|
Name : Halha_1913 (Halha_1913) Accession : YP_007315917.1 Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150 Genome accession: NC_019978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1936052 - 1938529 bp Length : 2478 bp Strand : - Note : PFAM: tRNA synthetases class I (I, L, M and V); Anticodon-binding domain; TIGRFAM: leucyl-tRNA synthetase, eubacterial and mitochondrial family DNA sequence : ATGGAAGAAAGATATAATTTTAGTAAGGTGGAAAAAAAGTGGCAACAACACTGGGAAGAAGAAGGAACTTATCAAACAGA GATCAACCAAAATCAAGATGAATACTATGTATTAGAAATGTTTCCTTATCCATCAGGAAATTTACATATGGGACATGTTA GAAATTATTCTTTAGGTGATGTCTTTGCTCGTTTTAGACGAATGCAAGGGTATAATGTACTACATCCTATGGGGTGGGAT GCATTTGGTTTACCTGCAGAAAATGCTGCAATCAAACGTGATATTCATCCAGCTGATTGGACTGAGGATAATATCTCTAA TATGAAAAAGCAATTTAAGATGTTAGGTTTAAGTTATGATTGGAAGAGAGAGGTAGCTACCTGTAAGCCAGATTATTATA AATGGACTCAATGGCTATTTCTTGAATTATATAAAGAAGGATTAGCTTATAAGAAAAAGGCTCAAGTCAATTGGTGTCCA GACTGTCAGACTGTATTAGCTAATGAACAGGTAATAGATGGTGAATGTGAACGTTGTGATAGTGAAGTGATTGATGATAA GGAATTAGAGCAATGGTTCTTTAAAATCACAGATTATGCAGATCAATTATTAGCGGATCATGATTTATTAGATGGCTGGC CAGAGAGGGTTAAGACAATGCAACAAAATTGGATTGGACGAAGTGAAGGAGCTAAGATTAAATTCAAGATTAAAGAAAGT AATCATGAATTAGAAGTCTTTACTACACGTCCAGACACTATTTATGGGGCAACTTATATGGTTTTAGCTCCAGAACATCC TTTAGTAGATGAATTAATAACTGGTAAAGAGAATGAAACAAAAATTAGAGACTTCATTGCAGAAGTTAAAGATCAAGATG AAGAAGAAAGAACTGGAACTGATGCTAAAAAATTAGGAATCGATACTGGAATCAAAGCTATTAACCCAGTAACTAAAGAA GAAATCCCAGTAATGATTGCTAATTATGTATTAATGGATTATGGTACTGGAGCAATTATGGCTGTACCAGCTCATGATGA ACGTGATTTTGAATTTGCTAAAGAATATGATTTACCAATTAGGGTAGTTATTCAACCAGATGATGAAGAATTAACTGCAG ATAAATTAGAAGAAGCTTATACAGAGGATGGTTTAGTAACTAATTCCAAAATGCTTAACGGGTTAAGTATTGATGATGCT TTTGATAAAATTGTAGATTATTTAGAGGAAGAGGGTATAGGTAATAAAGATGTTAATTATCGTCTGCGTGATTGGTTAAT TTCCCGACAACGGTATTGGGGAACACCAATTCCTGTAATTCATTGTAATAATTGTGGTACAGTACCCGTTCCAGAAGAGG ATCTACCTGTTAAGTTACCAACAAATGTAGAATTTACAGGTGAGGGCCAATCTCCACTAGCGAATGTAGATGAATTTGTG CAGACTACTTGCCCTGAGTGTGGACAAGCGGCTAAGCGAGAAGTGGACACTATGGATACATTTGTAGATTCTTCTTGGTA TTATTTACGCTATACCAGTCCAGAATTGACTACTAAGGTATTTGATCAAGAAAGAGCTAATTATTGGATGAATGTTGATC AATATATTGGTGGAATTGAGCATGCTATTTTACATTTATTATACGCTCGATTCTTTATGAAGTTTTTAAATGATCAGGGG TTAGTTGAAGCTAAAGAACCATTCGCAAGTTTGCTAACACAAGGAATGGTATTATTAGATGGGGCCAAAATGTCTAAATC TAAAGGAAATATTGTTGATCCACTAGAGATTTTAGATGAATATGGCGCTGATGTTGCGCGATTATTTATTTTATTTGCAG CTCCTCCAGAACGTGACCTAGATTGGAATGATGAAGGAGTAGAAGGAGCTCAACGTTTCTTGAATCGAGTTTGGAGATTA GTAGCTAAGAATATAGATCAGATTAAAGAAGTAACAACTGAATTTGAAATTAATCATGATTTAGATAAAAAGTTACATCG TCAATTACATGTAGCAATTAGAGATATAACAAGTGATATAGAAGAAAGAGGACAATTAAATACAGCAATTAGTTCTATTA TGGAATTGGTTAATGCTGTTTATAAGTACTTAAATGAGGCTAAACAAATAAATAGTCAATTACTAAAAGTAGTAGTTGAA GATATTGTTTTACTATTAGCTCCTTTTGCCCCCCATATGACTGAAGAGTTATGGACTAAATTAGGATATGAAGATAGTAT TCATAATCAAGAATGGCCTAATTTTGATCAAGAAGCCACTAAAAAGGATGAAATTGAAATAGTAGTTCAGGTTAATGGTA AAGTTAGGGATAAAGTTAAAGTAGCTGCTGATATTGCAGAAGAAGAACTTAAAGAAATAATTAAAGAACAAGAAAATGTA CAACGTCATATTGAAGGTAAAGAGATTATTAAAGAGATAGTTGTTCCTAAAAAGTTAGTTAATATAGTTGCTCAATAA Protein sequence : MEERYNFSKVEKKWQQHWEEEGTYQTEINQNQDEYYVLEMFPYPSGNLHMGHVRNYSLGDVFARFRRMQGYNVLHPMGWD AFGLPAENAAIKRDIHPADWTEDNISNMKKQFKMLGLSYDWKREVATCKPDYYKWTQWLFLELYKEGLAYKKKAQVNWCP DCQTVLANEQVIDGECERCDSEVIDDKELEQWFFKITDYADQLLADHDLLDGWPERVKTMQQNWIGRSEGAKIKFKIKES NHELEVFTTRPDTIYGATYMVLAPEHPLVDELITGKENETKIRDFIAEVKDQDEEERTGTDAKKLGIDTGIKAINPVTKE EIPVMIANYVLMDYGTGAIMAVPAHDERDFEFAKEYDLPIRVVIQPDDEELTADKLEEAYTEDGLVTNSKMLNGLSIDDA FDKIVDYLEEEGIGNKDVNYRLRDWLISRQRYWGTPIPVIHCNNCGTVPVPEEDLPVKLPTNVEFTGEGQSPLANVDEFV QTTCPECGQAAKREVDTMDTFVDSSWYYLRYTSPELTTKVFDQERANYWMNVDQYIGGIEHAILHLLYARFFMKFLNDQG LVEAKEPFASLLTQGMVLLDGAKMSKSKGNIVDPLEILDEYGADVARLFILFAAPPERDLDWNDEGVEGAQRFLNRVWRL VAKNIDQIKEVTTEFEINHDLDKKLHRQLHVAIRDITSDIEERGQLNTAISSIMELVNAVYKYLNEAKQINSQLLKVVVE DIVLLLAPFAPHMTEELWTKLGYEDSIHNQEWPNFDQEATKKDEIEIVVQVNGKVRDKVKVAADIAEEELKEIIKEQENV QRHIEGKEIIKEIVVPKKLVNIVAQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 2e-162 | 44 |
