATTGAGGTGAAGGATGTTAATTTCCGTTATGGAACAAGAAAATT AGCTTTAGAAAATATCAACTTAGATATTGAAGCAGGTGAAAAAATTGCTTTAGTAGGAGAAAGTGGTTCAGGAAAGACTA CTTTAGCTAAATTAATATTAAAGTATTATCTCCCAGATAATGGAGAAATTTTATTAGATGGCTATAATATAAAAGATATT AACTTAGAAATCTTAAGACAAAAGATTGGTTATGTTCCTCAAGATGTATTTTTATTTAGTGGAACTTTGCGAGAAAATAT CTCTTTTGGTTTTCAAGATATAGCTATGAAGGAGATAATAAATGCTGCTAGGAAGTCTCAAATTCATCAATTTATTAATC AATTACCGTTAAGGTATAACACAATGGTAGGAGAGAGAGGATCAAATTTATCAGGAGGTCAAAAGCAGAGGATAGCTATT GCGAGAGCTATTCTTAAAGATCCAGATCTGCTTATTTTAGATGAGGCGACGAGTAATCTTGATACAGCAACTGAAAAAGC AATTCATAATACTATTGAAGATATAAGCCAAGATATTACAACAATTATAATTGCCCATCGATTAAGCACTATCATGCAGT GTGATAAAATTGTAGTTTTAGATGAGGGAGAGATTATTGAATTAGGAACTCATCAGCAGTTAATTCAAAAACAAGGAAAA TACTATCAGTTATGGCAGGGCCAAACTCTGGAAAATAATGAGTTAGAGGTAGATGCATCATGA Protein sequence : MKKILKLIIRKIKRLFKSYYCIKQHDITDCAAACLATISKHYDLEIPITQIREIAGTDKRGTNALGVIKAAKKLGFEAKG VKGQSDDLTSEVPLPAIAHVVKDNLMHYVVVYEINEDEIVVADPAEGMVYYDPEDFYEIWTGVLILITPTEDFETGDEKT GFFERFLGLITPHKGLLVKIFFASMLYTLLGIAGSFYFKYLIDTILADGLVKTLHIISIGIVLLTLFKILMNFFRKHLLL YLSQKIDISLILNYYQHVLELPMSFFDSRKVGEILSRLRDTAKIRQAISGATITVMIDSLLVAGGGIVLYIQSSTLFWVA AVIIPLYVLIVLGFSKPLRRIHRKEMENSANMQSYLIESVSGVATIKAFNGEEQANLETESRFIKYIKSIFKATFMRNIQ GSLQKLLTSVSEFVILWVGGLKVINGVISVGQLITFNALLAYFYNPIQRLINLQPKLMEAYVAADRLGEIFDLEQEKQNE SKKIQLDKLEGKIEVKDVNFRYGTRKLALENINLDIEAGEKIALVGESGSGKTTLAKLILKYYLPDNGEILLDGYNIKDI NLEILRQKIGYVPQDVFLFSGTLRENISFGFQDIAMKEIINAARKSQIHQFINQLPLRYNTMVGERGSNLSGGQKQRIAI ARAILKDPDLLILDEATSNLDTATEKAIHNTIEDISQDITTIIIAHRLSTIMQCDKIVVLDEGEIIELGTHQQLIQKQGK YYQLWQGQTLENNELEVDAS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 57 |
| CPR_0658 | YP_697985.1 | lactococcin g processing and transport ATP-binding protein | Virulence | Not named | Protein | 8e-138 | 42 |
